RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439365.6

NPAS1-201, Transcript of neuronal PAS domain protein 1, humanhuman

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Gene NPAS1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1-201ENST00000439365 FMNL2Q96PY5 1086 aa26.06■■□□□ 1.76
NPAS1-201ENST00000439365 BCS1LQ9Y276 419 aa26.06■■□□□ 1.76
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
NPAS1-201ENST00000439365 DPEP1P16444 411 aa26.05■■□□□ 1.76
NPAS1-201ENST00000439365 DDR1Q08345 913 aa26.05■■□□□ 1.76
NPAS1-201ENST00000439365 MCM10Q7L590 875 aa26.05■■□□□ 1.76
NPAS1-201ENST00000439365 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
NPAS1-201ENST00000439365 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa26.05■■□□□ 1.76
NPAS1-201ENST00000439365 HEG1Q9ULI3 1381 aa26.05■■□□□ 1.76
NPAS1-201ENST00000439365 NARFQ9UHQ1 456 aa26.04■■□□□ 1.76
NPAS1-201ENST00000439365 UBR2Q8IWV8 1755 aa26.02■■□□□ 1.76
NPAS1-201ENST00000439365 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
NPAS1-201ENST00000439365 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
NPAS1-201ENST00000439365 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
NPAS1-201ENST00000439365 KCNQ3O43525 872 aa26.01■■□□□ 1.75
NPAS1-201ENST00000439365 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
NPAS1-201ENST00000439365 TM4SF1P30408 202 aa26.01■■□□□ 1.75
NPAS1-201ENST00000439365 KIF13BQ9NQT8 1826 aa26■■□□□ 1.75
NPAS1-201ENST00000439365 A0A087WZG4 1122 aa26■■□□□ 1.75
NPAS1-201ENST00000439365 DCTN1Q14203 1278 aa26■■□□□ 1.75
NPAS1-201ENST00000439365 ATP10DQ9P241 1426 aa25.98■■□□□ 1.75
NPAS1-201ENST00000439365 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
NPAS1-201ENST00000439365 NFIXQ14938 502 aa25.98■■□□□ 1.75
NPAS1-201ENST00000439365 EIF5P55010 431 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
NPAS1-201ENST00000439365 BICDL1Q6ZP65 573 aa25.97■■□□□ 1.75
NPAS1-201ENST00000439365 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa25.97■■□□□ 1.75
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
NPAS1-201ENST00000439365 PIM2Q9P1W9 311 aa25.97■■□□□ 1.75
NPAS1-201ENST00000439365 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
NPAS1-201ENST00000439365 A1BGP04217 495 aa25.96■■□□□ 1.75
NPAS1-201ENST00000439365 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
NPAS1-201ENST00000439365 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa25.95■■□□□ 1.75
NPAS1-201ENST00000439365 C1QTNF8P60827 252 aa25.95■■□□□ 1.75
NPAS1-201ENST00000439365 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.95■■□□□ 1.75
NPAS1-201ENST00000439365 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
NPAS1-201ENST00000439365 CHRNA5P30532 468 aa25.94■■□□□ 1.74
NPAS1-201ENST00000439365 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa25.94■■□□□ 1.74
NPAS1-201ENST00000439365 SERPINB2P05120 415 aa25.93■■□□□ 1.74
NPAS1-201ENST00000439365 KCNA3P22001 575 aa25.93■■□□□ 1.74
NPAS1-201ENST00000439365 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
NPAS1-201ENST00000439365 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
NPAS1-201ENST00000439365 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
NPAS1-201ENST00000439365 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.93■■□□□ 1.74
NPAS1-201ENST00000439365 RALBP1Q15311 655 aa25.92■■□□□ 1.74
NPAS1-201ENST00000439365 USP16Q9Y5T5 823 aa25.92■■□□□ 1.74
NPAS1-201ENST00000439365 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
NPAS1-201ENST00000439365 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
NPAS1-201ENST00000439365 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa25.9■■□□□ 1.74
