RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SYNE4-204ENST00000465425 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SYNE4-204ENST00000465425 PALD1Q9ULE6 856 aa22.29■■□□□ 1.16
SYNE4-204ENST00000465425 BEND3Q5T5X7 828 aa22.29■■□□□ 1.16
SYNE4-204ENST00000465425 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SYNE4-204ENST00000465425 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SYNE4-204ENST00000465425 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.28■■□□□ 1.16
SYNE4-204ENST00000465425 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SYNE4-204ENST00000465425 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.28■■□□□ 1.16
SYNE4-204ENST00000465425 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.28■■□□□ 1.16
SYNE4-204ENST00000465425 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SYNE4-204ENST00000465425 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SYNE4-204ENST00000465425 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.27■■□□□ 1.16
SYNE4-204ENST00000465425 KCNQ3O43525 872 aa22.27■■□□□ 1.16
SYNE4-204ENST00000465425 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.27■■□□□ 1.16
SYNE4-204ENST00000465425 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.27■■□□□ 1.16
SYNE4-204ENST00000465425 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SYNE4-204ENST00000465425 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SYNE4-204ENST00000465425 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SYNE4-204ENST00000465425 PLEKHG5O94827 1062 aa22.25■■□□□ 1.15
SYNE4-204ENST00000465425 ANXA1P04083 346 aa22.25■■□□□ 1.15
SYNE4-204ENST00000465425 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SYNE4-204ENST00000465425 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SYNE4-204ENST00000465425 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SYNE4-204ENST00000465425 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SYNE4-204ENST00000465425 GCP02774 474 aa22.24■■□□□ 1.15
SYNE4-204ENST00000465425 CLCN1P35523 988 aa22.24■■□□□ 1.15
SYNE4-204ENST00000465425 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SYNE4-204ENST00000465425 CNTROBQ8N137 903 aa22.24■■□□□ 1.15
SYNE4-204ENST00000465425 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.24■■□□□ 1.15
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF445P59923 1031 aa22.24■■□□□ 1.15
SYNE4-204ENST00000465425 CUL4AQ13619 759 aa22.24■■□□□ 1.15
SYNE4-204ENST00000465425 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.24■■□□□ 1.15
SYNE4-204ENST00000465425 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SYNE4-204ENST00000465425 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa22.23■■□□□ 1.15
SYNE4-204ENST00000465425 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SYNE4-204ENST00000465425 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.23■■□□□ 1.15
SYNE4-204ENST00000465425 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SYNE4-204ENST00000465425 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SYNE4-204ENST00000465425 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SYNE4-204ENST00000465425 IL17RAQ96F46 866 aa22.22■■□□□ 1.15
SYNE4-204ENST00000465425 ADCY9O60503 1353 aa22.22■■□□□ 1.15
SYNE4-204ENST00000465425 LMO7Q8WWI1 1683 aa22.22■■□□□ 1.15
SYNE4-204ENST00000465425 ESPNB1AK53 854 aa22.22■■□□□ 1.15
SYNE4-204ENST00000465425 HSPA4P34932 840 aa22.22■■□□□ 1.15
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.22■■□□□ 1.15
SYNE4-204ENST00000465425 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SYNE4-204ENST00000465425 NCAPD2Q15021 1401 aa22.21■■□□□ 1.15
SYNE4-204ENST00000465425 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SYNE4-204ENST00000465425 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.21■■□□□ 1.15
SYNE4-204ENST00000465425 IL25Q9H293 177 aa22.21■■□□□ 1.15
SYNE4-204ENST00000465425 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SYNE4-204ENST00000465425 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.2■■□□□ 1.14
SYNE4-204ENST00000465425 ORAI2Q96SN7 254 aa22.2■■□□□ 1.14
SYNE4-204ENST00000465425 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.2■■□□□ 1.14
SYNE4-204ENST00000465425 SGSM2O43147 1006 aa22.19■■□□□ 1.14
SYNE4-204ENST00000465425 BRD1O95696 1058 aa22.19■■□□□ 1.14
SYNE4-204ENST00000465425 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.19■■□□□ 1.14
SYNE4-204ENST00000465425 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.19■■□□□ 1.14
SYNE4-204ENST00000465425 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.19■■□□□ 1.14
SYNE4-204ENST00000465425 RAD50Q92878 1312 aa22.19■■□□□ 1.14
SYNE4-204ENST00000465425 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SYNE4-204ENST00000465425 GPT2Q8TD30 523 aa22.19■■□□□ 1.14
SYNE4-204ENST00000465425 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SYNE4-204ENST00000465425 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.18■■□□□ 1.14
SYNE4-204ENST00000465425 ALDH1L1O75891 902 aa22.18■■□□□ 1.14
SYNE4-204ENST00000465425 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SYNE4-204ENST00000465425 MTX1Q13505 466 aa22.17■■□□□ 1.14
SYNE4-204ENST00000465425 PXDNQ92626 1479 aa22.17■■□□□ 1.14
SYNE4-204ENST00000465425 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.17■■□□□ 1.14
SYNE4-204ENST00000465425 KSR2Q6VAB6 950 aa22.17■■□□□ 1.14
SYNE4-204ENST00000465425 MBD3O95983 291 aa22.16■■□□□ 1.14
SYNE4-204ENST00000465425 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.16■■□□□ 1.14
SYNE4-204ENST00000465425 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SYNE4-204ENST00000465425 GPATCH3Q96I76 525 aa22.15■■□□□ 1.14
SYNE4-204ENST00000465425 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.15■■□□□ 1.14
SYNE4-204ENST00000465425 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.15■■□□□ 1.14
SYNE4-204ENST00000465425 HYPKQ9NX55 129 aa22.15■■□□□ 1.14
SYNE4-204ENST00000465425 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SYNE4-204ENST00000465425 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SYNE4-204ENST00000465425 PROSER3Q2NL68 480 aa22.14■■□□□ 1.14
SYNE4-204ENST00000465425 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.14■■□□□ 1.14
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SYNE4-204ENST00000465425 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SYNE4-204ENST00000465425 SLIT3O75094 1523 aa22.14■■□□□ 1.13
SYNE4-204ENST00000465425 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SYNE4-204ENST00000465425 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.13■■□□□ 1.13
SYNE4-204ENST00000465425 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.13■■□□□ 1.13
SYNE4-204ENST00000465425 ERBB4Q15303 1308 aa22.13■■□□□ 1.13
SYNE4-204ENST00000465425 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SYNE4-204ENST00000465425 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SYNE4-204ENST00000465425 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SYNE4-204ENST00000465425 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SYNE4-204ENST00000465425 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.12■■□□□ 1.13
SYNE4-204ENST00000465425 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.12■■□□□ 1.13
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.12■■□□□ 1.13
SYNE4-204ENST00000465425 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SYNE4-204ENST00000465425 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.11■■□□□ 1.13
SYNE4-204ENST00000465425 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SYNE4-204ENST00000465425 SPG7Q9UQ90 795 aa22.11■■□□□ 1.13
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