RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442896.1

SMARCE1P2-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1 pseudogene 2, humanhuman

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Gene SMARCE1P2, Length 1,219 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1P2-201ENST00000442896 DDR1Q08345 913 aa14.79□□□□□ -0.04
SMARCE1P2-201ENST00000442896 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
SMARCE1P2-201ENST00000442896 BCS1LQ9Y276 419 aa14.79□□□□□ -0.04
SMARCE1P2-201ENST00000442896 COL15A1P39059 1388 aa14.78□□□□□ -0.04
SMARCE1P2-201ENST00000442896 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa14.78□□□□□ -0.04
SMARCE1P2-201ENST00000442896 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
SMARCE1P2-201ENST00000442896 CANXP27824 592 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
SMARCE1P2-201ENST00000442896 NARFQ9UHQ1 456 aa14.78□□□□□ -0.04
SMARCE1P2-201ENST00000442896 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
SMARCE1P2-201ENST00000442896 ATP10DQ9P241 1426 aa14.77□□□□□ -0.04
SMARCE1P2-201ENST00000442896 FMNL2Q96PY5 1086 aa14.77□□□□□ -0.05
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SMARCE1P2-201ENST00000442896 UBR2Q8IWV8 1755 aa14.77□□□□□ -0.05
SMARCE1P2-201ENST00000442896 HEG1Q9ULI3 1381 aa14.76□□□□□ -0.05
SMARCE1P2-201ENST00000442896 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa14.76□□□□□ -0.05
SMARCE1P2-201ENST00000442896 BTBD11A6QL63 1104 aa14.76□□□□□ -0.05
SMARCE1P2-201ENST00000442896 KCNA3P22001 575 aa14.76□□□□□ -0.05
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SMARCE1P2-201ENST00000442896 ADCY9O60503 1353 aa14.75□□□□□ -0.05
SMARCE1P2-201ENST00000442896 KCNQ3O43525 872 aa14.75□□□□□ -0.05
SMARCE1P2-201ENST00000442896 NFIXQ14938 502 aa14.75□□□□□ -0.05
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SMARCE1P2-201ENST00000442896 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SMARCE1P2-201ENST00000442896 PIM2Q9P1W9 311 aa14.75□□□□□ -0.05
SMARCE1P2-201ENST00000442896 A0A087WZG4 1122 aa14.74□□□□□ -0.05
SMARCE1P2-201ENST00000442896 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa14.74□□□□□ -0.05
SMARCE1P2-201ENST00000442896 MCM10Q7L590 875 aa14.74□□□□□ -0.05
SMARCE1P2-201ENST00000442896 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SMARCE1P2-201ENST00000442896 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SMARCE1P2-201ENST00000442896 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SMARCE1P2-201ENST00000442896 A1BGP04217 495 aa14.73□□□□□ -0.05
SMARCE1P2-201ENST00000442896 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa14.72□□□□□ -0.05
SMARCE1P2-201ENST00000442896 SERPINB2P05120 415 aa14.72□□□□□ -0.05
SMARCE1P2-201ENST00000442896 CHRNA5P30532 468 aa14.72□□□□□ -0.05
SMARCE1P2-201ENST00000442896 DCTN1Q14203 1278 aa14.72□□□□□ -0.05
SMARCE1P2-201ENST00000442896 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SMARCE1P2-201ENST00000442896 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
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SMARCE1P2-201ENST00000442896 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SMARCE1P2-201ENST00000442896 USP16Q9Y5T5 823 aa14.71□□□□□ -0.05
SMARCE1P2-201ENST00000442896 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SMARCE1P2-201ENST00000442896 BICDL1Q6ZP65 573 aa14.7□□□□□ -0.06
SMARCE1P2-201ENST00000442896 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa14.7□□□□□ -0.06
SMARCE1P2-201ENST00000442896 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SMARCE1P2-201ENST00000442896 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SMARCE1P2-201ENST00000442896 TBC1D9BQ66K14 1250 aa14.69□□□□□ -0.06
SMARCE1P2-201ENST00000442896 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa14.68□□□□□ -0.06
SMARCE1P2-201ENST00000442896 PLEKHF1Q96S99 279 aa14.68□□□□□ -0.06
SMARCE1P2-201ENST00000442896 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SMARCE1P2-201ENST00000442896 NRXN2Q9P2S2 1712 aa14.67□□□□□ -0.06
