RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434333.1

HLA-B-250, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF790Q6PG37 636 aa26.96■■□□□ 1.91
HLA-B-250ENST00000434333 TTC5Q8N0Z6 440 aa26.96■■□□□ 1.91
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
HLA-B-250ENST00000434333 NUDCQ9Y266 331 aa26.96■■□□□ 1.91
HLA-B-250ENST00000434333 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
HLA-B-250ENST00000434333 KCNA3P22001 575 aa26.95■■□□□ 1.9
HLA-B-250ENST00000434333 HEG1Q9ULI3 1381 aa26.95■■□□□ 1.9
HLA-B-250ENST00000434333 NARFQ9UHQ1 456 aa26.94■■□□□ 1.9
HLA-B-250ENST00000434333 ZPR1O75312 459 aa26.93■■□□□ 1.9
HLA-B-250ENST00000434333 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
HLA-B-250ENST00000434333 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
HLA-B-250ENST00000434333 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.93■■□□□ 1.9
HLA-B-250ENST00000434333 BCL2L12Q9HB09 334 aa26.93■■□□□ 1.9
HLA-B-250ENST00000434333 BCS1LQ9Y276 419 aa26.93■■□□□ 1.9
HLA-B-250ENST00000434333 NRXN2Q9P2S2 1712 aa26.91■■□□□ 1.9
HLA-B-250ENST00000434333 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
HLA-B-250ENST00000434333 FCHSD2O94868 740 aa26.91■■□□□ 1.9
HLA-B-250ENST00000434333 CANXP27824 592 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
HLA-B-250ENST00000434333 EIF5P55010 431 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
HLA-B-250ENST00000434333 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa26.89■■□□□ 1.9
HLA-B-250ENST00000434333 KCNQ3O43525 872 aa26.89■■□□□ 1.9
HLA-B-250ENST00000434333 STARD3NLO95772 234 aa26.89■■□□□ 1.9
HLA-B-250ENST00000434333 NFIXQ14938 502 aa26.89■■□□□ 1.9
HLA-B-250ENST00000434333 FMNL2Q96PY5 1086 aa26.87■■□□□ 1.89
HLA-B-250ENST00000434333 SCN7AQ01118 1682 aa26.86■■□□□ 1.89
HLA-B-250ENST00000434333 BTBD11A6QL63 1104 aa26.86■■□□□ 1.89
HLA-B-250ENST00000434333 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
HLA-B-250ENST00000434333 CHRNA5P30532 468 aa26.84■■□□□ 1.89
HLA-B-250ENST00000434333 MCM10Q7L590 875 aa26.84■■□□□ 1.89
HLA-B-250ENST00000434333 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
HLA-B-250ENST00000434333 PIM2Q9P1W9 311 aa26.84■■□□□ 1.89
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
HLA-B-250ENST00000434333 DCTN1Q14203 1278 aa26.82■■□□□ 1.88
HLA-B-250ENST00000434333 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.81■■□□□ 1.88
HLA-B-250ENST00000434333 A1BGP04217 495 aa26.81■■□□□ 1.88
HLA-B-250ENST00000434333 SERPINB2P05120 415 aa26.81■■□□□ 1.88
HLA-B-250ENST00000434333 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
HLA-B-250ENST00000434333 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa26.81■■□□□ 1.88
HLA-B-250ENST00000434333 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
HLA-B-250ENST00000434333 A0A087WZG4 1122 aa26.8■■□□□ 1.88
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HLA-B-250ENST00000434333 CARMIL3Q8ND23 1372 aa26.8■■□□□ 1.88
HLA-B-250ENST00000434333 DLEC1Q9Y238 1755 aa26.79■■□□□ 1.88
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HLA-B-250ENST00000434333 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
HLA-B-250ENST00000434333 USP16Q9Y5T5 823 aa26.79■■□□□ 1.88
HLA-B-250ENST00000434333 DLG5Q8TDM6 1919 aa26.78■■□□□ 1.88
HLA-B-250ENST00000434333 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa26.78■■□□□ 1.88
