RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324394.7

ZNF404-201, Transcript of zinc finger protein 404, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF404, Length 1,844 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF404-201ENST00000324394 XAGE2Q96GT9 111 aa7.24□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 AGBL1Q96MI9 1066 aa7.24□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 WDR4P57081 412 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 FOXK2Q01167 660 aa7.23□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 MTFR1Q15390 333 aa7.23□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 SLC9A9Q8IVB4 645 aa7.23□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 TMEM151AQ8N4L1 468 aa7.23□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa7.23□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 USP3Q9Y6I4 520 aa7.23□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 FOXO3O43524 673 aa7.22□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 TIMP2P16035 220 aa7.22□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 VEGFBP49765 207 aa7.22□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 HRH3Q9Y5N1 445 aa7.22□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 H3BRB1 525 aa7.22□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 GSK3AP49840 483 aa7.22□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 RELBQ01201 579 aa7.22□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 CLN3Q13286 438 aa7.22□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 TLR1Q15399 786 aa7.22□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 EGFL7Q9UHF1 273 aa7.22□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 ICMTO60725 284 aa7.21□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 PTGIRP43119 386 aa7.21□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 ZNF428Q96B54 188 aa7.21□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 ECM1Q16610 540 aa7.2□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 COL26A1Q96A83 441 aa7.2□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 MEN1O00255 615 aa7.2□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 CENPCQ03188 943 aa7.2□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 GLYCTKQ8IVS8 523 aa7.2□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 SAP130Q9H0E3 1048 aa7.2□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 CDK2AP1O14519 115 aa7.19□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 VTI1AQ96AJ9 217 aa7.19□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 GDF11O95390 407 aa7.18□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 MARSP56192 900 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa7.17□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 TRIM46Q7Z4K8 759 aa7.17□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.17□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 HELQQ8TDG4 1101 aa7.17□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 NLRP3Q96P20 1036 aa7.17□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 VSIG8P0DPA2 414 aa7.17□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 STAG2Q8N3U4 1231 aa7.17□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 MEIOBQ8N635 442 aa7.17□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa7.17□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 PARP3Q9Y6F1 533 aa7.17□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 ARHGAP4P98171 946 aa7.16□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 RASSF7Q02833 373 aa7.16□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 COX20Q5RI15 118 aa7.16□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 C16orf46Q6P387 395 aa7.16□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 EML1O00423 815 aa7.15□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 BMP1P13497 986 aa7.15□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 POTEAQ6S8J7 498 aa7.15□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 CABP1Q9NZU7 370 aa7.15□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 LRFN2Q9ULH4 789 aa7.15□□□□□ -1.26
ZNF404-201ENST00000324394 NOS2P35228 1153 aa7.15□□□□□ -1.27
ZNF404-201ENST00000324394 RBM25P49756 843 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
ZNF404-201ENST00000324394 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
ZNF404-201ENST00000324394 L3MBTL2Q969R5 705 aa7.15□□□□□ -1.27
ZNF404-201ENST00000324394 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
ZNF404-201ENST00000324394 ZNF232Q9UNY5 417 aa7.15□□□□□ -1.27
ZNF404-201ENST00000324394 SERTM1A2A2V5 107 aa7.14□□□□□ -1.27
ZNF404-201ENST00000324394 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
ZNF404-201ENST00000324394 MPSTP25325 297 aa7.14□□□□□ -1.27
ZNF404-201ENST00000324394 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
ZNF404-201ENST00000324394 TEAD4Q15561 434 aa7.14□□□□□ -1.27
ZNF404-201ENST00000324394 NBPF15Q8N660 670 aa7.14□□□□□ -1.27
ZNF404-201ENST00000324394 NGLY1Q96IV0 654 aa7.14□□□□□ -1.27
ZNF404-201ENST00000324394 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
ZNF404-201ENST00000324394 CHMP3Q9Y3E7 222 aa7.14□□□□□ -1.27
ZNF404-201ENST00000324394 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa7.14□□□□□ -1.27
ZNF404-201ENST00000324394 NPR3P17342 541 aa7.13□□□□□ -1.27
ZNF404-201ENST00000324394 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ZNF404-201ENST00000324394 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ZNF404-201ENST00000324394 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa7.13□□□□□ -1.27
ZNF404-201ENST00000324394 TNFRSF10BO14763 440 aa7.13□□□□□ -1.27
ZNF404-201ENST00000324394 MAPK1P28482 360 aa7.13□□□□□ -1.27
ZNF404-201ENST00000324394 XP32Q5T750 250 aa7.13□□□□□ -1.27
ZNF404-201ENST00000324394 ANKRD33BA6NCL7 494 aa7.12□□□□□ -1.27
ZNF404-201ENST00000324394 FAM13AO94988 1023 aa7.12□□□□□ -1.27
ZNF404-201ENST00000324394 IGHA1P01876 353 aa7.12□□□□□ -1.27
ZNF404-201ENST00000324394 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ZNF404-201ENST00000324394 FAM26DQ5JW98 314 aa7.12□□□□□ -1.27
ZNF404-201ENST00000324394 SLC27A3Q5K4L6 730 aa7.12□□□□□ -1.27
ZNF404-201ENST00000324394 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa7.12□□□□□ -1.27
ZNF404-201ENST00000324394 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.12□□□□□ -1.27
ZNF404-201ENST00000324394 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.2 ms