RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358071.8

RAD9B-201, Transcript of RAD9 checkpoint clamp component B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAD9B, Length 2,843 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9B-201ENST00000358071 XAGE3Q8WTP9 111 aa9.01□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 DCTPP1Q9H773 170 aa9.01□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa9.01□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 PTPRCP08575 1304 aa9.01□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 SRGAP3O43295 1099 aa9.01□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa9.01□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 IFNL2Q8IZJ0 200 aa9.01□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 ACSBG1Q96GR2 724 aa9.01□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 ASAP1Q9ULH1 1129 aa9.01□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 GNAI2P04899 355 aa9□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 DNAAF4Q8WXU2 420 aa9□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 IL25Q9H293 177 aa9□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 KIF24Q5T7B8 1368 aa9□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 COL18A1P39060 1754 aa9□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 SURF6O75683 361 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 EPHA10Q5JZY3 1008 aa9□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 BEND3Q5T5X7 828 aa9□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 ZBTB3Q9H5J0 574 aa9□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 CHGBP05060 677 aa8.99□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 TTLL7Q6ZT98 887 aa8.99□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 SYNE4Q8N205 404 aa8.99□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 MYD88Q99836 296 aa8.99□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa8.99□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 LRRC37A3O60309 1634 aa8.99□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 PTF1AQ7RTS3 328 aa8.99□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 RIC3Q7Z5B4 369 aa8.99□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 TTC5Q8N0Z6 440 aa8.99□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 C22orf23Q9BZE7 217 aa8.99□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 SPG7Q9UQ90 795 aa8.99□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 NBPF26B4DH59 902 aa8.99□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 IGKV5-2P06315 115 aa8.99□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 SDSP20132 328 aa8.99□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 NBPF14Q5TI25 921 aa8.99□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 NBPF15Q8N660 670 aa8.99□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 RILPL2Q969X0 211 aa8.99□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 KAZALD1Q96I82 304 aa8.99□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 WDR17Q8IZU2 1322 aa8.99□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 PCNTO95613 3336 aa8.99□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 USP54Q70EL1 1684 aa8.98□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 CCT4P50991 539 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 KIF1AQ12756 1690 aa8.98□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 GCC1Q96CN9 775 aa8.98□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 SUCLG2Q96I99 432 aa8.98□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 TBC1D32Q96NH3 1257 aa8.98□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 TBC1D2Q9BYX2 928 aa8.98□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 C5P01031 1676 aa8.97□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 FAM177BA6PVY3 158 aa8.97□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa8.97□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 IL2RBP14784 551 aa8.97□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa8.97□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa8.96□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 DCAF5Q96JK2 942 aa8.96□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 LMO7Q8WWI1 1683 aa8.96□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 KDM3BQ7LBC6 1761 aa8.96□□□□□ -0.97
RAD9B-201ENST00000358071 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
RAD9B-201ENST00000358071 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
RAD9B-201ENST00000358071 PIGBQ92521 554 aa8.96□□□□□ -0.98
RAD9B-201ENST00000358071 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
RAD9B-201ENST00000358071 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
RAD9B-201ENST00000358071 CHMP3Q9Y3E7 222 aa8.96□□□□□ -0.98
RAD9B-201ENST00000358071 AK9Q5TCS8 1911 aa8.96□□□□□ -0.98
RAD9B-201ENST00000358071 PDE1AP54750 535 aa8.95□□□□□ -0.98
RAD9B-201ENST00000358071 ATP8B2P98198 1209 aa8.95□□□□□ -0.98
RAD9B-201ENST00000358071 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
RAD9B-201ENST00000358071 SLFNL1Q499Z3 407 aa8.95□□□□□ -0.98
RAD9B-201ENST00000358071 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
RAD9B-201ENST00000358071 DCCP43146 1447 aa8.95□□□□□ -0.98
RAD9B-201ENST00000358071 KCNQ2O43526 872 aa8.95□□□□□ -0.98
RAD9B-201ENST00000358071 TTC22Q5TAA0 569 aa8.95□□□□□ -0.98
RAD9B-201ENST00000358071 KSR2Q6VAB6 950 aa8.95□□□□□ -0.98
RAD9B-201ENST00000358071 SLC4A9Q96Q91 983 aa8.95□□□□□ -0.98
RAD9B-201ENST00000358071 GPTP24298 496 aa8.95□□□□□ -0.98
RAD9B-201ENST00000358071 DNAJC10Q8IXB1 793 aa8.95□□□□□ -0.98
RAD9B-201ENST00000358071 CHAMP1Q96JM3 812 aa8.95□□□□□ -0.98
RAD9B-201ENST00000358071 KIF2CQ99661 725 aa8.95□□□□□ -0.98
RAD9B-201ENST00000358071 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
RAD9B-201ENST00000358071 AAMPQ13685 434 aa8.94□□□□□ -0.98
RAD9B-201ENST00000358071 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
RAD9B-201ENST00000358071 BMP2KLQ5H9B9 411 aa8.94□□□□□ -0.98
RAD9B-201ENST00000358071 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa8.94□□□□□ -0.98
RAD9B-201ENST00000358071 LRP10Q7Z4F1 713 aa8.94□□□□□ -0.98
RAD9B-201ENST00000358071 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
RAD9B-201ENST00000358071 C8orf37Q96NL8 207 aa8.94□□□□□ -0.98
RAD9B-201ENST00000358071 LRRCC1Q9C099 1032 aa8.94□□□□□ -0.98
RAD9B-201ENST00000358071 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP8.94□□□□□ -0.98
RAD9B-201ENST00000358071 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms