RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-202ENST00000380828 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-202ENST00000380828 VPS8Q8N3P4 1428 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-202ENST00000380828 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-202ENST00000380828 KCNA1Q09470 495 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-202ENST00000380828 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-202ENST00000380828 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
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RABGEF1-202ENST00000380828 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
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RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC141Q6ZP82 1450 aa8.19□□□□□ -1.1
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RABGEF1-202ENST00000380828 BLOC1S6Q9UL45 172 aa8.19□□□□□ -1.1
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RABGEF1-202ENST00000380828 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
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RABGEF1-202ENST00000380828 SASS6Q6UVJ0 657 aa8.17□□□□□ -1.1
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RABGEF1-202ENST00000380828 NEURL4Q96JN8 1562 aa8.16□□□□□ -1.1
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RABGEF1-202ENST00000380828 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 EVA1CP58658 441 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 CLUAP1Q96AJ1 413 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 A2ML1A8K2U0 1454 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 PIK3C2BO00750 1634 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 ERBINQ96RT1 1412 aa8.14□□□□□ -1.11
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