RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322315.5

GIPC3-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC3, Length 4,335 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3-201ENST00000322315 USP26Q9BXU7 913 aa16.75■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 ATP8B2P98198 1209 aa16.75■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 UNC5CLQ8IV45 518 aa16.75■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 PES1O00541 588 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 SDF4Q9BRK5 362 aa16.75■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 CLTCL1P53675 1640 aa16.75■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 RASSF8Q8NHQ8 419 aa16.74■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 PALD1Q9ULE6 856 aa16.74■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 CCDC57Q2TAC2 916 aa16.74■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 TSPY26PQ9H489 355 aa16.74■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 ROBO2Q9HCK4 1378 aa16.74■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 TRDNQ13061 729 aa16.73■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 ECHDC1Q9NTX5 307 aa16.73■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 USP25Q9UHP3 1055 aa16.73■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 FLT4P35916 1363 aa16.73■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 PROSER3Q2NL68 480 aa16.73■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa16.73■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 TSPOAP1O95153 1857 aa16.73■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 CNPY2Q9Y2B0 182 aa16.72■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 TTC39AQ5SRH9 613 aa16.72■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 LMBR1LQ6UX01 489 aa16.72■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 TRIM5Q9C035 493 aa16.72■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 CEP126Q9P2H0 1117 aa16.72■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa16.72■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa16.72■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 TRPM2O94759 1503 aa16.71■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa16.71■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa16.71■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 GIMAP6Q6P9H5 292 aa16.71■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa16.71■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 SASS6Q6UVJ0 657 aa16.71■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 SYNMO15061 1565 aa16.71■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 ADCY10Q96PN6 1610 aa16.71■□□□□ 0.27
GIPC3-201ENST00000322315 CHMLP26374 656 aa16.71■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 PSMA5P28066 241 aa16.7■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 TIMM10P62072 90 aa16.7■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 GJB2P29033 226 aa16.7■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 ERC1Q8IUD2 1116 aa16.7■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 USP44Q9H0E7 712 aa16.7■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 ABCF2Q9UG63 623 aa16.7■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 ME1P48163 572 aa16.7■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 ISM2Q6H9L7 571 aa16.7■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 FAM227BQ96M60 508 aa16.69■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 MBD3O95983 291 aa16.69■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 MCM2P49736 904 aa16.69■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 PIK3R4Q99570 1358 aa16.68■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 GRM8O00222 908 aa16.68■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa16.68■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 ACSBG1Q96GR2 724 aa16.68■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 AMOTQ4VCS5 1084 aa16.68■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa16.67■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 A1BGP04217 495 aa16.67■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 AK2P54819 239 aa16.67■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 KIF6Q6ZMV9 814 aa16.67■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa16.67■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 SPATA32Q96LK8 384 aa16.67■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa16.67■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa16.67■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 METTL24Q5JXM2 366 aa16.66■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa16.66■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 NUP133Q8WUM0 1156 aa16.66■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 CCDC158Q5M9N0 1113 aa16.66■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 GAS2L3Q86XJ1 694 aa16.66■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 USP16Q9Y5T5 823 aa16.66■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 BRF1Q92994 677 aa16.66■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa16.66■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 RAB3GAP1Q15042 981 aa16.66■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 USP48Q86UV5 1035 aa16.65■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 IFNL2Q8IZJ0 200 aa16.65■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 PPP6R1Q9UPN7 881 aa16.65■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa16.65■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 KIF3AQ9Y496 699 aa16.65■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 TMEM2Q9UHN6 1383 aa16.65■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 TTC21AQ8NDW8 1320 aa16.65■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 KSR2Q6VAB6 950 aa16.65■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 TNMDQ9H2S6 317 aa16.65■□□□□ 0.26
GIPC3-201ENST00000322315 HYPKQ9NX55 129 aa16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms