RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319359.7

ELL3-201, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ELL3, Length 2,352 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3-201ENST00000319359 TSC1Q92574 1164 aa26.21■■□□□ 1.79
ELL3-201ENST00000319359 AK2P54819 239 aa26.21■■□□□ 1.79
ELL3-201ENST00000319359 NUTM2GQ5VZR2 741 aa26.21■■□□□ 1.79
ELL3-201ENST00000319359 IL17REQ8NFR9 667 aa26.21■■□□□ 1.79
ELL3-201ENST00000319359 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
ELL3-201ENST00000319359 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
ELL3-201ENST00000319359 KIAA2012Q0VF49 1180 aa26.2■■□□□ 1.79
ELL3-201ENST00000319359 IL17RAQ96F46 866 aa26.2■■□□□ 1.79
ELL3-201ENST00000319359 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.2■■□□□ 1.79
ELL3-201ENST00000319359 SPG7Q9UQ90 795 aa26.2■■□□□ 1.79
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ELL3-201ENST00000319359 LARGE1O95461 756 aa26.2■■□□□ 1.78
ELL3-201ENST00000319359 RUFY3Q7L099 469 aa26.2■■□□□ 1.78
ELL3-201ENST00000319359 TSPOAP1O95153 1857 aa26.2■■□□□ 1.78
ELL3-201ENST00000319359 IGSF1Q8N6C5 1336 aa26.2■■□□□ 1.78
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ELL3-201ENST00000319359 FLT4P35916 1363 aa26.19■■□□□ 1.78
ELL3-201ENST00000319359 GNAT3A8MTJ3 354 aa26.18■■□□□ 1.78
ELL3-201ENST00000319359 SGSM2O43147 1006 aa26.18■■□□□ 1.78
ELL3-201ENST00000319359 FIBPO43427 364 aa26.18■■□□□ 1.78
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ELL3-201ENST00000319359 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
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ELL3-201ENST00000319359 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.18■■□□□ 1.78
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ELL3-201ENST00000319359 ADCY5O95622 1261 aa26.18■■□□□ 1.78
ELL3-201ENST00000319359 SYT1P21579 422 aa26.18■■□□□ 1.78
ELL3-201ENST00000319359 RHPN1Q8TCX5 695 aa26.18■■□□□ 1.78
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ELL3-201ENST00000319359 RAD50Q92878 1312 aa26.18■■□□□ 1.78
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ELL3-201ENST00000319359 AGLP35573 1532 aa26.17■■□□□ 1.78
ELL3-201ENST00000319359 PHF14O94880 888 aa26.17■■□□□ 1.78
ELL3-201ENST00000319359 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
ELL3-201ENST00000319359 DYNC1I1O14576 645 aa26.16■■□□□ 1.78
ELL3-201ENST00000319359 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
ELL3-201ENST00000319359 CCDC183Q5T5S1 534 aa26.16■■□□□ 1.78
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ELL3-201ENST00000319359 STX6O43752 255 aa26.15■■□□□ 1.78
ELL3-201ENST00000319359 USHBP1Q8N6Y0 703 aa26.15■■□□□ 1.78
ELL3-201ENST00000319359 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa26.14■■□□□ 1.78
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ELL3-201ENST00000319359 LTKP29376 864 aa26.14■■□□□ 1.78
ELL3-201ENST00000319359 PLCB2Q00722 1185 aa26.14■■□□□ 1.78
ELL3-201ENST00000319359 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa26.14■■□□□ 1.78
ELL3-201ENST00000319359 GIMAP6Q6P9H5 292 aa26.14■■□□□ 1.77
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ELL3-201ENST00000319359 FAM177BA6PVY3 158 aa26.13■■□□□ 1.77
ELL3-201ENST00000319359 FMN2Q9NZ56 1722 aa26.13■■□□□ 1.77
ELL3-201ENST00000319359 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.12■■□□□ 1.77
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ELL3-201ENST00000319359 ANXA1P04083 346 aa26.12■■□□□ 1.77
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ELL3-201ENST00000319359 CCDC83Q8IWF9 413 aa26.12■■□□□ 1.77
ELL3-201ENST00000319359 F13A1P00488 732 aa26.11■■□□□ 1.77
ELL3-201ENST00000319359 ADCK5Q3MIX3 580 aa26.11■■□□□ 1.77
ELL3-201ENST00000319359 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa26.11■■□□□ 1.77
ELL3-201ENST00000319359 SMC3Q9UQE7 1217 aa26.11■■□□□ 1.77
ELL3-201ENST00000319359 PTH1RQ03431 593 aa26.1■■□□□ 1.77
ELL3-201ENST00000319359 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
ELL3-201ENST00000319359 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP26.1■■□□□ 1.77
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ELL3-201ENST00000319359 UBE2HP62256 183 aa26.1■■□□□ 1.77
ELL3-201ENST00000319359 PIBF1Q8WXW3 757 aa26.1■■□□□ 1.77
ELL3-201ENST00000319359 PTPRUQ92729 1446 aa26.09■■□□□ 1.77
ELL3-201ENST00000319359 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
ELL3-201ENST00000319359 FAM184AQ8NB25 1140 aa26.09■■□□□ 1.77
ELL3-201ENST00000319359 MAP7D2Q96T17 732 aa26.09■■□□□ 1.77
ELL3-201ENST00000319359 NLRP6P59044 892 aa26.09■■□□□ 1.77
ELL3-201ENST00000319359 UVSSAQ2YD98 709 aa26.09■■□□□ 1.77
ELL3-201ENST00000319359 RAB11FIP3O75154 756 aa26.08■■□□□ 1.77
ELL3-201ENST00000319359 GJB2P29033 226 aa26.08■■□□□ 1.77
ELL3-201ENST00000319359 CNTROBQ8N137 903 aa26.08■■□□□ 1.77
ELL3-201ENST00000319359 MAP3K5Q99683 1374 aa26.07■■□□□ 1.76
ELL3-201ENST00000319359 HYPKQ9NX55 129 aa26.07■■□□□ 1.76
ELL3-201ENST00000319359 TNRQ92752 1358 aa26.07■■□□□ 1.76
ELL3-201ENST00000319359 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
ELL3-201ENST00000319359 HOXC9P31274 260 aa26.07■■□□□ 1.76
ELL3-201ENST00000319359 KIF1BPQ96EK5 621 aa26.07■■□□□ 1.76
ELL3-201ENST00000319359 LRRC37A3O60309 1634 aa26.07■■□□□ 1.76
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ELL3-201ENST00000319359 KDM4AO75164 1064 aa26.06■■□□□ 1.76
ELL3-201ENST00000319359 ST3GAL1Q11201 340 aa26.06■■□□□ 1.76
ELL3-201ENST00000319359 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
ELL3-201ENST00000319359 CHPF2Q9P2E5 772 aa26.06■■□□□ 1.76
ELL3-201ENST00000319359 NECAB1Q8N987 351 aa26.05■■□□□ 1.76
ELL3-201ENST00000319359 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
ELL3-201ENST00000319359 FUCA2Q9BTY2 467 aa26.05■■□□□ 1.76
ELL3-201ENST00000319359 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
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