RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450625.1

SH3BP5-207, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 763 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-207ENST00000450625 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP5-207ENST00000450625 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP5-207ENST00000450625 COL15A1P39059 1388 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP5-207ENST00000450625 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP5-207ENST00000450625 KIF3CO14782 793 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP5-207ENST00000450625 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
SH3BP5-207ENST00000450625 NARFQ9UHQ1 456 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP5-207ENST00000450625 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.33■■□□□ 1.16
SH3BP5-207ENST00000450625 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP5-207ENST00000450625 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP5-207ENST00000450625 TEFQ10587 303 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP5-207ENST00000450625 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP5-207ENST00000450625 HSPA6P17066 643 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP5-207ENST00000450625 NFIXQ14938 502 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP5-207ENST00000450625 STARD3NLO95772 234 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP5-207ENST00000450625 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP5-207ENST00000450625 IL17REQ8NFR9 667 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP5-207ENST00000450625 CFAP53Q96M91 514 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP5-207ENST00000450625 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SH3BP5-207ENST00000450625 SERPINB2P05120 415 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP5-207ENST00000450625 ZNF790Q6PG37 636 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP5-207ENST00000450625 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP5-207ENST00000450625 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SH3BP5-207ENST00000450625 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP5-207ENST00000450625 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP5-207ENST00000450625 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SH3BP5-207ENST00000450625 A0A087WZG4 1122 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP5-207ENST00000450625 PRKAR2BP31323 418 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP5-207ENST00000450625 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP5-207ENST00000450625 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SH3BP5-207ENST00000450625 RNF181Q9P0P0 153 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP5-207ENST00000450625 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP5-207ENST00000450625 SBF1O95248 1867 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP5-207ENST00000450625 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP5-207ENST00000450625 TOMM70O94826 608 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP5-207ENST00000450625 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SH3BP5-207ENST00000450625 NUDCQ9Y266 331 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP5-207ENST00000450625 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP5-207ENST00000450625 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP5-207ENST00000450625 BTBD11A6QL63 1104 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5-207ENST00000450625 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5-207ENST00000450625 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5-207ENST00000450625 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5-207ENST00000450625 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5-207ENST00000450625 H0YIN7 160 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-207ENST00000450625 KCNQ3O43525 872 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-207ENST00000450625 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-207ENST00000450625 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-207ENST00000450625 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-207ENST00000450625 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-207ENST00000450625 A1BGP04217 495 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5-207ENST00000450625 PPP2R1AP30153 589 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5-207ENST00000450625 RASSF7Q02833 373 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5-207ENST00000450625 TTLL6Q8N841 843 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5-207ENST00000450625 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5-207ENST00000450625 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5-207ENST00000450625 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP5-207ENST00000450625 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SH3BP5-207ENST00000450625 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SH3BP5-207ENST00000450625 APLP1P51693 650 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP5-207ENST00000450625 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP5-207ENST00000450625 SCN7AQ01118 1682 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP5-207ENST00000450625 MCM10Q7L590 875 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP5-207ENST00000450625 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP5-207ENST00000450625 RRAGCQ9HB90 399 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP5-207ENST00000450625 NPHP1O15259 732 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP5-207ENST00000450625 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.144e-8■□□□□ 9.7
SH3BP5-207ENST00000450625 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP5-207ENST00000450625 LMNB1P20700 586 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP5-207ENST00000450625 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SH3BP5-207ENST00000450625 SETDB2Q96T68 719 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP5-207ENST00000450625 USP16Q9Y5T5 823 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP5-207ENST00000450625 PDE6BP35913 854 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5-207ENST00000450625 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5-207ENST00000450625 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5-207ENST00000450625 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-207ENST00000450625 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-207ENST00000450625 CAMTA2O94983 1202 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-207ENST00000450625 DCTN1Q14203 1278 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-207ENST00000450625 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-207ENST00000450625 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-207ENST00000450625 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-207ENST00000450625 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP5-207ENST00000450625 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SH3BP5-207ENST00000450625 PRELPP51888 382 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP5-207ENST00000450625 CNBD1Q8NA66 436 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP5-207ENST00000450625 BCORQ6W2J9 1755 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP5-207ENST00000450625 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SH3BP5-207ENST00000450625 C21orf2O43822 256 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP5-207ENST00000450625 ST5P78524 1137 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP5-207ENST00000450625 FSTL1Q12841 308 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP5-207ENST00000450625 CACNA1SQ13698 1873 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP5-207ENST00000450625 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
SH3BP5-207ENST00000450625 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.08■■□□□ 1.12
SH3BP5-207ENST00000450625 WDR90Q96KV7 1748 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5-207ENST00000450625 GLTPD2A6NH11 291 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5-207ENST00000450625 NFKBIEO00221 500 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5-207ENST00000450625 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5-207ENST00000450625 NEFMP07197 916 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5-207ENST00000450625 IFFO2Q5TF58 517 aa22.06■■□□□ 1.12
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