RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.2■■□□□ 1.14
RALGPS1-208ENST00000424082 CUL4AQ13619 759 aa22.2■■□□□ 1.14
RALGPS1-208ENST00000424082 SBNO1A3KN83 1393 aa22.2■■□□□ 1.14
RALGPS1-208ENST00000424082 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
RALGPS1-208ENST00000424082 CHMLP26374 656 aa22.19■■□□□ 1.14
RALGPS1-208ENST00000424082 NECTIN2Q92692 538 aa22.19■■□□□ 1.14
RALGPS1-208ENST00000424082 FLT4P35916 1363 aa22.19■■□□□ 1.14
RALGPS1-208ENST00000424082 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
RALGPS1-208ENST00000424082 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
RALGPS1-208ENST00000424082 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.19■■□□□ 1.14
RALGPS1-208ENST00000424082 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
RALGPS1-208ENST00000424082 MCCP23508 829 aa22.18■■□□□ 1.14
RALGPS1-208ENST00000424082 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
RALGPS1-208ENST00000424082 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
RALGPS1-208ENST00000424082 STK31Q9BXU1 1019 aa22.18■■□□□ 1.14
RALGPS1-208ENST00000424082 FLIIQ13045 1269 aa22.18■■□□□ 1.14
RALGPS1-208ENST00000424082 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
RALGPS1-208ENST00000424082 ORAI2Q96SN7 254 aa22.18■■□□□ 1.14
RALGPS1-208ENST00000424082 ARID3AQ99856 593 aa22.17■■□□□ 1.14
RALGPS1-208ENST00000424082 ARHGEF10O15013 1369 aa22.16■■□□□ 1.14
RALGPS1-208ENST00000424082 IL25Q9H293 177 aa22.16■■□□□ 1.14
RALGPS1-208ENST00000424082 EYA1Q99502 592 aa22.16■■□□□ 1.14
RALGPS1-208ENST00000424082 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.16■■□□□ 1.14
RALGPS1-208ENST00000424082 ANAPC15P60006 121 aa22.15■■□□□ 1.14
RALGPS1-208ENST00000424082 MYRIPQ8NFW9 859 aa22.15■■□□□ 1.14
RALGPS1-208ENST00000424082 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
RALGPS1-208ENST00000424082 GNAI3P08754 354 aa22.14■■□□□ 1.14
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP8B2P98198 1209 aa22.14■■□□□ 1.14
RALGPS1-208ENST00000424082 PSME1Q06323 249 aa22.14■■□□□ 1.14
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
RALGPS1-208ENST00000424082 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
RALGPS1-208ENST00000424082 HOXC9P31274 260 aa22.13■■□□□ 1.13
RALGPS1-208ENST00000424082 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
RALGPS1-208ENST00000424082 PLEKHG5O94827 1062 aa22.13■■□□□ 1.13
RALGPS1-208ENST00000424082 PHF14O94880 888 aa22.13■■□□□ 1.13
RALGPS1-208ENST00000424082 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.13■■□□□ 1.13
RALGPS1-208ENST00000424082 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
RALGPS1-208ENST00000424082 STAP2Q9UGK3 403 aa22.12■■□□□ 1.13
RALGPS1-208ENST00000424082 UVSSAQ2YD98 709 aa22.11■■□□□ 1.13
RALGPS1-208ENST00000424082 KDRP35968 1356 aa22.11■■□□□ 1.13
RALGPS1-208ENST00000424082 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.11■■□□□ 1.13
RALGPS1-208ENST00000424082 HSPA2P54652 639 aa22.1■■□□□ 1.13
RALGPS1-208ENST00000424082 USP48Q86UV5 1035 aa22.1■■□□□ 1.13
RALGPS1-208ENST00000424082 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.1■■□□□ 1.13
RALGPS1-208ENST00000424082 NWD1Q149M9 1564 aa22.1■■□□□ 1.13
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.1■■□□□ 1.13
RALGPS1-208ENST00000424082 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.1■■□□□ 1.13
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
RALGPS1-208ENST00000424082 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
RALGPS1-208ENST00000424082 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.09■■□□□ 1.13
RALGPS1-208ENST00000424082 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.09■■□□□ 1.13
RALGPS1-208ENST00000424082 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.09■■□□□ 1.13
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
RALGPS1-208ENST00000424082 USP44Q9H0E7 712 aa22.09■■□□□ 1.13
RALGPS1-208ENST00000424082 TCHHQ07283 1943 aa22.08■■□□□ 1.13
RALGPS1-208ENST00000424082 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.08■■□□□ 1.13
RALGPS1-208ENST00000424082 MPNDQ8N594 471 aa22.08■■□□□ 1.13
RALGPS1-208ENST00000424082 USP54Q70EL1 1684 aa22.08■■□□□ 1.13
RALGPS1-208ENST00000424082 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
RALGPS1-208ENST00000424082 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
RALGPS1-208ENST00000424082 HSPA4P34932 840 aa22.06■■□□□ 1.12
RALGPS1-208ENST00000424082 IL17RAQ96F46 866 aa22.06■■□□□ 1.12
RALGPS1-208ENST00000424082 USP25Q9UHP3 1055 aa22.06■■□□□ 1.12
RALGPS1-208ENST00000424082 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
RALGPS1-208ENST00000424082 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
RALGPS1-208ENST00000424082 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.06■■□□□ 1.12
RALGPS1-208ENST00000424082 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.06■■□□□ 1.12
RALGPS1-208ENST00000424082 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
RALGPS1-208ENST00000424082 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
RALGPS1-208ENST00000424082 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.05■■□□□ 1.12
RALGPS1-208ENST00000424082 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.05■■□□□ 1.12
RALGPS1-208ENST00000424082 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.04■■□□□ 1.12
RALGPS1-208ENST00000424082 TSC1Q92574 1164 aa22.04■■□□□ 1.12
RALGPS1-208ENST00000424082 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
RALGPS1-208ENST00000424082 ADCY5O95622 1261 aa22.04■■□□□ 1.12
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.04■■□□□ 1.12
RALGPS1-208ENST00000424082 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.04■■□□□ 1.12
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.04■■□□□ 1.12
RALGPS1-208ENST00000424082 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
RALGPS1-208ENST00000424082 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
RALGPS1-208ENST00000424082 NFAT5O94916 1531 aa22.03■■□□□ 1.12
RALGPS1-208ENST00000424082 AOX1Q06278 1338 aa22.03■■□□□ 1.12
RALGPS1-208ENST00000424082 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
RALGPS1-208ENST00000424082 IL17REQ8NFR9 667 aa22.03■■□□□ 1.12
RALGPS1-208ENST00000424082 SSH3Q8TE77 659 aa22.03■■□□□ 1.12
RALGPS1-208ENST00000424082 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
RALGPS1-208ENST00000424082 LTN1O94822 1766 aa22.03■■□□□ 1.12
RALGPS1-208ENST00000424082 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.02■■□□□ 1.12
RALGPS1-208ENST00000424082 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
RALGPS1-208ENST00000424082 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.02■■□□□ 1.12
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRC37A3O60309 1634 aa22.02■■□□□ 1.12
RALGPS1-208ENST00000424082 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.02■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 SPTLC3Q9NUV7 552 aa22.02■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 RAD50Q92878 1312 aa22.01■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.01■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.01■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms