RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307886.7

CTSW-201, Transcript of cathepsin W, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTSW, Length 1,300 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSW-201ENST00000307886 TEFQ10587 303 aa20.46■□□□□ 0.87
CTSW-201ENST00000307886 BCL2L12Q9HB09 334 aa20.46■□□□□ 0.87
CTSW-201ENST00000307886 NUDCQ9Y266 331 aa20.46■□□□□ 0.87
CTSW-201ENST00000307886 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.87
CTSW-201ENST00000307886 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CTSW-201ENST00000307886 FCHSD2O94868 740 aa20.45■□□□□ 0.86
CTSW-201ENST00000307886 ADCY9O60503 1353 aa20.44■□□□□ 0.86
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CTSW-201ENST00000307886 COL15A1P39059 1388 aa20.43■□□□□ 0.86
CTSW-201ENST00000307886 HEG1Q9ULI3 1381 aa20.43■□□□□ 0.86
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CTSW-201ENST00000307886 ATP10DQ9P241 1426 aa20.41■□□□□ 0.86
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CTSW-201ENST00000307886 MCM10Q7L590 875 aa20.41■□□□□ 0.86
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CTSW-201ENST00000307886 TBC1D9BQ66K14 1250 aa20.33■□□□□ 0.85
CTSW-201ENST00000307886 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
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CTSW-201ENST00000307886 DLEC1Q9Y238 1755 aa20.27■□□□□ 0.84
CTSW-201ENST00000307886 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.27■□□□□ 0.83
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CTSW-201ENST00000307886 NFE2L2Q16236 605 aa20.27■□□□□ 0.83
CTSW-201ENST00000307886 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
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CTSW-201ENST00000307886 C9orf131Q5VYM1 1079 aa20.26■□□□□ 0.83
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CTSW-201ENST00000307886 PRR5LQ6MZQ0 368 aa20.25■□□□□ 0.83
CTSW-201ENST00000307886 KDM3BQ7LBC6 1761 aa20.25■□□□□ 0.83
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CTSW-201ENST00000307886 C2CD5Q86YS7 1000 aa20.24■□□□□ 0.83
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CTSW-201ENST00000307886 H0YIN7 160 aa20.21■□□□□ 0.83
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CTSW-201ENST00000307886 CLEC4GQ6UXB4 293 aa20.21■□□□□ 0.83
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CTSW-201ENST00000307886 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CTSW-201ENST00000307886 RNF181Q9P0P0 153 aa20.19■□□□□ 0.82
CTSW-201ENST00000307886 LAMB4A4D0S4 1761 aa20.18■□□□□ 0.82
CTSW-201ENST00000307886 HLFQ16534 295 aa20.18■□□□□ 0.82
CTSW-201ENST00000307886 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CTSW-201ENST00000307886 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.18■□□□□ 0.82
CTSW-201ENST00000307886 NFKBIEO00221 500 aa20.17■□□□□ 0.82
CTSW-201ENST00000307886 PDE6BP35913 854 aa20.17■□□□□ 0.82
CTSW-201ENST00000307886 TMPOP42166 694 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CTSW-201ENST00000307886 CNBD1Q8NA66 436 aa20.17■□□□□ 0.82
CTSW-201ENST00000307886 SRGNP10124 158 aa20.16■□□□□ 0.82
CTSW-201ENST00000307886 RIPK4P57078 832 aa20.16■□□□□ 0.82
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