RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
ATG4B-204ENST00000402096 ASAP1Q9ULH1 1129 aa26.03■■□□□ 1.76
ATG4B-204ENST00000402096 ABCC4O15439 1325 aa26.03■■□□□ 1.76
ATG4B-204ENST00000402096 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
ATG4B-204ENST00000402096 DDX19BQ9UMR2 479 aa26.03■■□□□ 1.76
ATG4B-204ENST00000402096 ANXA1P04083 346 aa26.02■■□□□ 1.76
ATG4B-204ENST00000402096 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
ATG4B-204ENST00000402096 RGS12O14924 1447 aa26.02■■□□□ 1.76
ATG4B-204ENST00000402096 ATG3Q9NT62 314 aa26.01■■□□□ 1.75
ATG4B-204ENST00000402096 USP16Q9Y5T5 823 aa26.01■■□□□ 1.75
ATG4B-204ENST00000402096 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
ATG4B-204ENST00000402096 SEPT12Q8IYM1 358 aa25.99■■□□□ 1.75
ATG4B-204ENST00000402096 F6X3S4 739 aa25.97■■□□□ 1.75
ATG4B-204ENST00000402096 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
ATG4B-204ENST00000402096 AAMPQ13685 434 aa25.97■■□□□ 1.75
ATG4B-204ENST00000402096 PROSER3Q2NL68 480 aa25.97■■□□□ 1.75
ATG4B-204ENST00000402096 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.97■■□□□ 1.75
ATG4B-204ENST00000402096 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP25.97■■□□□ 1.75
ATG4B-204ENST00000402096 HYPKQ9NX55 129 aa25.97■■□□□ 1.75
ATG4B-204ENST00000402096 MYL6BP14649 208 aa25.96■■□□□ 1.75
ATG4B-204ENST00000402096 FAM182BQ5T319 152 aa25.94■■□□□ 1.74
ATG4B-204ENST00000402096 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
ATG4B-204ENST00000402096 BRWD3Q6RI45 1802 aa25.94■■□□□ 1.74
ATG4B-204ENST00000402096 KCNQ2O43526 872 aa25.93■■□□□ 1.74
ATG4B-204ENST00000402096 PDIA6Q15084 440 aa25.93■■□□□ 1.74
ATG4B-204ENST00000402096 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
ATG4B-204ENST00000402096 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
ATG4B-204ENST00000402096 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
ATG4B-204ENST00000402096 VSIG10Q8N0Z9 540 aa25.93■■□□□ 1.74
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ATG4B-204ENST00000402096 CCT4P50991 539 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
ATG4B-204ENST00000402096 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
ATG4B-204ENST00000402096 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
ATG4B-204ENST00000402096 SBF2Q86WG5 1849 aa25.9■■□□□ 1.74
ATG4B-204ENST00000402096 ERBB4Q15303 1308 aa25.9■■□□□ 1.74
ATG4B-204ENST00000402096 TJP1Q07157 1748 aa25.9■■□□□ 1.74
ATG4B-204ENST00000402096 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
ATG4B-204ENST00000402096 DNAJC10Q8IXB1 793 aa25.9■■□□□ 1.74
ATG4B-204ENST00000402096 PXDNLA1KZ92 1463 aa25.89■■□□□ 1.74
ATG4B-204ENST00000402096 PI4KAP2A4QPH2 592 aa25.89■■□□□ 1.73
ATG4B-204ENST00000402096 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
ATG4B-204ENST00000402096 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
ATG4B-204ENST00000402096 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa25.89■■□□□ 1.73
ATG4B-204ENST00000402096 BTAF1O14981 1849 aa25.89■■□□□ 1.73
ATG4B-204ENST00000402096 A1BGP04217 495 aa25.88■■□□□ 1.73
ATG4B-204ENST00000402096 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.88■■□□□ 1.73
ATG4B-204ENST00000402096 DNAAF4Q8WXU2 420 aa25.87■■□□□ 1.73
ATG4B-204ENST00000402096 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
ATG4B-204ENST00000402096 PALLDQ8WX93 1383 aa25.87■■□□□ 1.73
ATG4B-204ENST00000402096 STARD3NLO95772 234 aa25.87■■□□□ 1.73
