RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-208ENST00000476423 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
SZRD1-208ENST00000476423 ITGB4P16144 1822 aa11.12□□□□□ -0.63
SZRD1-208ENST00000476423 H0YIN7 160 aa11.12□□□□□ -0.63
SZRD1-208ENST00000476423 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa11.12□□□□□ -0.63
SZRD1-208ENST00000476423 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa11.12□□□□□ -0.63
SZRD1-208ENST00000476423 LTBP3Q9NS15 1303 aa11.11□□□□□ -0.63
SZRD1-208ENST00000476423 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa11.1□□□□□ -0.63
SZRD1-208ENST00000476423 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
SZRD1-208ENST00000476423 TM4SF1P30408 202 aa11.1□□□□□ -0.63
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SZRD1-208ENST00000476423 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa11.08□□□□□ -0.64
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SZRD1-208ENST00000476423 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
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SZRD1-208ENST00000476423 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
SZRD1-208ENST00000476423 NARFQ9UHQ1 456 aa10.96□□□□□ -0.65
SZRD1-208ENST00000476423 HDAC9Q9UKV0 1011 aa10.96□□□□□ -0.65
SZRD1-208ENST00000476423 FZD9O00144 591 aa10.95□□□□□ -0.66
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