RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332859.10

SUMO3-201, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUMO3, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-201ENST00000332859 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
SUMO3-201ENST00000332859 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
SUMO3-201ENST00000332859 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.3■■□□□ 1.64
SUMO3-201ENST00000332859 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.3■■□□□ 1.64
SUMO3-201ENST00000332859 UBR2Q8IWV8 1755 aa25.3■■□□□ 1.64
SUMO3-201ENST00000332859 BCL9LQ86UU0 1499 aa25.29■■□□□ 1.64
SUMO3-201ENST00000332859 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
SUMO3-201ENST00000332859 GLI3P10071 1580 aa25.29■■□□□ 1.64
SUMO3-201ENST00000332859 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
SUMO3-201ENST00000332859 HYPKQ9NX55 129 aa25.28■■□□□ 1.64
SUMO3-201ENST00000332859 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.28■■□□□ 1.64
SUMO3-201ENST00000332859 RGS3P49796 1198 aa25.28■■□□□ 1.64
SUMO3-201ENST00000332859 VPS72Q15906 364 aa25.28■■□□□ 1.64
SUMO3-201ENST00000332859 DDB1Q16531 1140 aa25.28■■□□□ 1.64
SUMO3-201ENST00000332859 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP25.28■■□□□ 1.64
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SUMO3-201ENST00000332859 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SUMO3-201ENST00000332859 ANXA1P04083 346 aa25.25■■□□□ 1.63
SUMO3-201ENST00000332859 C8orf34Q49A92 452 aa25.25■■□□□ 1.63
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SUMO3-201ENST00000332859 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.24■■□□□ 1.63
SUMO3-201ENST00000332859 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SUMO3-201ENST00000332859 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SUMO3-201ENST00000332859 ITGB4P16144 1822 aa25.23■■□□□ 1.63
SUMO3-201ENST00000332859 PDIA6Q15084 440 aa25.23■■□□□ 1.63
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SUMO3-201ENST00000332859 USP16Q9Y5T5 823 aa25.22■■□□□ 1.63
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SUMO3-201ENST00000332859 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa25.2■■□□□ 1.62
SUMO3-201ENST00000332859 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.2■■□□□ 1.62
SUMO3-201ENST00000332859 ATP10DQ9P241 1426 aa25.19■■□□□ 1.62
SUMO3-201ENST00000332859 GNAI3P08754 354 aa25.19■■□□□ 1.62
SUMO3-201ENST00000332859 KSR2Q6VAB6 950 aa25.19■■□□□ 1.62
SUMO3-201ENST00000332859 DDRGK1Q96HY6 314 aa25.19■■□□□ 1.62
SUMO3-201ENST00000332859 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa25.19■■□□□ 1.62
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SUMO3-201ENST00000332859 MYL6BP14649 208 aa25.16■■□□□ 1.62
SUMO3-201ENST00000332859 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SUMO3-201ENST00000332859 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SUMO3-201ENST00000332859 ATG3Q9NT62 314 aa25.16■■□□□ 1.62
SUMO3-201ENST00000332859 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.16■■□□□ 1.62
SUMO3-201ENST00000332859 BEND3Q5T5X7 828 aa25.16■■□□□ 1.62
SUMO3-201ENST00000332859 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.16■■□□□ 1.62
SUMO3-201ENST00000332859 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa25.16■■□□□ 1.62
SUMO3-201ENST00000332859 VSIG10Q8N0Z9 540 aa25.15■■□□□ 1.62
SUMO3-201ENST00000332859 ANKRD44Q8N8A2 993 aa25.15■■□□□ 1.62
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SUMO3-201ENST00000332859 LRP10Q7Z4F1 713 aa25.14■■□□□ 1.61
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SUMO3-201ENST00000332859 GCC1Q96CN9 775 aa25.14■■□□□ 1.61
SUMO3-201ENST00000332859 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
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SUMO3-201ENST00000332859 AFF2P51816 1311 aa25.12■■□□□ 1.61
SUMO3-201ENST00000332859 ALDH1L1O75891 902 aa25.12■■□□□ 1.61
SUMO3-201ENST00000332859 COPS6Q7L5N1 327 aa25.12■■□□□ 1.61
SUMO3-201ENST00000332859 RIC3Q7Z5B4 369 aa25.11■■□□□ 1.61
SUMO3-201ENST00000332859 USP44Q9H0E7 712 aa25.11■■□□□ 1.61
SUMO3-201ENST00000332859 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa25.11■■□□□ 1.61
SUMO3-201ENST00000332859 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
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SUMO3-201ENST00000332859 A0A0G2JS52 829 aa25.08■■□□□ 1.61
SUMO3-201ENST00000332859 NBPF26B4DH59 902 aa25.08■■□□□ 1.61
SUMO3-201ENST00000332859 HMMRO75330 724 aa25.08■■□□□ 1.61
SUMO3-201ENST00000332859 NBPF14Q5TI25 921 aa25.08■■□□□ 1.61
SUMO3-201ENST00000332859 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
SUMO3-201ENST00000332859 NBPF15Q8N660 670 aa25.08■■□□□ 1.61
SUMO3-201ENST00000332859 LINS1Q8NG48 757 aa25.08■■□□□ 1.61
SUMO3-201ENST00000332859 ATRNO75882 1429 aa25.08■■□□□ 1.61
SUMO3-201ENST00000332859 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa25.07■■□□□ 1.6
SUMO3-201ENST00000332859 NUCB1Q02818 461 aa25.07■■□□□ 1.6
SUMO3-201ENST00000332859 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.07■■□□□ 1.6
SUMO3-201ENST00000332859 DNAJC10Q8IXB1 793 aa25.07■■□□□ 1.6
SUMO3-201ENST00000332859 ACSBG1Q96GR2 724 aa25.07■■□□□ 1.6
SUMO3-201ENST00000332859 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SUMO3-201ENST00000332859 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SUMO3-201ENST00000332859 STARD3NLO95772 234 aa25.06■■□□□ 1.6
SUMO3-201ENST00000332859 A1BGP04217 495 aa25.06■■□□□ 1.6
SUMO3-201ENST00000332859 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SUMO3-201ENST00000332859 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SUMO3-201ENST00000332859 DCTPP1Q9H773 170 aa25.05■■□□□ 1.6
SUMO3-201ENST00000332859 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
SUMO3-201ENST00000332859 PLBD2Q8NHP8 589 aa25.04■■□□□ 1.6
SUMO3-201ENST00000332859 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.04■■□□□ 1.6
SUMO3-201ENST00000332859 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.04■■□□□ 1.6
SUMO3-201ENST00000332859 CHD1LQ86WJ1 897 aa25.03■■□□□ 1.6
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