RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291901.12

TNNT1-201, Transcript of troponin T1, slow skeletal type, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNNT1, Length 967 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1-201ENST00000291901 COL15A1P39059 1388 aa22.58■■□□□ 1.21
TNNT1-201ENST00000291901 CEP350Q5VT06 3117 aa22.57■■□□□ 1.2
TNNT1-201ENST00000291901 KIF3CO14782 793 aa22.57■■□□□ 1.2
TNNT1-201ENST00000291901 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
TNNT1-201ENST00000291901 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
TNNT1-201ENST00000291901 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.56■■□□□ 1.2
TNNT1-201ENST00000291901 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.56■■□□□ 1.2
TNNT1-201ENST00000291901 NARFQ9UHQ1 456 aa22.56■■□□□ 1.2
TNNT1-201ENST00000291901 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.55■■□□□ 1.2
TNNT1-201ENST00000291901 NFIXQ14938 502 aa22.55■■□□□ 1.2
TNNT1-201ENST00000291901 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
TNNT1-201ENST00000291901 IL17REQ8NFR9 667 aa22.55■■□□□ 1.2
TNNT1-201ENST00000291901 TEFQ10587 303 aa22.54■■□□□ 1.2
TNNT1-201ENST00000291901 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.54■■□□□ 1.2
TNNT1-201ENST00000291901 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.54■■□□□ 1.2
TNNT1-201ENST00000291901 HSPA6P17066 643 aa22.53■■□□□ 1.2
TNNT1-201ENST00000291901 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.53■■□□□ 1.2
TNNT1-201ENST00000291901 SBF1O95248 1867 aa22.52■■□□□ 1.2
TNNT1-201ENST00000291901 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.52■■□□□ 1.2
TNNT1-201ENST00000291901 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.52■■□□□ 1.2
TNNT1-201ENST00000291901 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
TNNT1-201ENST00000291901 STARD3NLO95772 234 aa22.51■■□□□ 1.19
TNNT1-201ENST00000291901 ZNF790Q6PG37 636 aa22.51■■□□□ 1.19
TNNT1-201ENST00000291901 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.51■■□□□ 1.19
TNNT1-201ENST00000291901 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.51■■□□□ 1.19
TNNT1-201ENST00000291901 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.51■■□□□ 1.19
TNNT1-201ENST00000291901 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
TNNT1-201ENST00000291901 SERPINB2P05120 415 aa22.5■■□□□ 1.19
TNNT1-201ENST00000291901 PRKAR2BP31323 418 aa22.5■■□□□ 1.19
TNNT1-201ENST00000291901 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.49■■□□□ 1.19
TNNT1-201ENST00000291901 CFAP53Q96M91 514 aa22.49■■□□□ 1.19
TNNT1-201ENST00000291901 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.49■■□□□ 1.19
TNNT1-201ENST00000291901 RNF181Q9P0P0 153 aa22.48■■□□□ 1.19
TNNT1-201ENST00000291901 KCNQ3O43525 872 aa22.47■■□□□ 1.19
TNNT1-201ENST00000291901 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
TNNT1-201ENST00000291901 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.46■■□□□ 1.19
TNNT1-201ENST00000291901 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.46■■□□□ 1.19
TNNT1-201ENST00000291901 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.46■■□□□ 1.19
TNNT1-201ENST00000291901 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.45■■□□□ 1.19
TNNT1-201ENST00000291901 A0A087WZG4 1122 aa22.45■■□□□ 1.18
TNNT1-201ENST00000291901 TOMM70O94826 608 aa22.45■■□□□ 1.18
TNNT1-201ENST00000291901 SCN7AQ01118 1682 aa22.45■■□□□ 1.18
TNNT1-201ENST00000291901 BTBD11A6QL63 1104 aa22.44■■□□□ 1.18
TNNT1-201ENST00000291901 A1BGP04217 495 aa22.44■■□□□ 1.18
TNNT1-201ENST00000291901 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
TNNT1-201ENST00000291901 PPP2R1AP30153 589 aa22.44■■□□□ 1.18
TNNT1-201ENST00000291901 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.18
TNNT1-201ENST00000291901 RASSF7Q02833 373 aa22.44■■□□□ 1.18
TNNT1-201ENST00000291901 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.44■■□□□ 1.18
TNNT1-201ENST00000291901 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.44■■□□□ 1.18
TNNT1-201ENST00000291901 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.44■■□□□ 1.18
TNNT1-201ENST00000291901 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.44■■□□□ 1.18
TNNT1-201ENST00000291901 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
TNNT1-201ENST00000291901 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.43■■□□□ 1.18
TNNT1-201ENST00000291901 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.43■■□□□ 1.18
TNNT1-201ENST00000291901 NUDCQ9Y266 331 aa22.43■■□□□ 1.18
TNNT1-201ENST00000291901 H0YIN7 160 aa22.41■■□□□ 1.18
TNNT1-201ENST00000291901 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
TNNT1-201ENST00000291901 MCM10Q7L590 875 aa22.41■■□□□ 1.18
TNNT1-201ENST00000291901 TTLL6Q8N841 843 aa22.41■■□□□ 1.18
TNNT1-201ENST00000291901 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
TNNT1-201ENST00000291901 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
TNNT1-201ENST00000291901 RRAGCQ9HB90 399 aa22.4■■□□□ 1.18
TNNT1-201ENST00000291901 CACNA1SQ13698 1873 aa22.39■■□□□ 1.18
TNNT1-201ENST00000291901 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.39■■□□□ 1.18
TNNT1-201ENST00000291901 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.39■■□□□ 1.17
TNNT1-201ENST00000291901 DCTN1Q14203 1278 aa22.39■■□□□ 1.17
TNNT1-201ENST00000291901 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
TNNT1-201ENST00000291901 USP16Q9Y5T5 823 aa22.39■■□□□ 1.17
TNNT1-201ENST00000291901 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
TNNT1-201ENST00000291901 BCORQ6W2J9 1755 aa22.38■■□□□ 1.17
TNNT1-201ENST00000291901 PRELPP51888 382 aa22.38■■□□□ 1.17
TNNT1-201ENST00000291901 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
TNNT1-201ENST00000291901 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.172e-12■□□□□ 9.8
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TNNT1-201ENST00000291901 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.37■■□□□ 1.17
TNNT1-201ENST00000291901 APLP1P51693 650 aa22.37■■□□□ 1.17
TNNT1-201ENST00000291901 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.37■■□□□ 1.17
TNNT1-201ENST00000291901 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
TNNT1-201ENST00000291901 CAMTA2O94983 1202 aa22.36■■□□□ 1.17
TNNT1-201ENST00000291901 NPHP1O15259 732 aa22.35■■□□□ 1.17
TNNT1-201ENST00000291901 LMNB1P20700 586 aa22.35■■□□□ 1.17
TNNT1-201ENST00000291901 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
TNNT1-201ENST00000291901 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
TNNT1-201ENST00000291901 SETDB2Q96T68 719 aa22.35■■□□□ 1.17
TNNT1-201ENST00000291901 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.35■■□□□ 1.17
TNNT1-201ENST00000291901 WDR90Q96KV7 1748 aa22.34■■□□□ 1.17
TNNT1-201ENST00000291901 PDE6BP35913 854 aa22.34■■□□□ 1.17
TNNT1-201ENST00000291901 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.34■■□□□ 1.17
TNNT1-201ENST00000291901 NFKBIEO00221 500 aa22.32■■□□□ 1.16
TNNT1-201ENST00000291901 C21orf2O43822 256 aa22.32■■□□□ 1.16
TNNT1-201ENST00000291901 HTRA3P83110 453 aa22.32■■□□□ 1.16
TNNT1-201ENST00000291901 CNBD1Q8NA66 436 aa22.32■■□□□ 1.16
TNNT1-201ENST00000291901 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TNNT1-201ENST00000291901 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.31■■□□□ 1.16
TNNT1-201ENST00000291901 SLX4Q8IY92 1834 aa22.31■■□□□ 1.16
TNNT1-201ENST00000291901 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.3■■□□□ 1.16
TNNT1-201ENST00000291901 ST5P78524 1137 aa22.29■■□□□ 1.16
TNNT1-201ENST00000291901 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.29■■□□□ 1.16
TNNT1-201ENST00000291901 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
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