RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407117.6

ANKRD54-203, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-203ENST00000407117 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP36.97■■■■□ 3.51
ANKRD54-203ENST00000407117 FMNL2Q96PY5 1086 aa36.97■■■■□ 3.51
ANKRD54-203ENST00000407117 NARFQ9UHQ1 456 aa36.97■■■■□ 3.51
ANKRD54-203ENST00000407117 BTBD11A6QL63 1104 aa36.96■■■■□ 3.51
ANKRD54-203ENST00000407117 USPL1Q5W0Q7 1092 aa36.95■■■■□ 3.51
ANKRD54-203ENST00000407117 NEFMP07197 916 aa36.93■■■■□ 3.5
ANKRD54-203ENST00000407117 TM4SF1P30408 202 aa36.93■■■■□ 3.5
ANKRD54-203ENST00000407117 DDR1Q08345 913 aa36.93■■■■□ 3.5
ANKRD54-203ENST00000407117 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa36.93■■■■□ 3.5
ANKRD54-203ENST00000407117 CANXP27824 592 aaKnown RBP36.92■■■■□ 3.5
ANKRD54-203ENST00000407117 WWC3Q9ULE0 1092 aa36.92■■■■□ 3.5
ANKRD54-203ENST00000407117 RALBP1Q15311 655 aa36.91■■■■□ 3.5
ANKRD54-203ENST00000407117 A0A0G2JLW4 131 aa36.9■■■■□ 3.5
ANKRD54-203ENST00000407117 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP36.9■■■■□ 3.5
ANKRD54-203ENST00000407117 EIF5P55010 431 aaKnown RBP36.9■■■■□ 3.5
ANKRD54-203ENST00000407117 MCM10Q7L590 875 aa36.9■■■■□ 3.5
ANKRD54-203ENST00000407117 A0A087WZG4 1122 aa36.89■■■■□ 3.5
ANKRD54-203ENST00000407117 DPEP1P16444 411 aa36.87■■■■□ 3.49
ANKRD54-203ENST00000407117 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP36.86■■■■□ 3.49
ANKRD54-203ENST00000407117 KCNQ3O43525 872 aa36.85■■■■□ 3.49
ANKRD54-203ENST00000407117 BCL2L12Q9HB09 334 aa36.85■■■■□ 3.49
ANKRD54-203ENST00000407117 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP36.85■■■■□ 3.49
ANKRD54-203ENST00000407117 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP36.84■■■■□ 3.49
ANKRD54-203ENST00000407117 NFIXQ14938 502 aa36.84■■■■□ 3.49
ANKRD54-203ENST00000407117 BCS1LQ9Y276 419 aa36.84■■■■□ 3.49
ANKRD54-203ENST00000407117 DCTN1Q14203 1278 aa36.83■■■■□ 3.49
ANKRD54-203ENST00000407117 PLEKHF1Q96S99 279 aa36.83■■■■□ 3.49
ANKRD54-203ENST00000407117 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.48
ANKRD54-203ENST00000407117 ADCY9O60503 1353 aa36.8■■■■□ 3.48
ANKRD54-203ENST00000407117 KCNA3P22001 575 aa36.8■■■■□ 3.48
ANKRD54-203ENST00000407117 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP36.8■■■■□ 3.48
ANKRD54-203ENST00000407117 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP36.79■■■■□ 3.48
ANKRD54-203ENST00000407117 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP36.79■■■■□ 3.48
ANKRD54-203ENST00000407117 PIM2Q9P1W9 311 aa36.79■■■■□ 3.48
ANKRD54-203ENST00000407117 A1BGP04217 495 aa36.78■■■■□ 3.48
ANKRD54-203ENST00000407117 ATP10DQ9P241 1426 aa36.77■■■■□ 3.48
ANKRD54-203ENST00000407117 NFE2L2Q16236 605 aa36.77■■■■□ 3.48
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP36.77■■■■□ 3.48
ANKRD54-203ENST00000407117 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa36.77■■■■□ 3.48
ANKRD54-203ENST00000407117 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP36.76■■■■□ 3.48
ANKRD54-203ENST00000407117 USP16Q9Y5T5 823 aa36.76■■■■□ 3.48
ANKRD54-203ENST00000407117 SERPINB2P05120 415 aa36.75■■■■□ 3.47
ANKRD54-203ENST00000407117 NRXN2Q9P2S2 1712 aa36.75■■■■□ 3.47
ANKRD54-203ENST00000407117 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
ANKRD54-203ENST00000407117 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
ANKRD54-203ENST00000407117 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa36.73■■■■□ 3.47
ANKRD54-203ENST00000407117 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
ANKRD54-203ENST00000407117 SCN7AQ01118 1682 aa36.73■■■■□ 3.47
ANKRD54-203ENST00000407117 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
ANKRD54-203ENST00000407117 CHRNA5P30532 468 aa36.7■■■■□ 3.47
