RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468045.5

PREB-208, Transcript of prolactin regulatory element binding, humanhuman

TSL 2

Gene PREB, Length 3,057 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREB-208ENST00000468045 SPG7Q9UQ90 795 aa21.38■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 MYO5BQ9ULV0 1848 aa21.38■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.38■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 VGLL3A8MV65 326 aa21.37■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 KIF20AO95235 890 aa21.37■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 CTIFO43310 598 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 CCDC186Q7Z3E2 898 aa21.36■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 TTC14Q96N46 770 aa21.36■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 ASXL2Q76L83 1435 aa21.35■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 GJB2P29033 226 aa21.35■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 CCT4P50991 539 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 CKAP2LQ8IYA6 745 aa21.35■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 FERMT3Q86UX7 667 aa21.35■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.35■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 DRC7Q8IY82 874 aa21.34■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa21.34■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 ZBTB22O15209 634 aa21.34■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 CASTP20810 708 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 ATP8B2P98198 1209 aa21.33■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 NECAB1Q8N987 351 aa21.33■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 MTMR6Q9Y217 621 aa21.33■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 LIG1P18858 919 aa21.33■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa21.32■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.32■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 STAP2Q9UGK3 403 aa21.32■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 CCDC192P0DO97 292 aa21.31■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 ADCK5Q3MIX3 580 aa21.31■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 CPS1P31327 1500 aa21.31■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 ZNF592Q92610 1267 aa21.31■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 SLC52A1Q9NWF4 448 aa21.3■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.3■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 RAD50Q92878 1312 aa21.3■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 SGSM2O43147 1006 aa21.3■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 SSH2Q76I76 1423 aa21.3■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa21.3■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 TTC6Q86TZ1 520 aa21.3■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP21.3■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 V9GYY5 206 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 TNNT1P13805 278 aa21.29■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 CTNNA3Q9UI47 895 aa21.29■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 TYRO3Q06418 890 aa21.29■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 FLIIQ13045 1269 aa21.29■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 PLCD3Q8N3E9 789 aa21.29■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 IL17RAQ96F46 866 aa21.29■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 NUTM2FA1L443 756 aa21.28■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 SURF6O75683 361 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 ST3GAL1Q11201 340 aa21.28■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 HYPKQ9NX55 129 aa21.28■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa21.28■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 ANO6Q4KMQ2 910 aa21.27■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 FAM200AQ8TCP9 573 aa21.27■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 OGFRQ9NZT2 677 aa21.27■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa21.27■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 CRB1P82279 1406 aa21.27■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 PTH1RQ03431 593 aa21.27■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.27■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 TRIM5Q9C035 493 aa21.27■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 CBX8Q9HC52 389 aa21.27■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 ATP7BP35670 1465 aa21.27■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 ALKQ9UM73 1620 aa21.27■■□□□ 1
PREB-208ENST00000468045 PI4K2BQ8TCG2 481 aa21.27■□□□□ 0.99
PREB-208ENST00000468045 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.27■□□□□ 0.99
PREB-208ENST00000468045 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP21.27■□□□□ 0.99
PREB-208ENST00000468045 STK31Q9BXU1 1019 aa21.27■□□□□ 0.99
PREB-208ENST00000468045 WASLO00401 505 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
PREB-208ENST00000468045 GNAI3P08754 354 aa21.26■□□□□ 0.99
PREB-208ENST00000468045 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
PREB-208ENST00000468045 AATKQ6ZMQ8 1374 aa21.26■□□□□ 0.99
PREB-208ENST00000468045 TPM3P06753 285 aa21.25■□□□□ 0.99
PREB-208ENST00000468045 ARID5BQ14865 1188 aa21.25■□□□□ 0.99
PREB-208ENST00000468045 MAP3K11Q16584 847 aa21.25■□□□□ 0.99
PREB-208ENST00000468045 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
PREB-208ENST00000468045 USP44Q9H0E7 712 aa21.25■□□□□ 0.99
PREB-208ENST00000468045 NUP62CLQ9H1M0 184 aa21.25■□□□□ 0.99
PREB-208ENST00000468045 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa21.25■□□□□ 0.99
PREB-208ENST00000468045 CDC37L1Q7L3B6 337 aa21.25■□□□□ 0.99
PREB-208ENST00000468045 TCEANC2Q96MN5 208 aa21.25■□□□□ 0.99
PREB-208ENST00000468045 FEZ1Q99689 392 aa21.25■□□□□ 0.99
PREB-208ENST00000468045 DACT1Q9NYF0 836 aa21.25■□□□□ 0.99
PREB-208ENST00000468045 ME3Q16798 604 aa21.25■□□□□ 0.99
PREB-208ENST00000468045 PDRG1Q9NUG6 133 aa21.25■□□□□ 0.99
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