RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356128.4

TRAPPC3L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3 like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3L, Length 2,421 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C9orf131Q5VYM1 1079 aa8.59□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 WAPLQ7Z5K2 1190 aa8.59□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRAM1Q96QH2 718 aa8.59□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SMAPO00193 183 aa8.59□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SKIP12755 728 aa8.59□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF662Q6ZS27 426 aa8.59□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PPLO60437 1756 aa8.58□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa8.58□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NUDT7P0C024 238 aa8.58□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GCGRP47871 477 aa8.58□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GPRASP1Q5JY77 1395 aa8.58□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLF2Q8IX21 1173 aa8.58□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMC1Q8TDI8 760 aa8.58□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCDC7Q96M83 1385 aa8.58□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TESK2Q96S53 571 aa8.57□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NEURL4Q96JN8 1562 aa8.57□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZFYVE9O95405 1425 aa8.57□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 METP08581 1390 aa8.57□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ANP32CO43423 234 aa8.56□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DISP3Q9P2K9 1392 aa8.56□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC10A3P09131 477 aa8.56□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KCNH2Q12809 1159 aa8.56□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NCOA4Q13772 614 aa8.56□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ARSIQ5FYB1 569 aa8.56□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BACH2Q9BYV9 841 aa8.56□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NRXN1Q9ULB1 1477 aa8.56□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UBR1Q8IWV7 1749 aa8.56□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C6orf229H3BNL8 230 aa8.55□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RASA1P20936 1047 aa8.55□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IFT172Q9UG01 1749 aa8.55□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 H3BRB1 525 aa8.55□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ABL1P00519 1130 aa8.54□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ECM1Q16610 540 aa8.54□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa8.54□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM200AQ8TCP9 573 aa8.54□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ALKQ9UM73 1620 aa8.54□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa8.54□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LDLRAD1Q5T700 205 aa8.54□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PNMA3Q9UL41 463 aa8.54□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CANXP27824 592 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USP46P62068 366 aa8.53□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NR1H3Q13133 447 aa8.53□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DPH6Q7L8W6 267 aa8.53□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EVC2Q86UK5 1308 aa8.53□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa8.53□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TATDN2Q93075 761 aa8.53□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PANK3Q9H999 370 aa8.53□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 STRCP1A6NGW2 1772 aa8.53□□□□□ -1.04
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DPYDQ12882 1025 aa8.52□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MTMR3Q13615 1198 aa8.52□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GPR153Q6NV75 609 aa8.52□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TBX22Q9Y458 520 aa8.52□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ANKRD62A6NC57 917 aa8.52□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRMT3O60678 531 aa8.52□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LGR5O75473 907 aa8.52□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KCNA6P17658 529 aa8.52□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CLDN10P78369 228 aa8.52□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ANKMY2Q8IV38 441 aa8.52□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CDK19Q9BWU1 502 aa8.52□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa8.52□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PIP4K2BP78356 416 aa8.51□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa8.51□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ADGRB1O14514 1584 aa8.51□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MAPK1P28482 360 aa8.51□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa8.51□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LTBP4Q8N2S1 1624 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KNSTRNQ9Y448 316 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLIT1O75093 1534 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ARHGAP23Q9P227 1491 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FUT2Q10981 343 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OCLNQ16625 522 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ABCC11Q96J66 1382 aa8.49□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa8.49□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IQGAP1P46940 1657 aa8.49□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CAPN12Q6ZSI9 719 aa8.49□□□□□ -1.05
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KIAA1024Q9UPX6 916 aa8.49□□□□□ -1.05
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