RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462351.5

PTPRN-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRN, Length 5,099 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-211ENST00000462351 CCDC57Q2TAC2 916 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRN-211ENST00000462351 C1orf115Q9H7X2 142 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRN-211ENST00000462351 TMEM132AQ24JP5 1023 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRN-211ENST00000462351 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
PTPRN-211ENST00000462351 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 WWC2Q6AWC2 1192 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 PZPP20742 1482 aa16.77■□□□□ 0.27
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PTPRN-211ENST00000462351 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 CLGNO14967 610 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 FANCAO15360 1455 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 ADCY5O95622 1261 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 CEP135Q66GS9 1140 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 DAAM2Q86T65 1068 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 FERMT3Q86UX7 667 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 VPS36Q86VN1 386 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 TAOK3Q9H2K8 898 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 DESP17661 470 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 CEP112Q8N8E3 955 aa16.75■□□□□ 0.27
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PTPRN-211ENST00000462351 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa16.75■□□□□ 0.27
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PTPRN-211ENST00000462351 GOPCQ9HD26 462 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 CAVIN2O95810 425 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 FKBP15Q5T1M5 1219 aa16.74■□□□□ 0.27
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PTPRN-211ENST00000462351 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa16.74■□□□□ 0.27
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PTPRN-211ENST00000462351 ANKLE2Q86XL3 938 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 MICALL1Q8N3F8 863 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 FAM135AQ9P2D6 1515 aa16.74■□□□□ 0.27
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PTPRN-211ENST00000462351 NACAP1Q9BZK3 213 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 SHANK2Q9UPX8 1470 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 TEX14Q8IWB6 1497 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 CCDC69A6NI79 296 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 SEPT6Q14141 434 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 YEATS4O95619 227 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP16.73■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 CCDC178Q5BJE1 867 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 MAATS1Q7Z4T9 603 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 CEP57Q86XR8 500 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP16.73■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 CEP131Q9UPN4 1083 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 CEP83Q9Y592 693 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 EBAG9O00559 213 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 SOGA3Q5TF21 947 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 WASF1Q92558 559 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 RASSF4Q9H2L5 321 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 CTNNA3Q9UI47 895 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 CCDC171Q6TFL3 1326 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 FCHSD2O94868 740 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 CCDC61Q9Y6R9 512 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 GNG11P61952 73 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 CCDC158Q5M9N0 1113 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 POTEJP0CG39 1038 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 CAPN2P17655 700 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 CCT4P50991 539 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 PLCD3Q8N3E9 789 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP16.71■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 KLHL40Q2TBA0 621 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 WAPLQ7Z5K2 1190 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 ADGRL2O95490 1459 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 FSD2A1L4K1 749 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRN-211ENST00000462351 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
PTPRN-211ENST00000462351 ATP2C2O75185 946 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRN-211ENST00000462351 SSFA2P28290 1259 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRN-211ENST00000462351 ALS2CR12Q96Q35 445 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRN-211ENST00000462351 SLC4A2P04920 1241 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRN-211ENST00000462351 ZNF165P49910 485 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRN-211ENST00000462351 SLFN5Q08AF3 891 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRN-211ENST00000462351 GBP6Q6ZN66 633 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRN-211ENST00000462351 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
PTPRN-211ENST00000462351 TBC1D2Q9BYX2 928 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRN-211ENST00000462351 A0A1B0GUA9 196 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRN-211ENST00000462351 KLHL10Q6JEL2 608 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRN-211ENST00000462351 ATRIPQ8WXE1 791 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRN-211ENST00000462351 SYCP2Q9BX26 1530 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRN-211ENST00000462351 HSF2BPO75031 334 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRN-211ENST00000462351 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
PTPRN-211ENST00000462351 IDI1Q13907 227 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRN-211ENST00000462351 MCM6Q14566 821 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRN-211ENST00000462351 CKAP2LQ8IYA6 745 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRN-211ENST00000462351 OTUD6BQ8N6M0 293 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRN-211ENST00000462351 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
PTPRN-211ENST00000462351 NUP133Q8WUM0 1156 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRN-211ENST00000462351 NUP160Q12769 1436 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRN-211ENST00000462351 ANAPC15P60006 121 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRN-211ENST00000462351 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
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