HLA-B-250ENST00000434333 BCORQ6W2J9 1755 aa26.77■■□□□ 1.88
HLA-B-250ENST00000434333 TBC1D9BQ66K14 1250 aa26.77■■□□□ 1.88
HLA-B-250ENST00000434333 PLEKHF1Q96S99 279 aa26.77■■□□□ 1.88
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
HLA-B-250ENST00000434333 BICDL1Q6ZP65 573 aa26.76■■□□□ 1.87
HLA-B-250ENST00000434333 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa26.75■■□□□ 1.87
HLA-B-250ENST00000434333 CAMTA2O94983 1202 aa26.74■■□□□ 1.87
HLA-B-250ENST00000434333 KIF3CO14782 793 aa26.73■■□□□ 1.87
HLA-B-250ENST00000434333 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
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HLA-B-250ENST00000434333 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
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HLA-B-250ENST00000434333 LAMB4A4D0S4 1761 aa26.69■■□□□ 1.86
HLA-B-250ENST00000434333 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
HLA-B-250ENST00000434333 PRR5LQ6MZQ0 368 aa26.69■■□□□ 1.86
HLA-B-250ENST00000434333 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.69■■□□□ 1.86
HLA-B-250ENST00000434333 NBPF26B4DH59 902 aa26.68■■□□□ 1.86
HLA-B-250ENST00000434333 NFE2L2Q16236 605 aa26.68■■□□□ 1.86
HLA-B-250ENST00000434333 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
HLA-B-250ENST00000434333 C2CD5Q86YS7 1000 aa26.68■■□□□ 1.86
HLA-B-250ENST00000434333 NBPF15Q8N660 670 aa26.68■■□□□ 1.86
HLA-B-250ENST00000434333 CEP350Q5VT06 3117 aa26.67■■□□□ 1.86
HLA-B-250ENST00000434333 NEFMP07197 916 aa26.67■■□□□ 1.86
HLA-B-250ENST00000434333 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
HLA-B-250ENST00000434333 RALBP1Q15311 655 aa26.66■■□□□ 1.86
HLA-B-250ENST00000434333 CCDC24Q8N4L8 307 aa26.66■■□□□ 1.86
HLA-B-250ENST00000434333 H0YIN7 160 aa26.65■■□□□ 1.86
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HLA-B-250ENST00000434333 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
HLA-B-250ENST00000434333 BRIP1Q9BX63 1249 aa26.65■■□□□ 1.86
HLA-B-250ENST00000434333 RNF181Q9P0P0 153 aa26.65■■□□□ 1.86
HLA-B-250ENST00000434333 RASSF7Q02833 373 aa26.64■■□□□ 1.86
HLA-B-250ENST00000434333 SETDB2Q96T68 719 aa26.64■■□□□ 1.86
HLA-B-250ENST00000434333 PRELPP51888 382 aa26.63■■□□□ 1.85
HLA-B-250ENST00000434333 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
HLA-B-250ENST00000434333 NMRK2Q9NPI5 230 aa26.63■■□□□ 1.85
HLA-B-250ENST00000434333 CLEC4GQ6UXB4 293 aa26.62■■□□□ 1.85
HLA-B-250ENST00000434333 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
HLA-B-250ENST00000434333 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.62■■□□□ 1.85
HLA-B-250ENST00000434333 PDE6BP35913 854 aa26.61■■□□□ 1.85
HLA-B-250ENST00000434333 CNBD1Q8NA66 436 aa26.61■■□□□ 1.85
HLA-B-250ENST00000434333 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
HLA-B-250ENST00000434333 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.61■■□□□ 1.85
HLA-B-250ENST00000434333 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
HLA-B-250ENST00000434333 RGL2O15211 777 aa26.59■■□□□ 1.85
HLA-B-250ENST00000434333 HSPA6P17066 643 aa26.59■■□□□ 1.85
HLA-B-250ENST00000434333 NFKBIEO00221 500 aa26.58■■□□□ 1.85
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP26.57■■□□□ 1.84
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF652Q9Y2D9 606 aa26.57■■□□□ 1.84
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