RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261507.10

MSMO1-201, Transcript of methylsterol monooxygenase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSMO1, Length 2,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMO1-201ENST00000261507 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
MSMO1-201ENST00000261507 CHL1O00533 1208 aa17.78■□□□□ 0.44
MSMO1-201ENST00000261507 BAG6P46379 1132 aa17.78■□□□□ 0.44
MSMO1-201ENST00000261507 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa17.78■□□□□ 0.44
MSMO1-201ENST00000261507 ITPRIPQ8IWB1 547 aa17.78■□□□□ 0.44
MSMO1-201ENST00000261507 TSPYL4Q9UJ04 414 aa17.78■□□□□ 0.44
MSMO1-201ENST00000261507 ZNF831Q5JPB2 1677 aa17.78■□□□□ 0.44
MSMO1-201ENST00000261507 APBA3O96018 575 aa17.78■□□□□ 0.44
MSMO1-201ENST00000261507 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
MSMO1-201ENST00000261507 TMEM57Q8N5G2 664 aa17.78■□□□□ 0.44
MSMO1-201ENST00000261507 TSPYL6Q8N831 410 aa17.78■□□□□ 0.44
MSMO1-201ENST00000261507 ZNF853P0CG23 659 aa17.77■□□□□ 0.44
MSMO1-201ENST00000261507 ZNF790Q6PG37 636 aa17.77■□□□□ 0.44
MSMO1-201ENST00000261507 ATG3Q9NT62 314 aa17.77■□□□□ 0.44
MSMO1-201ENST00000261507 UBR2Q8IWV8 1755 aa17.77■□□□□ 0.44
MSMO1-201ENST00000261507 LY75O60449 1722 aa17.77■□□□□ 0.43
MSMO1-201ENST00000261507 CHMP4AQ9BY43 222 aa17.77■□□□□ 0.43
MSMO1-201ENST00000261507 ILDR2Q71H61 639 aa17.76■□□□□ 0.43
MSMO1-201ENST00000261507 FMNL2Q96PY5 1086 aa17.76■□□□□ 0.43
MSMO1-201ENST00000261507 PALLDQ8WX93 1383 aa17.76■□□□□ 0.43
MSMO1-201ENST00000261507 SLC27A3Q5K4L6 730 aa17.75■□□□□ 0.43
MSMO1-201ENST00000261507 VSIG10Q8N0Z9 540 aa17.75■□□□□ 0.43
MSMO1-201ENST00000261507 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
MSMO1-201ENST00000261507 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
MSMO1-201ENST00000261507 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
MSMO1-201ENST00000261507 DDRGK1Q96HY6 314 aa17.74■□□□□ 0.43
MSMO1-201ENST00000261507 ASAP1Q9ULH1 1129 aa17.74■□□□□ 0.43
MSMO1-201ENST00000261507 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
MSMO1-201ENST00000261507 DEKP35659 375 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
MSMO1-201ENST00000261507 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP17.73■□□□□ 0.438e-13■■■□□ 18.9
MSMO1-201ENST00000261507 MBIPQ9NS73 344 aa17.73■□□□□ 0.43
MSMO1-201ENST00000261507 VAMP4O75379 141 aa17.72■□□□□ 0.43
MSMO1-201ENST00000261507 AAMPQ13685 434 aa17.72■□□□□ 0.43
MSMO1-201ENST00000261507 KCPQ6ZWJ8 1503 aa17.72■□□□□ 0.43
MSMO1-201ENST00000261507 SLC39A6Q13433 755 aa17.72■□□□□ 0.43
MSMO1-201ENST00000261507 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
MSMO1-201ENST00000261507 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa17.71■□□□□ 0.43
MSMO1-201ENST00000261507 HOXB7P09629 217 aa17.71■□□□□ 0.43
MSMO1-201ENST00000261507 SIK1P57059 783 aa17.71■□□□□ 0.43
MSMO1-201ENST00000261507 PTF1AQ7RTS3 328 aa17.71■□□□□ 0.43
MSMO1-201ENST00000261507 HEG1Q9ULI3 1381 aa17.71■□□□□ 0.42
MSMO1-201ENST00000261507 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
MSMO1-201ENST00000261507 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
MSMO1-201ENST00000261507 DDX19BQ9UMR2 479 aa17.7■□□□□ 0.42
MSMO1-201ENST00000261507 C8orf58Q8NAV2 365 aa17.7■□□□□ 0.42
MSMO1-201ENST00000261507 MIS18AQ9NYP9 233 aa17.7■□□□□ 0.42
MSMO1-201ENST00000261507 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa17.69■□□□□ 0.42
MSMO1-201ENST00000261507 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