ATG4B-204ENST00000402096 XAGE3Q8WTP9 111 aa25.87■■□□□ 1.73
ATG4B-204ENST00000402096 ADCY9O60503 1353 aa25.86■■□□□ 1.73
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ATG4B-204ENST00000402096 COPS6Q7L5N1 327 aa25.86■■□□□ 1.73
ATG4B-204ENST00000402096 SLC4A9Q96Q91 983 aa25.86■■□□□ 1.73
ATG4B-204ENST00000402096 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.86■■□□□ 1.73
ATG4B-204ENST00000402096 NBPF26B4DH59 902 aa25.85■■□□□ 1.73
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ATG4B-204ENST00000402096 NBPF15Q8N660 670 aa25.85■■□□□ 1.73
ATG4B-204ENST00000402096 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa25.85■■□□□ 1.73
ATG4B-204ENST00000402096 KRT27Q7Z3Y8 459 aa25.83■■□□□ 1.73
ATG4B-204ENST00000402096 RIC3Q7Z5B4 369 aa25.83■■□□□ 1.73
ATG4B-204ENST00000402096 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.83■■□□□ 1.73
ATG4B-204ENST00000402096 ATP6V1AP38606 617 aa25.83■■□□□ 1.73
ATG4B-204ENST00000402096 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa25.83■■□□□ 1.73
ATG4B-204ENST00000402096 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.82■■□□□ 1.72
ATG4B-204ENST00000402096 SIK1P57059 783 aa25.82■■□□□ 1.72
ATG4B-204ENST00000402096 PTF1AQ7RTS3 328 aa25.82■■□□□ 1.72
ATG4B-204ENST00000402096 LRP10Q7Z4F1 713 aa25.82■■□□□ 1.72
ATG4B-204ENST00000402096 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa25.82■■□□□ 1.72
ATG4B-204ENST00000402096 RXRBP28702 533 aa25.81■■□□□ 1.72
ATG4B-204ENST00000402096 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
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ATG4B-204ENST00000402096 MEIS3Q99687 375 aa25.8■■□□□ 1.72
ATG4B-204ENST00000402096 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
ATG4B-204ENST00000402096 ATP10DQ9P241 1426 aa25.79■■□□□ 1.72
ATG4B-204ENST00000402096 KDM2BQ8NHM5 1336 aa25.79■■□□□ 1.72
ATG4B-204ENST00000402096 IGHDP01880 384 aa25.79■■□□□ 1.72
ATG4B-204ENST00000402096 BEND3Q5T5X7 828 aa25.79■■□□□ 1.72
ATG4B-204ENST00000402096 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa25.79■■□□□ 1.72
ATG4B-204ENST00000402096 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
ATG4B-204ENST00000402096 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
ATG4B-204ENST00000402096 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
ATG4B-204ENST00000402096 FAM196AQ6ZSG2 479 aa25.77■■□□□ 1.72
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF831Q5JPB2 1677 aa25.77■■□□□ 1.72
ATG4B-204ENST00000402096 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.77■■□□□ 1.72
ATG4B-204ENST00000402096 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.77■■□□□ 1.72
ATG4B-204ENST00000402096 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
ATG4B-204ENST00000402096 GNAI3P08754 354 aa25.75■■□□□ 1.71
ATG4B-204ENST00000402096 TTLL7Q6ZT98 887 aa25.75■■□□□ 1.71
ATG4B-204ENST00000402096 PLBD2Q8NHP8 589 aa25.75■■□□□ 1.71
ATG4B-204ENST00000402096 ITPK1Q13572 414 aa25.74■■□□□ 1.71
ATG4B-204ENST00000402096 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
ATG4B-204ENST00000402096 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa25.74■■□□□ 1.71
ATG4B-204ENST00000402096 ARXQ96QS3 562 aa25.74■■□□□ 1.71
ATG4B-204ENST00000402096 MYD88Q99836 296 aa25.74■■□□□ 1.71
ATG4B-204ENST00000402096 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
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