SMARCE1P2-201ENST00000442896 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa14.67□□□□□ -0.06
SMARCE1P2-201ENST00000442896 CAMTA2O94983 1202 aa14.67□□□□□ -0.06
SMARCE1P2-201ENST00000442896 C9orf131Q5VYM1 1079 aa14.67□□□□□ -0.06
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SMARCE1P2-201ENST00000442896 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SMARCE1P2-201ENST00000442896 RALBP1Q15311 655 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCE1P2-201ENST00000442896 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SMARCE1P2-201ENST00000442896 C2CD5Q86YS7 1000 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCE1P2-201ENST00000442896 SETDB2Q96T68 719 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCE1P2-201ENST00000442896 MIS18AQ9NYP9 233 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCE1P2-201ENST00000442896 CARMIL3Q8ND23 1372 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCE1P2-201ENST00000442896 H0YIN7 160 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCE1P2-201ENST00000442896 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SMARCE1P2-201ENST00000442896 NFE2L2Q16236 605 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCE1P2-201ENST00000442896 TTLL6Q8N841 843 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCE1P2-201ENST00000442896 KIF3CO14782 793 aa14.64□□□□□ -0.07
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SMARCE1P2-201ENST00000442896 BRIP1Q9BX63 1249 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCE1P2-201ENST00000442896 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCE1P2-201ENST00000442896 SCN7AQ01118 1682 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCE1P2-201ENST00000442896 PDE6BP35913 854 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCE1P2-201ENST00000442896 PRR5LQ6MZQ0 368 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCE1P2-201ENST00000442896 CLEC4GQ6UXB4 293 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCE1P2-201ENST00000442896 CCDC24Q8N4L8 307 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCE1P2-201ENST00000442896 RNF181Q9P0P0 153 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCE1P2-201ENST00000442896 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCE1P2-201ENST00000442896 NBPF26B4DH59 902 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCE1P2-201ENST00000442896 NPHP1O15259 732 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCE1P2-201ENST00000442896 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SMARCE1P2-201ENST00000442896 NBPF15Q8N660 670 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCE1P2-201ENST00000442896 CNBD1Q8NA66 436 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCE1P2-201ENST00000442896 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SMARCE1P2-201ENST00000442896 ZNF652Q9Y2D9 606 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCE1P2-201ENST00000442896 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
SMARCE1P2-201ENST00000442896 DLG5Q8TDM6 1919 aa14.6□□□□□ -0.07
SMARCE1P2-201ENST00000442896 CEP350Q5VT06 3117 aa14.6□□□□□ -0.07
SMARCE1P2-201ENST00000442896 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SMARCE1P2-201ENST00000442896 ST5P78524 1137 aa14.6□□□□□ -0.07
SMARCE1P2-201ENST00000442896 RASSF7Q02833 373 aa14.6□□□□□ -0.07
SMARCE1P2-201ENST00000442896 NMRK2Q9NPI5 230 aa14.6□□□□□ -0.07
SMARCE1P2-201ENST00000442896 RGL2O15211 777 aa14.59□□□□□ -0.07
SMARCE1P2-201ENST00000442896 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SMARCE1P2-201ENST00000442896 DLEC1Q9Y238 1755 aa14.59□□□□□ -0.07
SMARCE1P2-201ENST00000442896 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SMARCE1P2-201ENST00000442896 BCORQ6W2J9 1755 aa14.58□□□□□ -0.08
SMARCE1P2-201ENST00000442896 HSPA6P17066 643 aa14.58□□□□□ -0.08
SMARCE1P2-201ENST00000442896 LMNB1P20700 586 aa14.58□□□□□ -0.08
SMARCE1P2-201ENST00000442896 RIPK4P57078 832 aa14.58□□□□□ -0.08
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