RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225298.11

UTP18-201, Transcript of UTP18, small subunit processome component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UTP18, Length 1,894 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP18-201ENST00000225298 EXOC5O00471 708 aa23.55■■□□□ 1.36
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UTP18-201ENST00000225298 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
UTP18-201ENST00000225298 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
UTP18-201ENST00000225298 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.54■■□□□ 1.36
UTP18-201ENST00000225298 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
UTP18-201ENST00000225298 ALDH1L1O75891 902 aa23.53■■□□□ 1.36
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UTP18-201ENST00000225298 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa23.41■■□□□ 1.34
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UTP18-201ENST00000225298 LRRCC1Q9C099 1032 aa23.4■■□□□ 1.34
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UTP18-201ENST00000225298 RAB11FIP3O75154 756 aa23.39■■□□□ 1.33
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UTP18-201ENST00000225298 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa23.37■■□□□ 1.33
UTP18-201ENST00000225298 STARD3NLO95772 234 aa23.37■■□□□ 1.33
UTP18-201ENST00000225298 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.37■■□□□ 1.33
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UTP18-201ENST00000225298 GLI3P10071 1580 aa23.35■■□□□ 1.33
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UTP18-201ENST00000225298 MTX1Q13505 466 aa23.35■■□□□ 1.33
UTP18-201ENST00000225298 C8orf37Q96NL8 207 aa23.35■■□□□ 1.33
UTP18-201ENST00000225298 NBPF26B4DH59 902 aa23.34■■□□□ 1.33
UTP18-201ENST00000225298 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
UTP18-201ENST00000225298 SURF6O75683 361 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
UTP18-201ENST00000225298 IGKV5-2P06315 115 aa23.34■■□□□ 1.33
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