MSMO1-201ENST00000261507 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
MSMO1-201ENST00000261507 ALDH1L2Q3SY69 923 aa17.69■□□□□ 0.42
MSMO1-201ENST00000261507 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
MSMO1-201ENST00000261507 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
MSMO1-201ENST00000261507 ATP6V1AP38606 617 aa17.68■□□□□ 0.42
MSMO1-201ENST00000261507 TXNRD1Q16881 649 aa17.68■□□□□ 0.42
MSMO1-201ENST00000261507 CAMKK2Q96RR4 588 aa17.68■□□□□ 0.42
MSMO1-201ENST00000261507 LAMB4A4D0S4 1761 aa17.68■□□□□ 0.42
MSMO1-201ENST00000261507 STARD3NLO95772 234 aa17.68■□□□□ 0.42
MSMO1-201ENST00000261507 KIF16BQ96L93 1317 aa17.67■□□□□ 0.42
MSMO1-201ENST00000261507 C5P01031 1676 aa17.67■□□□□ 0.42
MSMO1-201ENST00000261507 RREB1Q92766 1687 aa17.67■□□□□ 0.42
MSMO1-201ENST00000261507 TAF1LQ8IZX4 1826 aa17.67■□□□□ 0.42
MSMO1-201ENST00000261507 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
MSMO1-201ENST00000261507 KCNQ3O43525 872 aa17.67■□□□□ 0.42
MSMO1-201ENST00000261507 KRT24Q2M2I5 525 aa17.67■□□□□ 0.42
MSMO1-201ENST00000261507 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
MSMO1-201ENST00000261507 C1orf115Q9H7X2 142 aa17.67■□□□□ 0.42
MSMO1-201ENST00000261507 TJP1Q07157 1748 aa17.66■□□□□ 0.42
MSMO1-201ENST00000261507 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
MSMO1-201ENST00000261507 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
MSMO1-201ENST00000261507 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
MSMO1-201ENST00000261507 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
MSMO1-201ENST00000261507 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
MSMO1-201ENST00000261507 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
MSMO1-201ENST00000261507 ERBB4Q15303 1308 aa17.65■□□□□ 0.42
MSMO1-201ENST00000261507 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
MSMO1-201ENST00000261507 ZNF428Q96B54 188 aa17.64■□□□□ 0.41
MSMO1-201ENST00000261507 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
MSMO1-201ENST00000261507 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa17.63■□□□□ 0.41
MSMO1-201ENST00000261507 CACNA1FO60840 1977 aa17.63■□□□□ 0.41
MSMO1-201ENST00000261507 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP17.62■□□□□ 0.41
MSMO1-201ENST00000261507 NBPF14Q5TI25 921 aa17.62■□□□□ 0.41
MSMO1-201ENST00000261507 DEFB132Q7Z7B7 95 aa17.62■□□□□ 0.41
MSMO1-201ENST00000261507 DNAJC10Q8IXB1 793 aa17.62■□□□□ 0.41
MSMO1-201ENST00000261507 NUP188Q5SRE5 1749 aa17.62■□□□□ 0.41
MSMO1-201ENST00000261507 SMC5Q8IY18 1101 aa17.61■□□□□ 0.41
MSMO1-201ENST00000261507 PROM2Q8N271 834 aa17.61■□□□□ 0.41
MSMO1-201ENST00000261507 SLC4A9Q96Q91 983 aa17.61■□□□□ 0.41
MSMO1-201ENST00000261507 C4BP0C0L5 1744 aa17.61■□□□□ 0.41
MSMO1-201ENST00000261507 SOCS7O14512 581 aa17.61■□□□□ 0.41
MSMO1-201ENST00000261507 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
MSMO1-201ENST00000261507 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
MSMO1-201ENST00000261507 ITPK1Q13572 414 aa17.6■□□□□ 0.41
MSMO1-201ENST00000261507 CCDC30Q5VVM6 783 aa17.6■□□□□ 0.41
MSMO1-201ENST00000261507 CCDC87Q9NVE4 849 aa17.6■□□□□ 0.41
MSMO1-201ENST00000261507 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa17.59■□□□□ 0.41
MSMO1-201ENST00000261507 AK7Q96M32 723 aa17.59■□□□□ 0.41
MSMO1-201ENST00000261507 LNPKQ9C0E8 428 aa17.59■□□□□ 0.41
MSMO1-201ENST00000261507 LRRC4BQ9NT99 713 aa17.59■□□□□ 0.41
MSMO1-201ENST00000261507 STK32BQ9NY57 414 aa17.59■□□□□ 0.41
MSMO1-201ENST00000261507 FLAD1Q8NFF5 587 aa17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.3 ms