RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-210ENST00000462363 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-210ENST00000462363 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-210ENST00000462363 PLCH1Q4KWH8 1693 aa7.16□□□□□ -1.26
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PTPRC-210ENST00000462363 RGS3P49796 1198 aa7.15□□□□□ -1.26
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PTPRC-210ENST00000462363 C1orf115Q9H7X2 142 aa7.12□□□□□ -1.27
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PTPRC-210ENST00000462363 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-210ENST00000462363 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
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PTPRC-210ENST00000462363 BEND3Q5T5X7 828 aa7.08□□□□□ -1.28
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PTPRC-210ENST00000462363 PROSER3Q2NL68 480 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 SSH3Q8TE77 659 aa7.07□□□□□ -1.28
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PTPRC-210ENST00000462363 DCAF5Q96JK2 942 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 CARD10Q9BWT7 1032 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 CHMP4AQ9BY43 222 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 OSBPL3Q9H4L5 887 aa7.07□□□□□ -1.28
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