RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455631.5

PTPRA-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type A, human

TSL 5

Gene PTPRA, Length 1,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRA-208	ENST00000455631	LMNB1	P20700	586 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PTPRA-208	ENST00000455631	NFIX	Q14938	502 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PTPRA-208	ENST00000455631	PANK3	Q9H999	370 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PTPRA-208	ENST00000455631	COL15A1	P39059	1388 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PTPRA-208	ENST00000455631	GLTPD2	A6NH11	291 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PTPRA-208	ENST00000455631	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	31.79	■■■□□ 2.68
PTPRA-208	ENST00000455631	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PTPRA-208	ENST00000455631	MORC1	Q86VD1	984 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PTPRA-208	ENST00000455631	PCNT	O95613	3336 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PTPRA-208	ENST00000455631	PRELP	P51888	382 aa		31.77	■■■□□ 2.68
PTPRA-208	ENST00000455631	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		31.77	■■■□□ 2.68
PTPRA-208	ENST00000455631	NARF	Q9UHQ1	456 aa		31.77	■■■□□ 2.68
PTPRA-208	ENST00000455631	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
PTPRA-208	ENST00000455631	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	31.76	■■■□□ 2.67
PTPRA-208	ENST00000455631	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		31.76	■■■□□ 2.67
PTPRA-208	ENST00000455631	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
PTPRA-208	ENST00000455631	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
PTPRA-208	ENST00000455631	TTLL6	Q8N841	843 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PTPRA-208	ENST00000455631	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PTPRA-208	ENST00000455631	MRC1	P22897	1456 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PTPRA-208	ENST00000455631	SERPINB2	P05120	415 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PTPRA-208	ENST00000455631	SLC39A6	Q13433	755 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PTPRA-208	ENST00000455631	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		31.73	■■■□□ 2.67
PTPRA-208	ENST00000455631	IL13	P35225	146 aa		31.72	■■■□□ 2.67
PTPRA-208	ENST00000455631	LGR6	Q9HBX8	967 aa		31.72	■■■□□ 2.67
PTPRA-208	ENST00000455631	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		31.71	■■■□□ 2.67
PTPRA-208	ENST00000455631	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		31.71	■■■□□ 2.67
PTPRA-208	ENST00000455631	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		31.7	■■■□□ 2.67
PTPRA-208	ENST00000455631		H0YIN7	160 aa		31.69	■■■□□ 2.66
PTPRA-208	ENST00000455631	NFKBIE	O00221	500 aa		31.69	■■■□□ 2.66
PTPRA-208	ENST00000455631	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	31.68	■■■□□ 2.66
PTPRA-208	ENST00000455631	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		31.66	■■■□□ 2.66
PTPRA-208	ENST00000455631	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	31.65	■■■□□ 2.66
PTPRA-208	ENST00000455631	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		31.64	■■■□□ 2.66
PTPRA-208	ENST00000455631	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		31.64	■■■□□ 2.66
PTPRA-208	ENST00000455631	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		31.64	■■■□□ 2.66
PTPRA-208	ENST00000455631	POTEC	B2RU33	542 aa		31.63	■■■□□ 2.65
PTPRA-208	ENST00000455631	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	31.63	■■■□□ 2.65
PTPRA-208	ENST00000455631	HMOX1	P09601	288 aa		31.62	■■■□□ 2.65
PTPRA-208	ENST00000455631	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		31.62	■■■□□ 2.65
PTPRA-208	ENST00000455631	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	31.62	■■■□□ 2.65
PTPRA-208	ENST00000455631	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	31.61	■■■□□ 2.65
PTPRA-208	ENST00000455631	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	31.61	■■■□□ 2.65
PTPRA-208	ENST00000455631	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	31.61	■■■□□ 2.65	3e-6	■□□□□ 8.1
PTPRA-208	ENST00000455631	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	31.61	■■■□□ 2.65
PTPRA-208	ENST00000455631	ERFE	Q4G0M1	354 aa		31.6	■■■□□ 2.65
PTPRA-208	ENST00000455631	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		31.6	■■■□□ 2.65
PTPRA-208	ENST00000455631	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		31.6	■■■□□ 2.65
PTPRA-208	ENST00000455631	SCN7A	Q01118	1682 aa		31.6	■■■□□ 2.65
PTPRA-208	ENST00000455631	C21orf2	O43822	256 aa		31.58	■■■□□ 2.65
PTPRA-208	ENST00000455631	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	31.57	■■■□□ 2.64
PTPRA-208	ENST00000455631	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		31.57	■■■□□ 2.64
PTPRA-208	ENST00000455631		A0A087WZG4	1122 aa		31.56	■■■□□ 2.64
PTPRA-208	ENST00000455631	STARD3NL	O95772	234 aa		31.56	■■■□□ 2.64
PTPRA-208	ENST00000455631	PDE6B	P35913	854 aa		31.56	■■■□□ 2.64
PTPRA-208	ENST00000455631	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	31.56	■■■□□ 2.64
PTPRA-208	ENST00000455631	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		31.56	■■■□□ 2.64
PTPRA-208	ENST00000455631	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		31.55	■■■□□ 2.64
PTPRA-208	ENST00000455631	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		31.55	■■■□□ 2.64
PTPRA-208	ENST00000455631	CACNA1S	Q13698	1873 aa		31.55	■■■□□ 2.64
PTPRA-208	ENST00000455631	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	31.54	■■■□□ 2.64
PTPRA-208	ENST00000455631	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		31.54	■■■□□ 2.64
PTPRA-208	ENST00000455631	CREBZF	Q9NS37	354 aa		31.54	■■■□□ 2.64
PTPRA-208	ENST00000455631	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	31.54	■■■□□ 2.64
PTPRA-208	ENST00000455631	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	31.54	■■■□□ 2.64
PTPRA-208	ENST00000455631	CHADL	Q6NUI6	762 aa		31.53	■■■□□ 2.64
PTPRA-208	ENST00000455631	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		31.52	■■■□□ 2.64
PTPRA-208	ENST00000455631	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		31.52	■■■□□ 2.64
PTPRA-208	ENST00000455631	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		31.49	■■■□□ 2.63
PTPRA-208	ENST00000455631	NPHP1	O15259	732 aa		31.49	■■■□□ 2.63
PTPRA-208	ENST00000455631	POTEI	P0CG38	1075 aa		31.49	■■■□□ 2.63
PTPRA-208	ENST00000455631	POTEJ	P0CG39	1038 aa		31.49	■■■□□ 2.63
PTPRA-208	ENST00000455631	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		31.49	■■■□□ 2.63
PTPRA-208	ENST00000455631	SLX4	Q8IY92	1834 aa		31.48	■■■□□ 2.63
PTPRA-208	ENST00000455631	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	31.48	■■■□□ 2.63
PTPRA-208	ENST00000455631	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	31.48	■■■□□ 2.63
PTPRA-208	ENST00000455631	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		31.47	■■■□□ 2.63
PTPRA-208	ENST00000455631	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	31.47	■■■□□ 2.63
PTPRA-208	ENST00000455631	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		31.46	■■■□□ 2.63
PTPRA-208	ENST00000455631	CNBD1	Q8NA66	436 aa		31.46	■■■□□ 2.63
PTPRA-208	ENST00000455631	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	31.45	■■■□□ 2.63
PTPRA-208	ENST00000455631	CNKSR1	Q969H4	720 aa		31.45	■■■□□ 2.63
PTPRA-208	ENST00000455631	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		31.45	■■■□□ 2.62
PTPRA-208	ENST00000455631	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	31.44	■■■□□ 2.62
PTPRA-208	ENST00000455631	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	31.43	■■■□□ 2.62
PTPRA-208	ENST00000455631	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	31.43	■■■□□ 2.62
PTPRA-208	ENST00000455631	ST5	P78524	1137 aa		31.43	■■■□□ 2.62
PTPRA-208	ENST00000455631	TEF	Q10587	303 aa		31.43	■■■□□ 2.62
PTPRA-208	ENST00000455631	ZNF790	Q6PG37	636 aa		31.43	■■■□□ 2.62
PTPRA-208	ENST00000455631	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	31.43	■■■□□ 2.62
PTPRA-208	ENST00000455631	SETDB2	Q96T68	719 aa		31.43	■■■□□ 2.62
PTPRA-208	ENST00000455631	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	31.43	■■■□□ 2.62
PTPRA-208	ENST00000455631	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		31.43	■■■□□ 2.62
PTPRA-208	ENST00000455631	CNTNAP1	P78357	1384 aa		31.43	■■■□□ 2.62
PTPRA-208	ENST00000455631	STYK1	Q6J9G0	422 aa		31.42	■■■□□ 2.62
PTPRA-208	ENST00000455631	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PTPRA-208	ENST00000455631	FOXN1	O15353	648 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PTPRA-208	ENST00000455631	SOGA3	Q5TF21	947 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PTPRA-208	ENST00000455631	SCN4A	P35499	1836 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PTPRA-208	ENST00000455631	SRGN	P10124	158 aa		31.4	■■■□□ 2.62

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