RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225603.8

CBX1-201, Transcript of chromobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CBX1, Length 2,232 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-201ENST00000225603 RGS12O14924 1447 aa22.95■■□□□ 1.27
CBX1-201ENST00000225603 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.95■■□□□ 1.26
CBX1-201ENST00000225603 PROSER3Q2NL68 480 aa22.95■■□□□ 1.26
CBX1-201ENST00000225603 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CBX1-201ENST00000225603 KCNQ2O43526 872 aa22.94■■□□□ 1.26
CBX1-201ENST00000225603 MS4A1P11836 297 aa22.94■■□□□ 1.26
CBX1-201ENST00000225603 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CBX1-201ENST00000225603 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CBX1-201ENST00000225603 FLIIQ13045 1269 aa22.93■■□□□ 1.26
CBX1-201ENST00000225603 ABCC4O15439 1325 aa22.93■■□□□ 1.26
CBX1-201ENST00000225603 PTPRCP08575 1304 aa22.93■■□□□ 1.26
CBX1-201ENST00000225603 PDIA6Q15084 440 aa22.92■■□□□ 1.26
CBX1-201ENST00000225603 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CBX1-201ENST00000225603 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.92■■□□□ 1.26
CBX1-201ENST00000225603 F6X3S4 739 aa22.91■■□□□ 1.26
CBX1-201ENST00000225603 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CBX1-201ENST00000225603 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.9■■□□□ 1.26
CBX1-201ENST00000225603 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.9■■□□□ 1.26
CBX1-201ENST00000225603 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CBX1-201ENST00000225603 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.89■■□□□ 1.26
CBX1-201ENST00000225603 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
CBX1-201ENST00000225603 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
CBX1-201ENST00000225603 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
CBX1-201ENST00000225603 CACNA1FO60840 1977 aa22.88■■□□□ 1.25
CBX1-201ENST00000225603 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CBX1-201ENST00000225603 MYL6BP14649 208 aa22.86■■□□□ 1.25
CBX1-201ENST00000225603 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
CBX1-201ENST00000225603 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.86■■□□□ 1.25
CBX1-201ENST00000225603 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.85■■□□□ 1.25
CBX1-201ENST00000225603 HYPKQ9NX55 129 aa22.85■■□□□ 1.25
CBX1-201ENST00000225603 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.85■■□□□ 1.25
CBX1-201ENST00000225603 NBPF26B4DH59 902 aa22.85■■□□□ 1.25
CBX1-201ENST00000225603 A1BGP04217 495 aa22.85■■□□□ 1.25
CBX1-201ENST00000225603 NBPF14Q5TI25 921 aa22.85■■□□□ 1.25
CBX1-201ENST00000225603 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CBX1-201ENST00000225603 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CBX1-201ENST00000225603 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.85■■□□□ 1.25
CBX1-201ENST00000225603 NBPF15Q8N660 670 aa22.85■■□□□ 1.25
CBX1-201ENST00000225603 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.84■■□□□ 1.25
CBX1-201ENST00000225603 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.84■■□□□ 1.25
CBX1-201ENST00000225603 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CBX1-201ENST00000225603 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.82■■□□□ 1.24
CBX1-201ENST00000225603 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CBX1-201ENST00000225603 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.82■■□□□ 1.24
CBX1-201ENST00000225603 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.81■■□□□ 1.24
CBX1-201ENST00000225603 ADCY9O60503 1353 aa22.81■■□□□ 1.24
CBX1-201ENST00000225603 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.81■■□□□ 1.24
CBX1-201ENST00000225603 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.81■■□□□ 1.24
CBX1-201ENST00000225603 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.81■■□□□ 1.24
CBX1-201ENST00000225603 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.81■■□□□ 1.24
CBX1-201ENST00000225603 PALLDQ8WX93 1383 aa22.81■■□□□ 1.24
CBX1-201ENST00000225603 COPS6Q7L5N1 327 aa22.8■■□□□ 1.24
CBX1-201ENST00000225603 POTEAQ6S8J7 498 aa22.8■■□□□ 1.24
CBX1-201ENST00000225603 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CBX1-201ENST00000225603 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.79■■□□□ 1.24
CBX1-201ENST00000225603 RXRBP28702 533 aa22.79■■□□□ 1.24
CBX1-201ENST00000225603 SIK1P57059 783 aa22.79■■□□□ 1.24
CBX1-201ENST00000225603 ERBB4Q15303 1308 aa22.78■■□□□ 1.24
CBX1-201ENST00000225603 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CBX1-201ENST00000225603 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.78■■□□□ 1.24
CBX1-201ENST00000225603 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CBX1-201ENST00000225603 AAMPQ13685 434 aa22.77■■□□□ 1.24
CBX1-201ENST00000225603 KSR2Q6VAB6 950 aa22.77■■□□□ 1.24
CBX1-201ENST00000225603 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
CBX1-201ENST00000225603 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.77■■□□□ 1.24
CBX1-201ENST00000225603 NHSQ6T4R5 1651 aa22.77■■□□□ 1.24
CBX1-201ENST00000225603 STARD3NLO95772 234 aa22.77■■□□□ 1.24
CBX1-201ENST00000225603 ATP6V1AP38606 617 aa22.77■■□□□ 1.24
CBX1-201ENST00000225603 TJP1Q07157 1748 aa22.76■■□□□ 1.23
CBX1-201ENST00000225603 ITPK1Q13572 414 aa22.76■■□□□ 1.23
CBX1-201ENST00000225603 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.76■■□□□ 1.23
CBX1-201ENST00000225603 SBF2Q86WG5 1849 aa22.75■■□□□ 1.23
CBX1-201ENST00000225603 MEIS3Q99687 375 aa22.75■■□□□ 1.23
CBX1-201ENST00000225603 BTAF1O14981 1849 aa22.75■■□□□ 1.23
CBX1-201ENST00000225603 IGHDP01880 384 aa22.74■■□□□ 1.23
CBX1-201ENST00000225603 BEND3Q5T5X7 828 aa22.74■■□□□ 1.23
CBX1-201ENST00000225603 MSH5O43196 834 aa22.74■■□□□ 1.23
CBX1-201ENST00000225603 KCNQ4P56696 695 aa22.74■■□□□ 1.23
CBX1-201ENST00000225603 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.74■■□□□ 1.23
CBX1-201ENST00000225603 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.74■■□□□ 1.23
CBX1-201ENST00000225603 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
CBX1-201ENST00000225603 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.73■■□□□ 1.23
CBX1-201ENST00000225603 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.73■■□□□ 1.23
CBX1-201ENST00000225603 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.72■■□□□ 1.23
CBX1-201ENST00000225603 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.72■■□□□ 1.23
CBX1-201ENST00000225603 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.72■■□□□ 1.23
CBX1-201ENST00000225603 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.72■■□□□ 1.23
CBX1-201ENST00000225603 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.72■■□□□ 1.23
CBX1-201ENST00000225603 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CBX1-201ENST00000225603 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CBX1-201ENST00000225603 EP400Q96L91 3159 aa22.71■■□□□ 1.23
CBX1-201ENST00000225603 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
CBX1-201ENST00000225603 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CBX1-201ENST00000225603 ATP10DQ9P241 1426 aa22.69■■□□□ 1.22
CBX1-201ENST00000225603 USP44Q9H0E7 712 aa22.69■■□□□ 1.22
CBX1-201ENST00000225603 TRIM37O94972 964 aa22.69■■□□□ 1.22
CBX1-201ENST00000225603 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CBX1-201ENST00000225603 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CBX1-201ENST00000225603 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CBX1-201ENST00000225603 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms