RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467594.1

NISCH-205, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 1,014 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-205ENST00000467594 COL15A1P39059 1388 aa20.52■□□□□ 0.88
NISCH-205ENST00000467594 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
NISCH-205ENST00000467594 NARFQ9UHQ1 456 aa20.52■□□□□ 0.88
NISCH-205ENST00000467594 KIF13BQ9NQT8 1826 aa20.52■□□□□ 0.88
NISCH-205ENST00000467594 C10orf71Q711Q0 1435 aa20.52■□□□□ 0.87
NISCH-205ENST00000467594 CANXP27824 592 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
NISCH-205ENST00000467594 USPL1Q5W0Q7 1092 aa20.51■□□□□ 0.87
NISCH-205ENST00000467594 MCM10Q7L590 875 aa20.51■□□□□ 0.87
NISCH-205ENST00000467594 A0A087WZG4 1122 aa20.5■□□□□ 0.87
NISCH-205ENST00000467594 TM4SF1P30408 202 aa20.5■□□□□ 0.87
NISCH-205ENST00000467594 PXDNLA1KZ92 1463 aa20.5■□□□□ 0.87
NISCH-205ENST00000467594 EIF5P55010 431 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
NISCH-205ENST00000467594 DDR1Q08345 913 aa20.48■□□□□ 0.87
NISCH-205ENST00000467594 PLEKHF1Q96S99 279 aa20.48■□□□□ 0.87
NISCH-205ENST00000467594 A0A0G2JLW4 131 aa20.47■□□□□ 0.87
NISCH-205ENST00000467594 KCNQ3O43525 872 aa20.47■□□□□ 0.87
NISCH-205ENST00000467594 DCTN1Q14203 1278 aa20.47■□□□□ 0.87
NISCH-205ENST00000467594 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
NISCH-205ENST00000467594 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
NISCH-205ENST00000467594 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
NISCH-205ENST00000467594 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
NISCH-205ENST00000467594 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.46■□□□□ 0.87
NISCH-205ENST00000467594 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
NISCH-205ENST00000467594 DPEP1P16444 411 aa20.45■□□□□ 0.86
NISCH-205ENST00000467594 NFE2L2Q16236 605 aa20.45■□□□□ 0.86
NISCH-205ENST00000467594 WWC3Q9ULE0 1092 aa20.45■□□□□ 0.86
NISCH-205ENST00000467594 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
NISCH-205ENST00000467594 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa20.44■□□□□ 0.86
NISCH-205ENST00000467594 NFIXQ14938 502 aa20.44■□□□□ 0.86
NISCH-205ENST00000467594 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
NISCH-205ENST00000467594 A1BGP04217 495 aa20.43■□□□□ 0.86
NISCH-205ENST00000467594 BCL2L12Q9HB09 334 aa20.43■□□□□ 0.86
NISCH-205ENST00000467594 BCS1LQ9Y276 419 aa20.43■□□□□ 0.86
NISCH-205ENST00000467594 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
NISCH-205ENST00000467594 PIM2Q9P1W9 311 aa20.42■□□□□ 0.86
NISCH-205ENST00000467594 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
NISCH-205ENST00000467594 USP16Q9Y5T5 823 aa20.42■□□□□ 0.86
NISCH-205ENST00000467594 UTRNP46939 3433 aa20.42■□□□□ 0.86
NISCH-205ENST00000467594 SERPINB2P05120 415 aa20.4■□□□□ 0.86
NISCH-205ENST00000467594 KCNA3P22001 575 aa20.4■□□□□ 0.86
NISCH-205ENST00000467594 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
NISCH-205ENST00000467594 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa20.4■□□□□ 0.86
NISCH-205ENST00000467594 DLG5Q8TDM6 1919 aa20.39■□□□□ 0.85
NISCH-205ENST00000467594 NRXN2Q9P2S2 1712 aa20.37■□□□□ 0.85
NISCH-205ENST00000467594 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa20.37■□□□□ 0.85
NISCH-205ENST00000467594 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
NISCH-205ENST00000467594 BICDL1Q6ZP65 573 aa20.37■□□□□ 0.85
NISCH-205ENST00000467594 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
NISCH-205ENST00000467594 MIS18AQ9NYP9 233 aa20.37■□□□□ 0.85