ANKRD54-203ENST00000407117 C1QTNF8P60827 252 aa36.7■■■■□ 3.47
ANKRD54-203ENST00000407117 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP36.7■■■■□ 3.47
ANKRD54-203ENST00000407117 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa36.69■■■■□ 3.46
ANKRD54-203ENST00000407117 BICDL1Q6ZP65 573 aa36.69■■■■□ 3.46
ANKRD54-203ENST00000407117 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa36.69■■■■□ 3.46
ANKRD54-203ENST00000407117 DLG5Q8TDM6 1919 aa36.69■■■■□ 3.46
ANKRD54-203ENST00000407117 TBC1D9BQ66K14 1250 aa36.68■■■■□ 3.46
ANKRD54-203ENST00000407117 CAMTA2O94983 1202 aa36.67■■■■□ 3.46
ANKRD54-203ENST00000407117 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP36.67■■■■□ 3.46
ANKRD54-203ENST00000407117 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
ANKRD54-203ENST00000407117 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa36.66■■■■□ 3.46
ANKRD54-203ENST00000407117 CARMIL3Q8ND23 1372 aa36.66■■■■□ 3.46
ANKRD54-203ENST00000407117 MIS18AQ9NYP9 233 aa36.65■■■■□ 3.46
ANKRD54-203ENST00000407117 SETDB2Q96T68 719 aa36.62■■■■□ 3.45
ANKRD54-203ENST00000407117 RGL2O15211 777 aa36.61■■■■□ 3.45
ANKRD54-203ENST00000407117 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
ANKRD54-203ENST00000407117 CLEC4GQ6UXB4 293 aa36.61■■■■□ 3.45
ANKRD54-203ENST00000407117 KDM3BQ7LBC6 1761 aa36.61■■■■□ 3.45
ANKRD54-203ENST00000407117 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
ANKRD54-203ENST00000407117 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa36.6■■■■□ 3.45
ANKRD54-203ENST00000407117 BCORQ6W2J9 1755 aa36.59■■■■□ 3.45
ANKRD54-203ENST00000407117 NBPF26B4DH59 902 aa36.59■■■■□ 3.45
ANKRD54-203ENST00000407117 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
ANKRD54-203ENST00000407117 NBPF15Q8N660 670 aa36.59■■■■□ 3.45
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF652Q9Y2D9 606 aa36.59■■■■□ 3.45
ANKRD54-203ENST00000407117 H0YIN7 160 aa36.58■■■■□ 3.45
ANKRD54-203ENST00000407117 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
ANKRD54-203ENST00000407117 C2CD5Q86YS7 1000 aa36.58■■■■□ 3.45
ANKRD54-203ENST00000407117 BRIP1Q9BX63 1249 aa36.58■■■■□ 3.45
ANKRD54-203ENST00000407117 RIPK4P57078 832 aa36.57■■■■□ 3.44
ANKRD54-203ENST00000407117 LMOD3Q0VAK6 560 aa36.57■■■■□ 3.44
ANKRD54-203ENST00000407117 PRR5LQ6MZQ0 368 aa36.57■■■■□ 3.44
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP36.57■■■■□ 3.44
ANKRD54-203ENST00000407117 LAMB4A4D0S4 1761 aa36.56■■■■□ 3.44
ANKRD54-203ENST00000407117 PDE6BP35913 854 aa36.56■■■■□ 3.44
ANKRD54-203ENST00000407117 TTLL6Q8N841 843 aa36.55■■■■□ 3.44
ANKRD54-203ENST00000407117 DLEC1Q9Y238 1755 aa36.55■■■■□ 3.44
ANKRD54-203ENST00000407117 TMPOP42166 694 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
ANKRD54-203ENST00000407117 CNBD1Q8NA66 436 aa36.54■■■■□ 3.44
ANKRD54-203ENST00000407117 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP36.53■■■■□ 3.44
ANKRD54-203ENST00000407117 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP36.52■■■■□ 3.44
ANKRD54-203ENST00000407117 BABAM1Q9NWV8 329 aa36.52■■■■□ 3.44
ANKRD54-203ENST00000407117 NPHP1O15259 732 aa36.51■■■■□ 3.44
ANKRD54-203ENST00000407117 C9orf131Q5VYM1 1079 aa36.51■■■■□ 3.44
ANKRD54-203ENST00000407117 ST5P78524 1137 aa36.5■■■■□ 3.43
ANKRD54-203ENST00000407117 TSPYL4Q9UJ04 414 aa36.5■■■■□ 3.43
ANKRD54-203ENST00000407117 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa36.48■■■■□ 3.43
ANKRD54-203ENST00000407117 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa36.47■■■■□ 3.43
ANKRD54-203ENST00000407117 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP36.47■■■■□ 3.43
ANKRD54-203ENST00000407117 RUNDC1Q96C34 613 aa36.47■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms