RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253754.7

PDLIM4-201, Transcript of PDZ and LIM domain 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDLIM4, Length 2,282 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM4-201ENST00000253754 PDE1AP54750 535 aa23.08■■□□□ 1.29
PDLIM4-201ENST00000253754 KDM3BQ7LBC6 1761 aa23.08■■□□□ 1.28
PDLIM4-201ENST00000253754 PXDNLA1KZ92 1463 aa23.07■■□□□ 1.28
PDLIM4-201ENST00000253754 ADAMTS2O95450 1211 aa23.07■■□□□ 1.28
PDLIM4-201ENST00000253754 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
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PDLIM4-201ENST00000253754 BTG4Q9NY30 223 aa23.07■■□□□ 1.28
PDLIM4-201ENST00000253754 PHKG2P15735 406 aa23.06■■□□□ 1.28
PDLIM4-201ENST00000253754 HSPA1LP34931 641 aa23.06■■□□□ 1.28
PDLIM4-201ENST00000253754 LRRCC1Q9C099 1032 aa23.06■■□□□ 1.28
PDLIM4-201ENST00000253754 FOXD4L1Q9NU39 408 aa23.06■■□□□ 1.28
PDLIM4-201ENST00000253754 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
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PDLIM4-201ENST00000253754 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.05■■□□□ 1.28
PDLIM4-201ENST00000253754 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.05■■□□□ 1.28
PDLIM4-201ENST00000253754 USP26Q9BXU7 913 aa23.05■■□□□ 1.28
PDLIM4-201ENST00000253754 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa23.05■■□□□ 1.28
PDLIM4-201ENST00000253754 PI4KAP2A4QPH2 592 aa23.05■■□□□ 1.28
PDLIM4-201ENST00000253754 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa23.05■■□□□ 1.28
PDLIM4-201ENST00000253754 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
PDLIM4-201ENST00000253754 CYP27B1O15528 508 aa23.04■■□□□ 1.28
PDLIM4-201ENST00000253754 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa23.04■■□□□ 1.28
PDLIM4-201ENST00000253754 OSBPL3Q9H4L5 887 aa23.04■■□□□ 1.28
PDLIM4-201ENST00000253754 SALL3Q9BXA9 1300 aa23.04■■□□□ 1.28
PDLIM4-201ENST00000253754 HOXB7P09629 217 aa23.03■■□□□ 1.28
PDLIM4-201ENST00000253754 CACNA1FO60840 1977 aa23.03■■□□□ 1.28
PDLIM4-201ENST00000253754 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
PDLIM4-201ENST00000253754 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
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PDLIM4-201ENST00000253754 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.02■■□□□ 1.28
PDLIM4-201ENST00000253754 MCM4P33991 863 aa23.02■■□□□ 1.28
PDLIM4-201ENST00000253754 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
PDLIM4-201ENST00000253754 PROSER3Q2NL68 480 aa23.01■■□□□ 1.27
PDLIM4-201ENST00000253754 BEND3Q5T5X7 828 aa23.01■■□□□ 1.27
PDLIM4-201ENST00000253754 CASC1Q6TDU7 716 aa23.01■■□□□ 1.27
PDLIM4-201ENST00000253754 DNAAF4Q8WXU2 420 aa23.01■■□□□ 1.27
PDLIM4-201ENST00000253754 MX1P20591 662 aa23.01■■□□□ 1.27
PDLIM4-201ENST00000253754 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23■■□□□ 1.27
PDLIM4-201ENST00000253754 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PDLIM4-201ENST00000253754 ADCY9O60503 1353 aa23■■□□□ 1.27
PDLIM4-201ENST00000253754 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23■■□□□ 1.27
PDLIM4-201ENST00000253754 IL2RBP14784 551 aa23■■□□□ 1.27
PDLIM4-201ENST00000253754 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa23■■□□□ 1.27
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PDLIM4-201ENST00000253754 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.99■■□□□ 1.27
PDLIM4-201ENST00000253754 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PDLIM4-201ENST00000253754 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.99■■□□□ 1.27
PDLIM4-201ENST00000253754 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PDLIM4-201ENST00000253754 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.98■■□□□ 1.27
PDLIM4-201ENST00000253754 SSH3Q8TE77 659 aa22.98■■□□□ 1.27
PDLIM4-201ENST00000253754 DCAF5Q96JK2 942 aa22.98■■□□□ 1.27
PDLIM4-201ENST00000253754 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PDLIM4-201ENST00000253754 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PDLIM4-201ENST00000253754 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.98■■□□□ 1.27
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PDLIM4-201ENST00000253754 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
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PDLIM4-201ENST00000253754 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.95■■□□□ 1.26
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PDLIM4-201ENST00000253754 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.95■■□□□ 1.26
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PDLIM4-201ENST00000253754 SLC39A6Q13433 755 aa22.94■■□□□ 1.26
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PDLIM4-201ENST00000253754 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
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PDLIM4-201ENST00000253754 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.94■■□□□ 1.26
PDLIM4-201ENST00000253754 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.94■■□□□ 1.26
PDLIM4-201ENST00000253754 REC8O95072 547 aa22.94■■□□□ 1.26
PDLIM4-201ENST00000253754 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
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PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF790Q6PG37 636 aa22.92■■□□□ 1.26
PDLIM4-201ENST00000253754 STAP2Q9UGK3 403 aa22.92■■□□□ 1.26
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PDLIM4-201ENST00000253754 CABP4P57796 275 aa22.91■■□□□ 1.26
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PDLIM4-201ENST00000253754 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.9■■□□□ 1.26
PDLIM4-201ENST00000253754 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
PDLIM4-201ENST00000253754 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
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PDLIM4-201ENST00000253754 CHMLP26374 656 aa22.89■■□□□ 1.25
PDLIM4-201ENST00000253754 KSR2Q6VAB6 950 aa22.89■■□□□ 1.25
PDLIM4-201ENST00000253754 JCADQ9P266 1359 aa22.88■■□□□ 1.25
PDLIM4-201ENST00000253754 TRAK2O60296 914 aa22.88■■□□□ 1.25
PDLIM4-201ENST00000253754 RAB11FIP3O75154 756 aa22.88■■□□□ 1.25
PDLIM4-201ENST00000253754 PDIA6Q15084 440 aa22.87■■□□□ 1.25
PDLIM4-201ENST00000253754 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.87■■□□□ 1.25
PDLIM4-201ENST00000253754 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.87■■□□□ 1.25
PDLIM4-201ENST00000253754 IL25Q9H293 177 aa22.87■■□□□ 1.25
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