RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366607.4

TOMM20-201, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOMM20, Length 3,387 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM20-201ENST00000366607 STK31Q9BXU1 1019 aa13.68□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 GLI2P10070 1586 aa13.68□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 A0A087WWV3 80 aa13.68□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa13.68□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 PPFIA3O75145 1194 aa13.68□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 KCNJ4P48050 445 aa13.68□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 TRERF1Q96PN7 1200 aa13.68□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 EFCAB6Q5THR3 1501 aa13.68□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 CHL1O00533 1208 aa13.68□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 STK3Q13188 491 aa13.68□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa13.68□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 SNX14Q9Y5W7 946 aa13.68□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 ERICH4A6NGS2 130 aa13.67□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 LIG1P18858 919 aa13.67□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 CD163L1Q9NR16 1453 aa13.67□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa13.67□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 TNNT1P13805 278 aa13.66□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 ADCK5Q3MIX3 580 aa13.66□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 SPTLC3Q9NUV7 552 aa13.66□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa13.66□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa13.66□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 METP08581 1390 aa13.66□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 CCDC192P0DO97 292 aa13.66□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 HDGFP51858 240 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 ABTB2Q8N961 1025 aa13.66□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 TAOK2Q9UL54 1235 aa13.66□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa13.66□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 ADGRB3O60242 1522 aa13.65□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa13.65□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 ARID5BQ14865 1188 aa13.65□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 MYO3AQ8NEV4 1616 aa13.65□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 ACEP12821 1306 aa13.65□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 ANO6Q4KMQ2 910 aa13.65□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 OSBPL3Q9H4L5 887 aa13.65□□□□□ -0.22
TOMM20-201ENST00000366607 HSPA4P34932 840 aa13.65□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 ANXA1P04083 346 aa13.64□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP13.64□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 CCT4P50991 539 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 FLIIQ13045 1269 aa13.64□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 ZBTB9Q96C00 473 aa13.64□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 DACT1Q9NYF0 836 aa13.64□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 ANAPC15P60006 121 aa13.64□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa13.64□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 PTPRCP08575 1304 aa13.64□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 RGS12O14924 1447 aa13.64□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 PTH1RQ03431 593 aa13.63□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 TYRO3Q06418 890 aa13.63□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa13.63□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 TTC6Q86TZ1 520 aa13.63□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 NUP62CLQ9H1M0 184 aa13.63□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 TNMDQ9H2S6 317 aa13.63□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 PDRG1Q9NUG6 133 aa13.63□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 MTMR6Q9Y217 621 aa13.63□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 MROH1Q8NDA8 1641 aa13.63□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 SRGAP3O43295 1099 aa13.63□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 ATP8B2P98198 1209 aa13.63□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 ESCO1Q5FWF5 840 aa13.63□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa13.63□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 DDX11Q96FC9 970 aa13.63□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 DNAJC25Q9H1X3 360 aa13.63□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 MAP3K11Q16584 847 aa13.62□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa13.62□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 ABCC3O15438 1527 aa13.62□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 VWDEQ8N2E2 1590 aa13.62□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 CDC37L1Q7L3B6 337 aa13.62□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 CCDC112Q8NEF3 446 aa13.62□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 BICD2Q8TD16 824 aa13.62□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 CBX8Q9HC52 389 aa13.62□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 ST7Q9NRC1 585 aa13.62□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 DEPDC5O75140 1603 aa13.61□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 GNAI3P08754 354 aa13.61□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 FUCA2Q9BTY2 467 aa13.61□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 SGSM2O43147 1006 aa13.6□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 ME3Q16798 604 aa13.6□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 MRVI1Q9Y6F6 885 aa13.6□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 ZFYVE9O95405 1425 aa13.6□□□□□ -0.23
TOMM20-201ENST00000366607 USP27XA6NNY8 438 aa13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms