RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa26.57■■□□□ 1.84
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HOXD12-201ENST00000404162 POTECB2RU33 542 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXD12-201ENST00000404162 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
HOXD12-201ENST00000404162 NRXN2Q9P2S2 1712 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXD12-201ENST00000404162 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXD12-201ENST00000404162 TIAM2Q8IVF5 1701 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXD12-201ENST00000404162 DLEC1Q9Y238 1755 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXD12-201ENST00000404162 SCN11AQ9UI33 1791 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXD12-201ENST00000404162 NFKBIEO00221 500 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXD12-201ENST00000404162 SERPINB2P05120 415 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXD12-201ENST00000404162 TTLL6Q8N841 843 aa26.52■■□□□ 1.84
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HOXD12-201ENST00000404162 BCL2L12Q9HB09 334 aa26.51■■□□□ 1.83
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HOXD12-201ENST00000404162 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXD12-201ENST00000404162 C2CD5Q86YS7 1000 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXD12-201ENST00000404162 LGR6Q9HBX8 967 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXD12-201ENST00000404162 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXD12-201ENST00000404162 COL15A1P39059 1388 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXD12-201ENST00000404162 CARMIL3Q8ND23 1372 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXD12-201ENST00000404162 SLC39A6Q13433 755 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXD12-201ENST00000404162 H0YIN7 160 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXD12-201ENST00000404162 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXD12-201ENST00000404162 DPY19L2Q6NUT2 758 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXD12-201ENST00000404162 AKAP4Q5JQC9 854 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXD12-201ENST00000404162 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
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HOXD12-201ENST00000404162 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
HOXD12-201ENST00000404162 IL13P35225 146 aa26.41■■□□□ 1.82
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HOXD12-201ENST00000404162 ERFEQ4G0M1 354 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXD12-201ENST00000404162 CHADLQ6NUI6 762 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP26.4■■□□□ 1.82
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa26.39■■□□□ 1.82
HOXD12-201ENST00000404162 C21orf2O43822 256 aa26.39■■□□□ 1.82
HOXD12-201ENST00000404162 CANXP27824 592 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
HOXD12-201ENST00000404162 MORC1Q86VD1 984 aa26.39■■□□□ 1.82
HOXD12-201ENST00000404162 MRC1P22897 1456 aa26.38■■□□□ 1.81
HOXD12-201ENST00000404162 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
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HOXD12-201ENST00000404162 FOXN1O15353 648 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC24Q8N4L8 307 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXD12-201ENST00000404162 DDNO94850 711 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
HOXD12-201ENST00000404162 TBC1D9BQ66K14 1250 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXD12-201ENST00000404162 VSIG10Q8N0Z9 540 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXD12-201ENST00000404162 EIF5P55010 431 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
HOXD12-201ENST00000404162 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
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HOXD12-201ENST00000404162 PRR5LQ6MZQ0 368 aa26.32■■□□□ 1.8
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HOXD12-201ENST00000404162 HMOX1P09601 288 aa26.31■■□□□ 1.8
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HOXD12-201ENST00000404162 TAOK3Q9H2K8 898 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD12-201ENST00000404162 PRDM10Q9NQV6 1147 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD12-201ENST00000404162 A0A087WZG4 1122 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXD12-201ENST00000404162 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
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HOXD12-201ENST00000404162 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXD12-201ENST00000404162 PASKQ96RG2 1323 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXD12-201ENST00000404162 CACNA1SQ13698 1873 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXD12-201ENST00000404162 STARD3NLO95772 234 aa26.27■■□□□ 1.8
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HOXD12-201ENST00000404162 VEGFBP49765 207 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
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HOXD12-201ENST00000404162 LDHDQ86WU2 507 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD12-201ENST00000404162 CNKSR1Q969H4 720 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD12-201ENST00000404162 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
HOXD12-201ENST00000404162 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD12-201ENST00000404162 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
HOXD12-201ENST00000404162 STYK1Q6J9G0 422 aa26.23■■□□□ 1.79
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HOXD12-201ENST00000404162 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
HOXD12-201ENST00000404162 IQCA1LA6NCM1 817 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXD12-201ENST00000404162 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
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HOXD12-201ENST00000404162 AIDAQ96BJ3 306 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXD12-201ENST00000404162 SCN4AP35499 1836 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM88BA6NKF7 163 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXD12-201ENST00000404162 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
HOXD12-201ENST00000404162 HEG1Q9ULI3 1381 aa26.2■■□□□ 1.79
HOXD12-201ENST00000404162 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
HOXD12-201ENST00000404162 LBX1P52954 281 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXD12-201ENST00000404162 CNBD1Q8NA66 436 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXD12-201ENST00000404162 SETDB2Q96T68 719 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXD12-201ENST00000404162 WBP1LQ9NX94 342 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXD12-201ENST00000404162 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXD12-201ENST00000404162 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXD12-201ENST00000404162 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.19■■□□□ 1.78
HOXD12-201ENST00000404162 MASTLQ96GX5 879 aa26.19■■□□□ 1.78
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