RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417381.5

TTC28-AS1-201, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 552 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-201ENST00000417381 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-201ENST00000417381 DUSP27Q5VZP5 1158 aa7.84□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-201ENST00000417381 ZNF790Q6PG37 636 aa7.84□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-201ENST00000417381 CCDC146Q8IYE0 955 aa7.84□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-201ENST00000417381 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-201ENST00000417381 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-201ENST00000417381 SCN11AQ9UI33 1791 aa7.84□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-201ENST00000417381 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa7.84□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 UBR3Q6ZT12 1888 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 BTBD11A6QL63 1104 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 APAF1O14727 1248 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 STARD3NLO95772 234 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 NEFMP07197 916 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 SLFN5Q08AF3 891 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 MCM10Q7L590 875 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 KCPQ6ZWJ8 1503 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 E9PSI1 815 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 KCNQ3O43525 872 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 ZPR1O75312 459 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 DCTN1Q14203 1278 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 RUNDC1Q96C34 613 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 FMNL2Q96PY5 1086 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 PLEKHF1Q96S99 279 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 HEG1Q9ULI3 1381 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 GRIN3BO60391 1043 aa7.81□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 CANXP27824 592 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 CCDC27Q2M243 656 aa7.81□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.81□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 CCDC136Q96JN2 1154 aa7.81□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 NARFQ9UHQ1 456 aa7.81□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa7.81□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 PARP3Q9Y6F1 533 aa7.81□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 A0A087WZG4 1122 aa7.8□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 TM4SF1P30408 202 aa7.8□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 EIF5P55010 431 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 TGFB2P61812 414 aa7.8□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 NFE2L2Q16236 605 aa7.8□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 TJP1Q07157 1748 aa7.8□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 DLG5Q8TDM6 1919 aa7.8□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa7.79□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 A0A0G2JLW4 131 aa7.79□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 A1BGP04217 495 aa7.79□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 DDR1Q08345 913 aa7.79□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 WWC1Q8IX03 1113 aa7.79□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 EXOC6Q8TAG9 804 aa7.79□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 MIS18AQ9NYP9 233 aa7.79□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 WWC3Q9ULE0 1092 aa7.79□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 USP16Q9Y5T5 823 aa7.79□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 COL15A1P39059 1388 aa7.79□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa7.78□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 DPEP1P16444 411 aa7.78□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 NFIXQ14938 502 aa7.78□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 WDR63Q8IWG1 891 aa7.78□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 BCL2L12Q9HB09 334 aa7.78□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 C10orf71Q711Q0 1435 aa7.78□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-201ENST00000417381 KCNA3P22001 575 aa7.77□□□□□ -1.17
TTC28-AS1-201ENST00000417381 RIPK4P57078 832 aa7.77□□□□□ -1.17
TTC28-AS1-201ENST00000417381 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa7.77□□□□□ -1.17
TTC28-AS1-201ENST00000417381 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
TTC28-AS1-201ENST00000417381 UBR2Q8IWV8 1755 aa7.76□□□□□ -1.17
TTC28-AS1-201ENST00000417381 PXDNLA1KZ92 1463 aa7.76□□□□□ -1.17
TTC28-AS1-201ENST00000417381 C4AP0C0L4 1744 aa7.76□□□□□ -1.17
TTC28-AS1-201ENST00000417381 SERPINB2P05120 415 aa7.76□□□□□ -1.17
TTC28-AS1-201ENST00000417381 TMPOP42166 694 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
TTC28-AS1-201ENST00000417381 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
TTC28-AS1-201ENST00000417381 TBC1D9BQ66K14 1250 aa7.76□□□□□ -1.17
TTC28-AS1-201ENST00000417381 BICDL1Q6ZP65 573 aa7.76□□□□□ -1.17
TTC28-AS1-201ENST00000417381 CRBNQ96SW2 442 aa7.76□□□□□ -1.17
TTC28-AS1-201ENST00000417381 PIM2Q9P1W9 311 aa7.76□□□□□ -1.17
TTC28-AS1-201ENST00000417381 BCS1LQ9Y276 419 aa7.76□□□□□ -1.17
TTC28-AS1-201ENST00000417381 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
TTC28-AS1-201ENST00000417381 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
TTC28-AS1-201ENST00000417381 NBPF26B4DH59 902 aa7.75□□□□□ -1.17
TTC28-AS1-201ENST00000417381 PLIN1O60240 522 aa7.75□□□□□ -1.17
TTC28-AS1-201ENST00000417381 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
TTC28-AS1-201ENST00000417381 CAMTA2O94983 1202 aa7.75□□□□□ -1.17
TTC28-AS1-201ENST00000417381 CHRNA5P30532 468 aa7.75□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms