RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474293.2

SOGA3-206, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SOGA3, Length 772 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-206ENST00000474293 ERFEQ4G0M1 354 aa20.28■□□□□ 0.84
SOGA3-206ENST00000474293 USPL1Q5W0Q7 1092 aa20.28■□□□□ 0.84
SOGA3-206ENST00000474293 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SOGA3-206ENST00000474293 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SOGA3-206ENST00000474293 CABP4P57796 275 aa20.27■□□□□ 0.84
SOGA3-206ENST00000474293 C2CD5Q86YS7 1000 aa20.27■□□□□ 0.84
SOGA3-206ENST00000474293 ZPR1O75312 459 aa20.26■□□□□ 0.83
SOGA3-206ENST00000474293 DDNO94850 711 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SOGA3-206ENST00000474293 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SOGA3-206ENST00000474293 NFIXQ14938 502 aa20.25■□□□□ 0.83
SOGA3-206ENST00000474293 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SOGA3-206ENST00000474293 PASKQ96RG2 1323 aa20.25■□□□□ 0.83
SOGA3-206ENST00000474293 ZNF831Q5JPB2 1677 aa20.24■□□□□ 0.83
SOGA3-206ENST00000474293 TMEM88BA6NKF7 163 aa20.23■□□□□ 0.83
SOGA3-206ENST00000474293 WASHC2AQ641Q2 1341 aa20.23■□□□□ 0.83
SOGA3-206ENST00000474293 H0YIN7 160 aa20.22■□□□□ 0.83
SOGA3-206ENST00000474293 C21orf2O43822 256 aa20.22■□□□□ 0.83
SOGA3-206ENST00000474293 SERPINB2P05120 415 aa20.22■□□□□ 0.83
SOGA3-206ENST00000474293 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.22■□□□□ 0.83
SOGA3-206ENST00000474293 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SOGA3-206ENST00000474293 RGS19P49795 217 aa20.2■□□□□ 0.82
SOGA3-206ENST00000474293 LDHDQ86WU2 507 aa20.2■□□□□ 0.82
SOGA3-206ENST00000474293 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
SOGA3-206ENST00000474293 CARMIL3Q8ND23 1372 aa20.2■□□□□ 0.82
SOGA3-206ENST00000474293 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa20.19■□□□□ 0.82
SOGA3-206ENST00000474293 CFAP44Q96MT7 982 aa20.19■□□□□ 0.82
SOGA3-206ENST00000474293 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa20.19■□□□□ 0.82
SOGA3-206ENST00000474293 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SOGA3-206ENST00000474293 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SOGA3-206ENST00000474293 CARD14Q9BXL6 1004 aa20.18■□□□□ 0.82
SOGA3-206ENST00000474293 MTHFSP49914 203 aa20.17■□□□□ 0.82
SOGA3-206ENST00000474293 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SOGA3-206ENST00000474293 DEFB115Q30KQ5 88 aa20.17■□□□□ 0.82
SOGA3-206ENST00000474293 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SOGA3-206ENST00000474293 DNAJC10Q8IXB1 793 aa20.17■□□□□ 0.82
SOGA3-206ENST00000474293 KIF20BQ96Q89 1820 aa20.16■□□□□ 0.82
SOGA3-206ENST00000474293 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
SOGA3-206ENST00000474293 BICDL1Q6ZP65 573 aa20.16■□□□□ 0.82
SOGA3-206ENST00000474293 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
SOGA3-206ENST00000474293 BCL2L12Q9HB09 334 aa20.16■□□□□ 0.82
SOGA3-206ENST00000474293 CLEC11AQ9Y240 323 aa20.16■□□□□ 0.82
SOGA3-206ENST00000474293 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
SOGA3-206ENST00000474293 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SOGA3-206ENST00000474293 CCDC24Q8N4L8 307 aa20.15■□□□□ 0.82
SOGA3-206ENST00000474293 POLKQ9UBT6 870 aa20.15■□□□□ 0.82
SOGA3-206ENST00000474293 NARFQ9UHQ1 456 aa20.15■□□□□ 0.82
SOGA3-206ENST00000474293 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SOGA3-206ENST00000474293 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa20.15■□□□□ 0.82
SOGA3-206ENST00000474293 IQCA1LA6NCM1 817 aa20.14■□□□□ 0.81
SOGA3-206ENST00000474293 RASSF10A6NK89 507 aa20.14■□□□□ 0.81
SOGA3-206ENST00000474293 TAOK3Q9H2K8 898 aa20.14■□□□□ 0.81
SOGA3-206ENST00000474293 TJP1Q07157 1748 aa20.13■□□□□ 0.81
SOGA3-206ENST00000474293 SLC24A1O60721 1099 aa20.13■□□□□ 0.81
SOGA3-206ENST00000474293 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SOGA3-206ENST00000474293 DLEC1Q9Y238 1755 aa20.13■□□□□ 0.81
SOGA3-206ENST00000474293 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SOGA3-206ENST00000474293 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SOGA3-206ENST00000474293 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SOGA3-206ENST00000474293 TSKSQ9UJT2 592 aa20.11■□□□□ 0.81
SOGA3-206ENST00000474293 NRXN2Q9P2S2 1712 aa20.1■□□□□ 0.81
SOGA3-206ENST00000474293 COL15A1P39059 1388 aa20.1■□□□□ 0.81
SOGA3-206ENST00000474293 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SOGA3-206ENST00000474293 GRM1Q13255 1194 aa20.1■□□□□ 0.81
SOGA3-206ENST00000474293 C1orf141Q5JVX7 400 aa20.1■□□□□ 0.81
SOGA3-206ENST00000474293 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SOGA3-206ENST00000474293 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa20.1■□□□□ 0.81
SOGA3-206ENST00000474293 LTBP3Q9NS15 1303 aa20.09■□□□□ 0.81
SOGA3-206ENST00000474293 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SOGA3-206ENST00000474293 CNTROBQ8N137 903 aa20.09■□□□□ 0.81
SOGA3-206ENST00000474293 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SOGA3-206ENST00000474293 AMOTQ4VCS5 1084 aa20.08■□□□□ 0.81
SOGA3-206ENST00000474293 BEGAINQ9BUH8 593 aa20.08■□□□□ 0.81
SOGA3-206ENST00000474293 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa20.07■□□□□ 0.8
SOGA3-206ENST00000474293 PDE6BP35913 854 aa20.07■□□□□ 0.8
SOGA3-206ENST00000474293 HACL1Q9UJ83 578 aa20.07■□□□□ 0.8
SOGA3-206ENST00000474293 CANXP27824 592 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SOGA3-206ENST00000474293 EPHX2P34913 555 aa20.06■□□□□ 0.8
SOGA3-206ENST00000474293 BRIP1Q9BX63 1249 aa20.06■□□□□ 0.8
SOGA3-206ENST00000474293 ZNF541Q9H0D2 1346 aa20.05■□□□□ 0.8
SOGA3-206ENST00000474293 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SOGA3-206ENST00000474293 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SOGA3-206ENST00000474293 SLC39A6Q13433 755 aa20.05■□□□□ 0.8
SOGA3-206ENST00000474293 TBC1D9BQ66K14 1250 aa20.05■□□□□ 0.8
SOGA3-206ENST00000474293 AEBP1Q8IUX7 1158 aa20.05■□□□□ 0.8
SOGA3-206ENST00000474293 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
SOGA3-206ENST00000474293 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP20.04■□□□□ 0.8
SOGA3-206ENST00000474293 PRR5LQ6MZQ0 368 aa20.04■□□□□ 0.8
SOGA3-206ENST00000474293 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
SOGA3-206ENST00000474293 CAPNS2Q96L46 248 aa20.04■□□□□ 0.8
SOGA3-206ENST00000474293 MCOLN1Q9GZU1 580 aa20.04■□□□□ 0.8
SOGA3-206ENST00000474293 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa20.04■□□□□ 0.8
SOGA3-206ENST00000474293 CYP4F22Q6NT55 531 aa20.03■□□□□ 0.8
SOGA3-206ENST00000474293 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
SOGA3-206ENST00000474293 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.02■□□□□ 0.8
SOGA3-206ENST00000474293 CNKSR1Q969H4 720 aa20.02■□□□□ 0.8
SOGA3-206ENST00000474293 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa20.02■□□□□ 0.8
SOGA3-206ENST00000474293 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.01■□□□□ 0.79
SOGA3-206ENST00000474293 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
SOGA3-206ENST00000474293 LGR6Q9HBX8 967 aa20■□□□□ 0.79
SOGA3-206ENST00000474293 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms