RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000314583.7

HCLS1-201, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCLS1, Length 2,000 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-201ENST00000314583 IL2RBP14784 551 aa22.89■■□□□ 1.26
HCLS1-201ENST00000314583 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
HCLS1-201ENST00000314583 HYPKQ9NX55 129 aa22.89■■□□□ 1.26
HCLS1-201ENST00000314583 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
HCLS1-201ENST00000314583 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
HCLS1-201ENST00000314583 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.89■■□□□ 1.25
HCLS1-201ENST00000314583 STRN4Q9NRL3 753 aa22.89■■□□□ 1.25
HCLS1-201ENST00000314583 USP35Q9P2H5 1018 aa22.89■■□□□ 1.25
HCLS1-201ENST00000314583 ADCY9O60503 1353 aa22.89■■□□□ 1.25
HCLS1-201ENST00000314583 EVA1CP58658 441 aa22.88■■□□□ 1.25
HCLS1-201ENST00000314583 BEND3Q5T5X7 828 aa22.88■■□□□ 1.25
HCLS1-201ENST00000314583 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.87■■□□□ 1.25
HCLS1-201ENST00000314583 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
HCLS1-201ENST00000314583 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.87■■□□□ 1.25
HCLS1-201ENST00000314583 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.87■■□□□ 1.25
HCLS1-201ENST00000314583 SLC39A6Q13433 755 aa22.87■■□□□ 1.25
HCLS1-201ENST00000314583 PAPPAQ13219 1627 aa22.86■■□□□ 1.25
HCLS1-201ENST00000314583 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
HCLS1-201ENST00000314583 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.86■■□□□ 1.25
HCLS1-201ENST00000314583 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.86■■□□□ 1.25
HCLS1-201ENST00000314583 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
HCLS1-201ENST00000314583 ALDH1L1O75891 902 aa22.86■■□□□ 1.25
HCLS1-201ENST00000314583 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
HCLS1-201ENST00000314583 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.25
HCLS1-201ENST00000314583 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.85■■□□□ 1.25
HCLS1-201ENST00000314583 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.84■■□□□ 1.25
HCLS1-201ENST00000314583 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.84■■□□□ 1.25
HCLS1-201ENST00000314583 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
HCLS1-201ENST00000314583 KSR2Q6VAB6 950 aa22.84■■□□□ 1.25
HCLS1-201ENST00000314583 SSH3Q8TE77 659 aa22.84■■□□□ 1.25
HCLS1-201ENST00000314583 BTG4Q9NY30 223 aa22.84■■□□□ 1.25
HCLS1-201ENST00000314583 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.84■■□□□ 1.25
HCLS1-201ENST00000314583 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.84■■□□□ 1.25
HCLS1-201ENST00000314583 APBB1O00213 710 aa22.84■■□□□ 1.25
HCLS1-201ENST00000314583 CABP4P57796 275 aa22.84■■□□□ 1.25
HCLS1-201ENST00000314583 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.83■■□□□ 1.25
HCLS1-201ENST00000314583 DISP2A7MBM2 1401 aa22.83■■□□□ 1.25
HCLS1-201ENST00000314583 ANXA1P04083 346 aa22.83■■□□□ 1.25
HCLS1-201ENST00000314583 PROSER3Q2NL68 480 aa22.83■■□□□ 1.25
HCLS1-201ENST00000314583 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.83■■□□□ 1.25
HCLS1-201ENST00000314583 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.83■■□□□ 1.25
HCLS1-201ENST00000314583 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.83■■□□□ 1.24
HCLS1-201ENST00000314583 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
HCLS1-201ENST00000314583 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
HCLS1-201ENST00000314583 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.82■■□□□ 1.24
HCLS1-201ENST00000314583 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.82■■□□□ 1.24
HCLS1-201ENST00000314583 POLA2Q14181 598 aa22.82■■□□□ 1.24
HCLS1-201ENST00000314583 PDIA6Q15084 440 aa22.82■■□□□ 1.24
HCLS1-201ENST00000314583 CASC1Q6TDU7 716 aa22.82■■□□□ 1.24
HCLS1-201ENST00000314583 RAB11FIP3O75154 756 aa22.81■■□□□ 1.24
HCLS1-201ENST00000314583 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.81■■□□□ 1.24
HCLS1-201ENST00000314583 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.81■■□□□ 1.24
HCLS1-201ENST00000314583 NRAPQ86VF7 1730 aa22.8■■□□□ 1.24
HCLS1-201ENST00000314583 PDE1AP54750 535 aa22.8■■□□□ 1.24
HCLS1-201ENST00000314583 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.8■■□□□ 1.24
HCLS1-201ENST00000314583 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.79■■□□□ 1.24
HCLS1-201ENST00000314583 SDSP20132 328 aa22.79■■□□□ 1.24
HCLS1-201ENST00000314583 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.78■■□□□ 1.24
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HCLS1-201ENST00000314583 AOX1Q06278 1338 aa22.77■■□□□ 1.24
HCLS1-201ENST00000314583 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
HCLS1-201ENST00000314583 MTX1Q13505 466 aa22.77■■□□□ 1.24
HCLS1-201ENST00000314583 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.77■■□□□ 1.24
HCLS1-201ENST00000314583 HSCBQ8IWL3 235 aa22.77■■□□□ 1.24
HCLS1-201ENST00000314583 LINS1Q8NG48 757 aa22.77■■□□□ 1.24
HCLS1-201ENST00000314583 SNX21Q969T3 373 aa22.77■■□□□ 1.24
HCLS1-201ENST00000314583 TNS2Q63HR2 1409 aa22.77■■□□□ 1.23
HCLS1-201ENST00000314583 TOM1O60784 492 aa22.75■■□□□ 1.23
HCLS1-201ENST00000314583 MX1P20591 662 aa22.75■■□□□ 1.23
HCLS1-201ENST00000314583 BCL11AQ9H165 835 aa22.75■■□□□ 1.23
HCLS1-201ENST00000314583 STAP2Q9UGK3 403 aa22.75■■□□□ 1.23
HCLS1-201ENST00000314583 SRGAP3O43295 1099 aa22.75■■□□□ 1.23
HCLS1-201ENST00000314583 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
HCLS1-201ENST00000314583 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
HCLS1-201ENST00000314583 UTYO14607 1347 aa22.74■■□□□ 1.23
HCLS1-201ENST00000314583 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.74■■□□□ 1.23
HCLS1-201ENST00000314583 NFKBIBQ15653 356 aa22.74■■□□□ 1.23
HCLS1-201ENST00000314583 USP16Q9Y5T5 823 aa22.74■■□□□ 1.23
HCLS1-201ENST00000314583 LRP6O75581 1613 aa22.73■■□□□ 1.23
HCLS1-201ENST00000314583 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.73■■□□□ 1.23
HCLS1-201ENST00000314583 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
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HCLS1-201ENST00000314583 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.72■■□□□ 1.23
HCLS1-201ENST00000314583 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.71■■□□□ 1.23
HCLS1-201ENST00000314583 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.71■■□□□ 1.23
HCLS1-201ENST00000314583 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.71■■□□□ 1.23
HCLS1-201ENST00000314583 GRM8O00222 908 aa22.7■■□□□ 1.23
HCLS1-201ENST00000314583 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.7■■□□□ 1.23
HCLS1-201ENST00000314583 REC8O95072 547 aa22.7■■□□□ 1.22
HCLS1-201ENST00000314583 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
HCLS1-201ENST00000314583 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.7■■□□□ 1.22
HCLS1-201ENST00000314583 KIF2CQ99661 725 aa22.7■■□□□ 1.22
HCLS1-201ENST00000314583 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
HCLS1-201ENST00000314583 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.69■■□□□ 1.22
HCLS1-201ENST00000314583 ITGB4P16144 1822 aa22.69■■□□□ 1.22
HCLS1-201ENST00000314583 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
HCLS1-201ENST00000314583 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
HCLS1-201ENST00000314583 AK9Q5TCS8 1911 aa22.68■■□□□ 1.22
HCLS1-201ENST00000314583 MYL6BP14649 208 aa22.68■■□□□ 1.22
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