RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 SMIM5Q71RC9 77 aa33.41■■■□□ 2.94
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CAPNS1-201ENST00000246533 E9PSI1 815 aa33.4■■■□□ 2.94
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CAPNS1-201ENST00000246533 SLC15A2Q16348 729 aa33.39■■■□□ 2.94
CAPNS1-201ENST00000246533 C8orf34Q49A92 452 aa33.39■■■□□ 2.94
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CAPNS1-201ENST00000246533 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP33.06■■■□□ 2.88
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CAPNS1-201ENST00000246533 C8orf58Q8NAV2 365 aa33.05■■■□□ 2.88
CAPNS1-201ENST00000246533 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP33.05■■■□□ 2.88
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