RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427407.5

DGCR6-203, Transcript of DiGeorge syndrome critical region gene 6, humanhuman

TSL 5

Gene DGCR6, Length 1,199 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DGCR6-203ENST00000427407 TM4SF1P30408 202 aa28.1■■■□□ 2.09
DGCR6-203ENST00000427407 USPL1Q5W0Q7 1092 aa28.1■■■□□ 2.09
DGCR6-203ENST00000427407 NARFQ9UHQ1 456 aa28.1■■■□□ 2.09
DGCR6-203ENST00000427407 HEG1Q9ULI3 1381 aa28.1■■■□□ 2.09
DGCR6-203ENST00000427407 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
DGCR6-203ENST00000427407 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
DGCR6-203ENST00000427407 ADCY9O60503 1353 aa28.09■■■□□ 2.09
DGCR6-203ENST00000427407 DPEP1P16444 411 aa28.08■■■□□ 2.09
DGCR6-203ENST00000427407 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
DGCR6-203ENST00000427407 ATP10DQ9P241 1426 aa28.07■■■□□ 2.08
DGCR6-203ENST00000427407 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
DGCR6-203ENST00000427407 C1QTNF8P60827 252 aa28.06■■■□□ 2.08
DGCR6-203ENST00000427407 FMNL2Q96PY5 1086 aa28.06■■■□□ 2.08
DGCR6-203ENST00000427407 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
DGCR6-203ENST00000427407 CANXP27824 592 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
DGCR6-203ENST00000427407 EIF5P55010 431 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
DGCR6-203ENST00000427407 BCS1LQ9Y276 419 aa28.05■■■□□ 2.08
DGCR6-203ENST00000427407 BTBD11A6QL63 1104 aa28.04■■■□□ 2.08
DGCR6-203ENST00000427407 KCNA3P22001 575 aa28.04■■■□□ 2.08
DGCR6-203ENST00000427407 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
DGCR6-203ENST00000427407 BCL2L12Q9HB09 334 aa28.04■■■□□ 2.08
DGCR6-203ENST00000427407 A0A087WZG4 1122 aa28.03■■■□□ 2.08
DGCR6-203ENST00000427407 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
DGCR6-203ENST00000427407 NFIXQ14938 502 aa28.02■■■□□ 2.08
DGCR6-203ENST00000427407 KCNQ3O43525 872 aa28■■■□□ 2.07
DGCR6-203ENST00000427407 MCM10Q7L590 875 aa28■■■□□ 2.07
DGCR6-203ENST00000427407 PIM2Q9P1W9 311 aa28■■■□□ 2.07
DGCR6-203ENST00000427407 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
DGCR6-203ENST00000427407 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
DGCR6-203ENST00000427407 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
DGCR6-203ENST00000427407 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
DGCR6-203ENST00000427407 A1BGP04217 495 aa27.95■■■□□ 2.06
DGCR6-203ENST00000427407 SERPINB2P05120 415 aa27.95■■■□□ 2.06
DGCR6-203ENST00000427407 NEFMP07197 916 aa27.95■■■□□ 2.06
DGCR6-203ENST00000427407 CHRNA5P30532 468 aa27.95■■■□□ 2.06
DGCR6-203ENST00000427407 DCTN1Q14203 1278 aa27.95■■■□□ 2.06
DGCR6-203ENST00000427407 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa27.95■■■□□ 2.06
DGCR6-203ENST00000427407 NRXN2Q9P2S2 1712 aa27.95■■■□□ 2.06
DGCR6-203ENST00000427407 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
DGCR6-203ENST00000427407 PLEKHF1Q96S99 279 aa27.92■■■□□ 2.06
DGCR6-203ENST00000427407 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
DGCR6-203ENST00000427407 USP16Q9Y5T5 823 aa27.92■■■□□ 2.06
DGCR6-203ENST00000427407 RALBP1Q15311 655 aa27.91■■■□□ 2.06
DGCR6-203ENST00000427407 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
DGCR6-203ENST00000427407 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
DGCR6-203ENST00000427407 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa27.91■■■□□ 2.06
DGCR6-203ENST00000427407 SCN7AQ01118 1682 aa27.91■■■□□ 2.06
DGCR6-203ENST00000427407 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
DGCR6-203ENST00000427407 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa27.9■■■□□ 2.06
DGCR6-203ENST00000427407 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
DGCR6-203ENST00000427407 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.89■■■□□ 2.06
DGCR6-203ENST00000427407 TBC1D9BQ66K14 1250 aa27.89■■■□□ 2.06
DGCR6-203ENST00000427407 BICDL1Q6ZP65 573 aa27.89■■■□□ 2.06
DGCR6-203ENST00000427407 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
DGCR6-203ENST00000427407 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa27.88■■■□□ 2.05
DGCR6-203ENST00000427407 CAMTA2O94983 1202 aa27.88■■■□□ 2.05
DGCR6-203ENST00000427407 NFE2L2Q16236 605 aa27.87■■■□□ 2.05
DGCR6-203ENST00000427407 CARMIL3Q8ND23 1372 aa27.86■■■□□ 2.05
DGCR6-203ENST00000427407 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
DGCR6-203ENST00000427407 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
DGCR6-203ENST00000427407 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa27.84■■■□□ 2.05
DGCR6-203ENST00000427407 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
DGCR6-203ENST00000427407 C9orf131Q5VYM1 1079 aa27.83■■■□□ 2.05
DGCR6-203ENST00000427407 C2CD5Q86YS7 1000 aa27.83■■■□□ 2.05
DGCR6-203ENST00000427407 H0YIN7 160 aa27.82■■■□□ 2.04
DGCR6-203ENST00000427407 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
DGCR6-203ENST00000427407 SETDB2Q96T68 719 aa27.82■■■□□ 2.04
DGCR6-203ENST00000427407 MIS18AQ9NYP9 233 aa27.82■■■□□ 2.04
DGCR6-203ENST00000427407 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa27.82■■■□□ 2.04
DGCR6-203ENST00000427407 PRR5LQ6MZQ0 368 aa27.81■■■□□ 2.04
DGCR6-203ENST00000427407 CLEC4GQ6UXB4 293 aa27.81■■■□□ 2.04
DGCR6-203ENST00000427407 TTLL6Q8N841 843 aa27.81■■■□□ 2.04
DGCR6-203ENST00000427407 BRIP1Q9BX63 1249 aa27.81■■■□□ 2.04
DGCR6-203ENST00000427407 NBPF26B4DH59 902 aa27.8■■■□□ 2.04
DGCR6-203ENST00000427407 KIF3CO14782 793 aa27.8■■■□□ 2.04
DGCR6-203ENST00000427407 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
DGCR6-203ENST00000427407 NBPF15Q8N660 670 aa27.8■■■□□ 2.04
DGCR6-203ENST00000427407 DLEC1Q9Y238 1755 aa27.8■■■□□ 2.04
DGCR6-203ENST00000427407 DLG5Q8TDM6 1919 aa27.79■■■□□ 2.04
DGCR6-203ENST00000427407 BCORQ6W2J9 1755 aa27.79■■■□□ 2.04
DGCR6-203ENST00000427407 RGL2O15211 777 aa27.79■■■□□ 2.04
DGCR6-203ENST00000427407 PDE6BP35913 854 aa27.79■■■□□ 2.04
DGCR6-203ENST00000427407 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
DGCR6-203ENST00000427407 CNBD1Q8NA66 436 aa27.78■■■□□ 2.04
DGCR6-203ENST00000427407 ZNF652Q9Y2D9 606 aa27.78■■■□□ 2.04
DGCR6-203ENST00000427407 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
DGCR6-203ENST00000427407 RNF181Q9P0P0 153 aa27.77■■■□□ 2.04
DGCR6-203ENST00000427407 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
DGCR6-203ENST00000427407 KDM3BQ7LBC6 1761 aa27.76■■■□□ 2.03
DGCR6-203ENST00000427407 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa27.74■■■□□ 2.03
DGCR6-203ENST00000427407 ST5P78524 1137 aa27.74■■■□□ 2.03
DGCR6-203ENST00000427407 CCDC24Q8N4L8 307 aa27.74■■■□□ 2.03
DGCR6-203ENST00000427407 NPHP1O15259 732 aa27.73■■■□□ 2.03
DGCR6-203ENST00000427407 LAMB4A4D0S4 1761 aa27.73■■■□□ 2.03
DGCR6-203ENST00000427407 RASSF7Q02833 373 aa27.72■■■□□ 2.03
DGCR6-203ENST00000427407 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP27.72■■■□□ 2.03
DGCR6-203ENST00000427407 RIPK4P57078 832 aa27.71■■■□□ 2.03
DGCR6-203ENST00000427407 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
DGCR6-203ENST00000427407 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
DGCR6-203ENST00000427407 LMNB1P20700 586 aa27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms