RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318561.7

SFTPC-201, Transcript of surfactant protein C, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFTPC, Length 997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPC-201ENST00000318561 GNPATO15228 680 aa22.4■■□□□ 1.18
SFTPC-201ENST00000318561 LGR6Q9HBX8 967 aa22.4■■□□□ 1.18
SFTPC-201ENST00000318561 MRS2Q9HD23 443 aa22.39■■□□□ 1.17
SFTPC-201ENST00000318561 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.39■■□□□ 1.17
SFTPC-201ENST00000318561 KCNA3P22001 575 aa22.38■■□□□ 1.17
SFTPC-201ENST00000318561 MRC1P22897 1456 aa22.38■■□□□ 1.17
SFTPC-201ENST00000318561 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.36■■□□□ 1.17
SFTPC-201ENST00000318561 NFE2L2Q16236 605 aa22.36■■□□□ 1.17
SFTPC-201ENST00000318561 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.36■■□□□ 1.17
SFTPC-201ENST00000318561 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SFTPC-201ENST00000318561 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.36■■□□□ 1.17
SFTPC-201ENST00000318561 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.36■■□□□ 1.17
SFTPC-201ENST00000318561 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.35■■□□□ 1.17
SFTPC-201ENST00000318561 SIK1P57059 783 aa22.35■■□□□ 1.17
SFTPC-201ENST00000318561 ITPK1Q13572 414 aa22.35■■□□□ 1.17
SFTPC-201ENST00000318561 FAM161AQ3B820 660 aa22.35■■□□□ 1.17
SFTPC-201ENST00000318561 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.35■■□□□ 1.17
SFTPC-201ENST00000318561 IL17REQ8NFR9 667 aa22.35■■□□□ 1.17
SFTPC-201ENST00000318561 RUNDC1Q96C34 613 aa22.35■■□□□ 1.17
SFTPC-201ENST00000318561 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.35■■□□□ 1.17
SFTPC-201ENST00000318561 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SFTPC-201ENST00000318561 ATG3Q9NT62 314 aa22.34■■□□□ 1.17
SFTPC-201ENST00000318561 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
SFTPC-201ENST00000318561 FOXN1O15353 648 aa22.33■■□□□ 1.17
SFTPC-201ENST00000318561 TEFQ10587 303 aa22.33■■□□□ 1.17
SFTPC-201ENST00000318561 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SFTPC-201ENST00000318561 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.32■■□□□ 1.16
SFTPC-201ENST00000318561 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SFTPC-201ENST00000318561 PIM2Q9P1W9 311 aa22.32■■□□□ 1.16
SFTPC-201ENST00000318561 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.32■■□□□ 1.16
SFTPC-201ENST00000318561 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SFTPC-201ENST00000318561 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SFTPC-201ENST00000318561 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SFTPC-201ENST00000318561 MCM10Q7L590 875 aa22.3■■□□□ 1.16
SFTPC-201ENST00000318561 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.3■■□□□ 1.16
SFTPC-201ENST00000318561 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SFTPC-201ENST00000318561 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SFTPC-201ENST00000318561 ATP6V1AP38606 617 aa22.28■■□□□ 1.16
SFTPC-201ENST00000318561 RIPK4P57078 832 aa22.28■■□□□ 1.16
SFTPC-201ENST00000318561 DCTN1Q14203 1278 aa22.28■■□□□ 1.16
SFTPC-201ENST00000318561 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.28■■□□□ 1.16
SFTPC-201ENST00000318561 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.28■■□□□ 1.16
SFTPC-201ENST00000318561 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.26■■□□□ 1.15
SFTPC-201ENST00000318561 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.26■■□□□ 1.15
SFTPC-201ENST00000318561 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SFTPC-201ENST00000318561 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SFTPC-201ENST00000318561 GYS1P13807 737 aa22.25■■□□□ 1.15
SFTPC-201ENST00000318561 RASSF7Q02833 373 aa22.25■■□□□ 1.15
SFTPC-201ENST00000318561 SLC39A6Q13433 755 aa22.25■■□□□ 1.15
SFTPC-201ENST00000318561 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SFTPC-201ENST00000318561 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.25■■□□□ 1.15
SFTPC-201ENST00000318561 C4AP0C0L4 1744 aa22.24■■□□□ 1.15
SFTPC-201ENST00000318561 GLTPD2A6NH11 291 aa22.24■■□□□ 1.15
SFTPC-201ENST00000318561 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SFTPC-201ENST00000318561 NEUROD2Q15784 382 aa22.24■■□□□ 1.15
SFTPC-201ENST00000318561 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SFTPC-201ENST00000318561 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.23■■□□□ 1.15
SFTPC-201ENST00000318561 CHRNA5P30532 468 aa22.23■■□□□ 1.15
SFTPC-201ENST00000318561 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.23■■□□□ 1.15
SFTPC-201ENST00000318561 BTBD11A6QL63 1104 aa22.22■■□□□ 1.15
SFTPC-201ENST00000318561 CCER2I3L3R5 266 aa22.22■■□□□ 1.15
SFTPC-201ENST00000318561 APAF1O14727 1248 aa22.22■■□□□ 1.15
SFTPC-201ENST00000318561 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SFTPC-201ENST00000318561 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SFTPC-201ENST00000318561 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SFTPC-201ENST00000318561 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SFTPC-201ENST00000318561 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.21■■□□□ 1.15
SFTPC-201ENST00000318561 CREBZFQ9NS37 354 aa22.21■■□□□ 1.15
SFTPC-201ENST00000318561 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF790Q6PG37 636 aa22.2■■□□□ 1.14
SFTPC-201ENST00000318561 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.2■■□□□ 1.14
SFTPC-201ENST00000318561 ABHD8Q96I13 439 aa22.2■■□□□ 1.14
SFTPC-201ENST00000318561 TJP1Q07157 1748 aa22.2■■□□□ 1.14
SFTPC-201ENST00000318561 POTECB2RU33 542 aa22.19■■□□□ 1.14
SFTPC-201ENST00000318561 RFC4P35249 363 aa22.19■■□□□ 1.14
SFTPC-201ENST00000318561 ADRA2BP18089 450 aa22.18■■□□□ 1.14
SFTPC-201ENST00000318561 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.18■■□□□ 1.14
SFTPC-201ENST00000318561 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.17■■□□□ 1.14
SFTPC-201ENST00000318561 LMNB1P20700 586 aa22.17■■□□□ 1.14
SFTPC-201ENST00000318561 LBX1P52954 281 aa22.17■■□□□ 1.14
SFTPC-201ENST00000318561 AIDAQ96BJ3 306 aa22.17■■□□□ 1.14
SFTPC-201ENST00000318561 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SFTPC-201ENST00000318561 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.16■■□□□ 1.14
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SFTPC-201ENST00000318561 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.16■■□□□ 1.14
SFTPC-201ENST00000318561 CNTNAP1P78357 1384 aa22.15■■□□□ 1.14
SFTPC-201ENST00000318561 KCNQ3O43525 872 aa22.15■■□□□ 1.14
SFTPC-201ENST00000318561 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SFTPC-201ENST00000318561 DDR1Q08345 913 aa22.15■■□□□ 1.14
SFTPC-201ENST00000318561 MIER1Q8N108 512 aa22.15■■□□□ 1.14
SFTPC-201ENST00000318561 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.14■■□□□ 1.14
SFTPC-201ENST00000318561 SBF1O95248 1867 aa22.14■■□□□ 1.13
SFTPC-201ENST00000318561 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.14■■□□□ 1.13
SFTPC-201ENST00000318561 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.14■■□□□ 1.13
SFTPC-201ENST00000318561 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.13■■□□□ 1.13
SFTPC-201ENST00000318561 RPS6KA4O75676 772 aa22.13■■□□□ 1.13
SFTPC-201ENST00000318561 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SFTPC-201ENST00000318561 FKBP8Q14318 412 aa22.12■■□□□ 1.13
SFTPC-201ENST00000318561 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
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