NISCH-205ENST00000467594 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
NISCH-205ENST00000467594 SCN7AQ01118 1682 aa20.36■□□□□ 0.85
NISCH-205ENST00000467594 TBC1D9BQ66K14 1250 aa20.36■□□□□ 0.85
NISCH-205ENST00000467594 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa20.36■□□□□ 0.85
NISCH-205ENST00000467594 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
NISCH-205ENST00000467594 ATP10DQ9P241 1426 aa20.36■□□□□ 0.85
NISCH-205ENST00000467594 ADCY9O60503 1353 aa20.35■□□□□ 0.85
NISCH-205ENST00000467594 CAMTA2O94983 1202 aa20.35■□□□□ 0.85
NISCH-205ENST00000467594 CHRNA5P30532 468 aa20.35■□□□□ 0.85
NISCH-205ENST00000467594 RIPK4P57078 832 aa20.35■□□□□ 0.85
NISCH-205ENST00000467594 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.35■□□□□ 0.85
NISCH-205ENST00000467594 CARMIL3Q8ND23 1372 aa20.34■□□□□ 0.85
NISCH-205ENST00000467594 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
NISCH-205ENST00000467594 RGL2O15211 777 aa20.34■□□□□ 0.85
NISCH-205ENST00000467594 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
NISCH-205ENST00000467594 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
NISCH-205ENST00000467594 CLEC4GQ6UXB4 293 aa20.34■□□□□ 0.85
NISCH-205ENST00000467594 SETDB2Q96T68 719 aa20.34■□□□□ 0.85
NISCH-205ENST00000467594 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
NISCH-205ENST00000467594 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
NISCH-205ENST00000467594 TMPOP42166 694 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
NISCH-205ENST00000467594 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
NISCH-205ENST00000467594 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa20.33■□□□□ 0.85
NISCH-205ENST00000467594 ZNF652Q9Y2D9 606 aa20.33■□□□□ 0.85
NISCH-205ENST00000467594 KDM3BQ7LBC6 1761 aa20.33■□□□□ 0.84
NISCH-205ENST00000467594 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa20.32■□□□□ 0.84
NISCH-205ENST00000467594 NBPF26B4DH59 902 aa20.32■□□□□ 0.84
NISCH-205ENST00000467594 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
NISCH-205ENST00000467594 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
NISCH-205ENST00000467594 NBPF15Q8N660 670 aa20.32■□□□□ 0.84
NISCH-205ENST00000467594 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
NISCH-205ENST00000467594 BABAM1Q9NWV8 329 aa20.32■□□□□ 0.84
NISCH-205ENST00000467594 H0YIN7 160 aa20.31■□□□□ 0.84
NISCH-205ENST00000467594 C1QTNF8P60827 252 aa20.31■□□□□ 0.84
NISCH-205ENST00000467594 BRIP1Q9BX63 1249 aa20.31■□□□□ 0.84
NISCH-205ENST00000467594 PDE6BP35913 854 aa20.3■□□□□ 0.84
NISCH-205ENST00000467594 C2CD5Q86YS7 1000 aa20.3■□□□□ 0.84
NISCH-205ENST00000467594 RUNDC1Q96C34 613 aa20.3■□□□□ 0.84
NISCH-205ENST00000467594 TSPYL4Q9UJ04 414 aa20.3■□□□□ 0.84
NISCH-205ENST00000467594 LAMB4A4D0S4 1761 aa20.3■□□□□ 0.84
NISCH-205ENST00000467594 BCORQ6W2J9 1755 aa20.3■□□□□ 0.84
NISCH-205ENST00000467594 NPHP1O15259 732 aa20.29■□□□□ 0.84
NISCH-205ENST00000467594 PRR5LQ6MZQ0 368 aa20.29■□□□□ 0.84
NISCH-205ENST00000467594 CNBD1Q8NA66 436 aa20.29■□□□□ 0.84
NISCH-205ENST00000467594 TTLL6Q8N841 843 aa20.28■□□□□ 0.84
NISCH-205ENST00000467594 ST5P78524 1137 aa20.27■□□□□ 0.84
NISCH-205ENST00000467594 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.27■□□□□ 0.84
NISCH-205ENST00000467594 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.27■□□□□ 0.84
NISCH-205ENST00000467594 DLEC1Q9Y238 1755 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-205ENST00000467594 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
NISCH-205ENST00000467594 ERBB4Q15303 1308 aa20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms