RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437051.5

SGO1-208, Transcript of shugoshin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SGO1, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1-208ENST00000437051 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.9■■□□□ 1.58
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SGO1-208ENST00000437051 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
SGO1-208ENST00000437051 KCNQ3O43525 872 aa24.88■■□□□ 1.57
SGO1-208ENST00000437051 HEG1Q9ULI3 1381 aa24.88■■□□□ 1.57
SGO1-208ENST00000437051 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa24.87■■□□□ 1.57
SGO1-208ENST00000437051 ZNF790Q6PG37 636 aa24.87■■□□□ 1.57
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SGO1-208ENST00000437051 CFAP53Q96M91 514 aa24.86■■□□□ 1.57
SGO1-208ENST00000437051 NARFQ9UHQ1 456 aa24.86■■□□□ 1.57
SGO1-208ENST00000437051 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
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SGO1-208ENST00000437051 BCS1LQ9Y276 419 aa24.84■■□□□ 1.57
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SGO1-208ENST00000437051 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.82■■□□□ 1.56
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SGO1-208ENST00000437051 FCHSD2O94868 740 aa24.79■■□□□ 1.56
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SGO1-208ENST00000437051 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.75■■□□□ 1.55
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SGO1-208ENST00000437051 USP16Q9Y5T5 823 aa24.75■■□□□ 1.55
SGO1-208ENST00000437051 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
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SGO1-208ENST00000437051 C9orf131Q5VYM1 1079 aa24.66■■□□□ 1.54
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SGO1-208ENST00000437051 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
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SGO1-208ENST00000437051 RNF181Q9P0P0 153 aa24.59■■□□□ 1.53
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SGO1-208ENST00000437051 HSPA6P17066 643 aa24.55■■□□□ 1.52
SGO1-208ENST00000437051 RALBP1Q15311 655 aa24.55■■□□□ 1.52
SGO1-208ENST00000437051 SETDB2Q96T68 719 aa24.55■■□□□ 1.52
SGO1-208ENST00000437051 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa24.55■■□□□ 1.52
SGO1-208ENST00000437051 HLFQ16534 295 aa24.54■■□□□ 1.52
SGO1-208ENST00000437051 CNBD1Q8NA66 436 aa24.54■■□□□ 1.52
SGO1-208ENST00000437051 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
SGO1-208ENST00000437051 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.53■■□□□ 1.52
SGO1-208ENST00000437051 PDE6BP35913 854 aa24.52■■□□□ 1.52
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