RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398741.5

PRAME-201, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-201ENST00000398741 STRCP1A6NGW2 1772 aa15.9■□□□□ 0.14
PRAME-201ENST00000398741 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
PRAME-201ENST00000398741 BRD1O95696 1058 aa15.9■□□□□ 0.14
PRAME-201ENST00000398741 MBD3O95983 291 aa15.9■□□□□ 0.14
PRAME-201ENST00000398741 SRGAP3O43295 1099 aa15.9■□□□□ 0.14
PRAME-201ENST00000398741 RHPN1Q8TCX5 695 aa15.9■□□□□ 0.14
PRAME-201ENST00000398741 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 POLA2Q14181 598 aa15.89■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 KIF1BPQ96EK5 621 aa15.89■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 CHAMP1Q96JM3 812 aa15.89■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 RBSNQ9H1K0 784 aa15.88■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 HOXB7P09629 217 aa15.88■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 ZSCAN30Q86W11 494 aa15.88■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 IP6K1Q92551 441 aa15.88■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 IL17RAQ96F46 866 aa15.88■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 PHF8Q9UPP1 1060 aa15.88■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa15.88■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa15.87■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 ZBTB7CA1YPR0 619 aa15.87■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 MSNP26038 577 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 HSPA4P34932 840 aa15.87■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 LRSAM1Q6UWE0 723 aa15.87■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 CNTROBQ8N137 903 aa15.87■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 DNAAF4Q8WXU2 420 aa15.87■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 CHPF2Q9P2E5 772 aa15.87■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa15.87■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 TMEM63CQ9P1W3 806 aa15.87■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 USP54Q70EL1 1684 aa15.86■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 SYCE3A1L190 88 aa15.86■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 TEFQ10587 303 aa15.86■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 PI4K2BQ8TCG2 481 aa15.86■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 LGR6Q9HBX8 967 aa15.86■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 CACNA1FO60840 1977 aa15.86■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 PI4KAP2A4QPH2 592 aa15.86■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 BEND3Q5T5X7 828 aa15.86■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 NBPF6Q5VWK0 638 aa15.86■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa15.86■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 NBPF4Q96M43 638 aa15.86■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa15.85■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 IL25Q9H293 177 aa15.85■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 RAD50Q92878 1312 aa15.85■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 BTBD11A6QL63 1104 aa15.84■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 SGSM2O43147 1006 aa15.84■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa15.84■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 HS1BP3Q53T59 392 aa15.83■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.13
PRAME-201ENST00000398741 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 AKAP4Q5JQC9 854 aa15.83■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 KCNH5Q8NCM2 988 aa15.83■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 KCNQ3O43525 872 aa15.82■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 PSME1Q06323 249 aa15.82■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 ANXA1P04083 346 aa15.82■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 PDLIM2Q96JY6 352 aa15.82■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 SNX14Q9Y5W7 946 aa15.82■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa15.81■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 TTC41PQ6P2S7 1318 aa15.81■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 C1orf141Q5JVX7 400 aa15.8■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa15.8■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 LTN1O94822 1766 aa15.8■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 PHF14O94880 888 aa15.8■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 ESCO1Q5FWF5 840 aa15.8■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 RUFY2Q8WXA3 655 aa15.8■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 GPATCH3Q96I76 525 aa15.8■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 ADCY9O60503 1353 aa15.8■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 NFAT5O94916 1531 aa15.8■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 PLEKHG5O94827 1062 aa15.79■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 AMOTQ4VCS5 1084 aa15.79■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 TSPY26PQ9H489 355 aa15.79■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 HDAC5Q9UQL6 1122 aa15.79■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 AK2P54819 239 aa15.79■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 GDPD2Q9HCC8 539 aa15.79■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 SPG7Q9UQ90 795 aa15.79■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 ALDH1L1O75891 902 aa15.78■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 MTX1Q13505 466 aa15.78■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 ERC1Q8IUD2 1116 aa15.78■□□□□ 0.12
PRAME-201ENST00000398741 RNF214Q8ND24 703 aa15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.8 ms