NPAS1-201ENST00000439365 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
NPAS1-201ENST00000439365 MIS18AQ9NYP9 233 aa25.9■■□□□ 1.74
NPAS1-201ENST00000439365 PLEKHF1Q96S99 279 aa25.89■■□□□ 1.74
NPAS1-201ENST00000439365 ADCY9O60503 1353 aa25.89■■□□□ 1.74
NPAS1-201ENST00000439365 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.88■■□□□ 1.73
NPAS1-201ENST00000439365 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.88■■□□□ 1.73
NPAS1-201ENST00000439365 NPHP1O15259 732 aa25.88■■□□□ 1.73
NPAS1-201ENST00000439365 NFE2L2Q16236 605 aa25.88■■□□□ 1.73
NPAS1-201ENST00000439365 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
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NPAS1-201ENST00000439365 SETDB2Q96T68 719 aa25.85■■□□□ 1.73
NPAS1-201ENST00000439365 CAMTA2O94983 1202 aa25.84■■□□□ 1.73
NPAS1-201ENST00000439365 C2CD5Q86YS7 1000 aa25.84■■□□□ 1.73
NPAS1-201ENST00000439365 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
NPAS1-201ENST00000439365 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
NPAS1-201ENST00000439365 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
NPAS1-201ENST00000439365 CARMIL3Q8ND23 1372 aa25.83■■□□□ 1.73
NPAS1-201ENST00000439365 H0YIN7 160 aa25.83■■□□□ 1.73
NPAS1-201ENST00000439365 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
NPAS1-201ENST00000439365 CCDC24Q8N4L8 307 aa25.82■■□□□ 1.72
NPAS1-201ENST00000439365 SCN7AQ01118 1682 aa25.81■■□□□ 1.72
NPAS1-201ENST00000439365 C9orf131Q5VYM1 1079 aa25.81■■□□□ 1.72
NPAS1-201ENST00000439365 TTLL6Q8N841 843 aa25.8■■□□□ 1.72
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.8■■□□□ 1.72
NPAS1-201ENST00000439365 NRXN2Q9P2S2 1712 aa25.8■■□□□ 1.72
NPAS1-201ENST00000439365 RIPK4P57078 832 aa25.79■■□□□ 1.72
NPAS1-201ENST00000439365 PRR5LQ6MZQ0 368 aa25.79■■□□□ 1.72
NPAS1-201ENST00000439365 CNBD1Q8NA66 436 aa25.79■■□□□ 1.72
NPAS1-201ENST00000439365 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.79■■□□□ 1.72
NPAS1-201ENST00000439365 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa25.78■■□□□ 1.72
NPAS1-201ENST00000439365 PDE6BP35913 854 aa25.78■■□□□ 1.72
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP25.78■■□□□ 1.72
NPAS1-201ENST00000439365 NBPF26B4DH59 902 aa25.77■■□□□ 1.72
NPAS1-201ENST00000439365 ST5P78524 1137 aa25.77■■□□□ 1.72
NPAS1-201ENST00000439365 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
NPAS1-201ENST00000439365 NGEFQ8N5V2 710 aa25.77■■□□□ 1.72
NPAS1-201ENST00000439365 NBPF15Q8N660 670 aa25.77■■□□□ 1.72
NPAS1-201ENST00000439365 BRIP1Q9BX63 1249 aa25.77■■□□□ 1.72
NPAS1-201ENST00000439365 RNF181Q9P0P0 153 aa25.77■■□□□ 1.72
NPAS1-201ENST00000439365 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.76■■□□□ 1.71
NPAS1-201ENST00000439365 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
NPAS1-201ENST00000439365 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.75■■□□□ 1.71
NPAS1-201ENST00000439365 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
NPAS1-201ENST00000439365 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.74■■□□□ 1.71
NPAS1-201ENST00000439365 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.74■■□□□ 1.71
NPAS1-201ENST00000439365 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.74■■□□□ 1.71
NPAS1-201ENST00000439365 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
NPAS1-201ENST00000439365 RASSF7Q02833 373 aa25.73■■□□□ 1.71
NPAS1-201ENST00000439365 NEUROD2Q15784 382 aa25.73■■□□□ 1.71
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
NPAS1-201ENST00000439365 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.73■■□□□ 1.71
NPAS1-201ENST00000439365 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
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