RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 TNS3Q68CZ2 1445 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 NUCB1Q02818 461 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 EVC2Q86UK5 1308 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 CHD1LQ86WJ1 897 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 TCP11L2Q8N4U5 519 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 SGSM3Q96HU1 749 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 FEZ1Q99689 392 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 NPHP3Q7Z494 1330 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM27P14373 513 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 SMC4Q9NTJ3 1288 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 DDX19BQ9UMR2 479 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 SSH2Q76I76 1423 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 LMO7Q8WWI1 1683 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 SLFN14P0C7P3 912 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 ZDHHC9Q9Y397 364 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 SPTLC3Q9NUV7 552 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 PLEKHG3A1L390 1219 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 ERICH4A6NGS2 130 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 SOX12O15370 315 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 BRINP3Q76B58 766 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC66A2RUB6 948 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD45Q5TZF3 282 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 AATKQ6ZMQ8 1374 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 TIGD1Q96MW7 591 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 ADCY5O95622 1261 aa10.15□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 MBD3O95983 291 aa10.15□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 RABEP1Q15276 862 aa10.15□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 PIK3C2AO00443 1686 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 MCCP23508 829 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 SETQ01105 290 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM57Q8N5G2 664 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 TRERF1Q96PN7 1200 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1W2PP64 1363 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 RUNDC1Q96C34 613 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 WASLO00401 505 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR63Q8IWG1 891 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 TMTC2Q8N394 836 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM34Q9BYJ4 488 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 CTNNA3Q9UI47 895 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 CTIFO43310 598 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 CAPN2P17655 700 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC37A3O60309 1634 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 PYCARDQ9ULZ3 195 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 COL18A1P39060 1754 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 MAFGO15525 162 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 PSME1Q06323 249 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 TERF2Q15554 542 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 USP31Q70CQ4 1352 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC20A2Q08357 652 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 SSH1Q8WYL5 1049 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 ZBTB9Q96C00 473 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 IL16Q14005 1332 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 CDC45O75419 566 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 LRP6O75581 1613 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 KIAA1524Q8TCG1 905 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 SLIT2O94813 1529 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 GDPD2Q9HCC8 539 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 CPDO75976 1380 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNF1Q9H3M0 494 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 TTC21AQ8NDW8 1320 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 HSPA1LP34931 641 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 UVSSAQ2YD98 709 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 SPC24Q8NBT2 197 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 ST18O60284 1047 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 113.5 ms