RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466245.1

TTLL3-223, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 3

Gene TTLL3, Length 616 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-223	ENST00000466245	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-223	ENST00000466245	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-223	ENST00000466245	LMNB1	P20700	586 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-223	ENST00000466245	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-223	ENST00000466245	CFAP53	Q96M91	514 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-223	ENST00000466245	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-223	ENST00000466245	RALBP1	Q15311	655 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-223	ENST00000466245	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-223	ENST00000466245	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-223	ENST00000466245	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-223	ENST00000466245	GLTPD2	A6NH11	291 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-223	ENST00000466245	CHRNA5	P30532	468 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-223	ENST00000466245	FKBP8	Q14318	412 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-223	ENST00000466245	DDR1	Q08345	913 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-223	ENST00000466245	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-223	ENST00000466245	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-223	ENST00000466245	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-223	ENST00000466245	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-223	ENST00000466245	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-223	ENST00000466245	NUDC	Q9Y266	331 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-223	ENST00000466245	TJP1	Q07157	1748 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-223	ENST00000466245	MRC1	P22897	1456 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-223	ENST00000466245	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.26
TTLL3-223	ENST00000466245	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.26
TTLL3-223	ENST00000466245	RASSF7	Q02833	373 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-223	ENST00000466245	TTLL6	Q8N841	843 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-223	ENST00000466245	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-223	ENST00000466245	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-223	ENST00000466245	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-223	ENST00000466245		H0YIN7	160 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-223	ENST00000466245	TM4SF1	P30408	202 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-223	ENST00000466245	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-223	ENST00000466245	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-223	ENST00000466245	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-223	ENST00000466245	AIDA	Q96BJ3	306 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-223	ENST00000466245	COL15A1	P39059	1388 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-223	ENST00000466245	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-223	ENST00000466245	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-223	ENST00000466245	HMOX1	P09601	288 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-223	ENST00000466245	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-223	ENST00000466245	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-223	ENST00000466245	CREBZF	Q9NS37	354 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-223	ENST00000466245	NARF	Q9UHQ1	456 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-223	ENST00000466245	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-223	ENST00000466245	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-223	ENST00000466245	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-223	ENST00000466245	SERPINB2	P05120	415 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-223	ENST00000466245	NFIX	Q14938	502 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-223	ENST00000466245	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-223	ENST00000466245	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-223	ENST00000466245	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-223	ENST00000466245	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	NPHP1	O15259	732 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	ERFE	Q4G0M1	354 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	CHADL	Q6NUI6	762 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245		A0A087WZG4	1122 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	PRKAR2B	P31323	418 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	PDE6B	P35913	854 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	SOGA3	Q5TF21	947 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	13.37	□□□□□ -0.27	2e-16	■□□□□ 8.6
TTLL3-223	ENST00000466245	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	LGR6	Q9HBX8	967 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	NFKBIE	O00221	500 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	SCN4A	P35499	1836 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	STARD3NL	O95772	234 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	CNTNAP1	P78357	1384 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	CACNA1S	Q13698	1873 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	LDHD	Q86WU2	507 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		13.33	□□□□□ -0.27
TTLL3-223	ENST00000466245	C21orf2	O43822	256 aa		13.33	□□□□□ -0.28

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