RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 NEFLP07196 543 aa21.63■■□□□ 1.05
TOP3BP1-201ENST00000420768 MS4A1P11836 297 aa21.63■■□□□ 1.05
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATP6V1AP38606 617 aa21.63■■□□□ 1.05
TOP3BP1-201ENST00000420768 DNAJC10Q8IXB1 793 aa21.63■■□□□ 1.05
TOP3BP1-201ENST00000420768 HYPKQ9NX55 129 aa21.63■■□□□ 1.05
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLIN1O60240 522 aa21.62■■□□□ 1.05
TOP3BP1-201ENST00000420768 PDE3AQ14432 1141 aa21.61■■□□□ 1.05
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa21.61■■□□□ 1.05
TOP3BP1-201ENST00000420768 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
TOP3BP1-201ENST00000420768 PDIA6Q15084 440 aa21.61■■□□□ 1.05
TOP3BP1-201ENST00000420768 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
TOP3BP1-201ENST00000420768 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
TOP3BP1-201ENST00000420768 FLIIQ13045 1269 aa21.6■■□□□ 1.05
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRIM27P14373 513 aa21.59■■□□□ 1.05
TOP3BP1-201ENST00000420768 C5P01031 1676 aa21.58■■□□□ 1.05
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLSCR1O15162 318 aa21.58■■□□□ 1.04
TOP3BP1-201ENST00000420768 ITPK1Q13572 414 aa21.58■■□□□ 1.04
TOP3BP1-201ENST00000420768 G2E3Q7L622 706 aa21.58■■□□□ 1.04
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
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TOP3BP1-201ENST00000420768 PROSER3Q2NL68 480 aa21.57■■□□□ 1.04
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.57■■□□□ 1.04
TOP3BP1-201ENST00000420768 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
TOP3BP1-201ENST00000420768 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
TOP3BP1-201ENST00000420768 BTAF1O14981 1849 aa21.57■■□□□ 1.04
TOP3BP1-201ENST00000420768 SBF2Q86WG5 1849 aa21.57■■□□□ 1.04
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF831Q5JPB2 1677 aa21.56■■□□□ 1.04
TOP3BP1-201ENST00000420768 LAMB4A4D0S4 1761 aa21.56■■□□□ 1.04
TOP3BP1-201ENST00000420768 NBPF26B4DH59 902 aa21.56■■□□□ 1.04
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYL6BP14649 208 aa21.56■■□□□ 1.04
TOP3BP1-201ENST00000420768 NBPF14Q5TI25 921 aa21.56■■□□□ 1.04
TOP3BP1-201ENST00000420768 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.56■■□□□ 1.04
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TOP3BP1-201ENST00000420768 NBPF15Q8N660 670 aa21.56■■□□□ 1.04
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TOP3BP1-201ENST00000420768 APBA3O96018 575 aa21.55■■□□□ 1.04
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANXA1P04083 346 aa21.55■■□□□ 1.04
TOP3BP1-201ENST00000420768 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC87Q9NVE4 849 aa21.55■■□□□ 1.04
TOP3BP1-201ENST00000420768 CRKLP46109 303 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
TOP3BP1-201ENST00000420768 C20orf194Q5TEA3 1177 aa21.53■■□□□ 1.04
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.53■■□□□ 1.04
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABCC4O15439 1325 aa21.53■■□□□ 1.04
TOP3BP1-201ENST00000420768 TJP1Q07157 1748 aa21.53■■□□□ 1.04
TOP3BP1-201ENST00000420768 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
TOP3BP1-201ENST00000420768 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
TOP3BP1-201ENST00000420768 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
TOP3BP1-201ENST00000420768 COPS6Q7L5N1 327 aa21.52■■□□□ 1.04
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC00116Q8NCU8 138 aa21.52■■□□□ 1.04
TOP3BP1-201ENST00000420768 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.52■■□□□ 1.04
TOP3BP1-201ENST00000420768 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa21.52■■□□□ 1.04
TOP3BP1-201ENST00000420768 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 PANK1Q8TE04 598 aa21.51■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa21.51■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 TXNRD1Q16881 649 aa21.5■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.5■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 KSR2Q6VAB6 950 aa21.5■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 TNNQ9UQP3 1299 aa21.5■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 RLBP1P12271 317 aa21.49■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 FKBP8Q14318 412 aa21.49■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 PI4KAP2A4QPH2 592 aa21.48■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 KCNQ4P56696 695 aa21.48■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.48■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC125Q86Z20 511 aa21.48■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa21.48■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRRC4BQ9NT99 713 aa21.48■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 LY75O60449 1722 aa21.48■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCT4P50991 539 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 EIF5P55010 431 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 MVPQ14764 893 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.48■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 DNAAF4Q8WXU2 420 aa21.48■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 F6X3S4 739 aa21.47■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.47■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 PROM2Q8N271 834 aa21.47■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM57Q8N5G2 664 aa21.47■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 CRBNQ96SW2 442 aa21.47■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 COG6Q9Y2V7 657 aa21.47■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 PXDNLA1KZ92 1463 aa21.47■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADCY9O60503 1353 aa21.46■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.46■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21.46■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.46■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa21.46■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPS6KA4O75676 772 aa21.45■■□□□ 1.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 BAG6P46379 1132 aa21.45■■□□□ 1.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 AAMPQ13685 434 aa21.45■■□□□ 1.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC4A10Q6U841 1118 aa21.45■■□□□ 1.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 KAT6BQ8WYB5 2073 aa21.45■■□□□ 1.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A087WZG4 1122 aa21.44■■□□□ 1.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.44■■□□□ 1.02
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