RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 IL25Q9H293 177 aa26.8■■□□□ 1.88
HTATSF1-201ENST00000218364 POLA2Q14181 598 aa26.8■■□□□ 1.88
HTATSF1-201ENST00000218364 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
HTATSF1-201ENST00000218364 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
HTATSF1-201ENST00000218364 NECTIN2Q92692 538 aa26.8■■□□□ 1.88
HTATSF1-201ENST00000218364 PDCL3Q9H2J4 239 aa26.79■■□□□ 1.88
HTATSF1-201ENST00000218364 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa26.78■■□□□ 1.88
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM87AQ8NBN3 555 aa26.78■■□□□ 1.88
HTATSF1-201ENST00000218364 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
HTATSF1-201ENST00000218364 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa26.78■■□□□ 1.88
HTATSF1-201ENST00000218364 PHF14O94880 888 aa26.77■■□□□ 1.88
HTATSF1-201ENST00000218364 PI4K2BQ8TCG2 481 aa26.77■■□□□ 1.88
HTATSF1-201ENST00000218364 RAD50Q92878 1312 aa26.77■■□□□ 1.88
HTATSF1-201ENST00000218364 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
HTATSF1-201ENST00000218364 SGSM2O43147 1006 aa26.76■■□□□ 1.87
HTATSF1-201ENST00000218364 HOXC9P31274 260 aa26.76■■□□□ 1.87
HTATSF1-201ENST00000218364 RNF214Q8ND24 703 aa26.76■■□□□ 1.87
HTATSF1-201ENST00000218364 DIP2AQ14689 1571 aa26.76■■□□□ 1.87
HTATSF1-201ENST00000218364 USP48Q86UV5 1035 aa26.75■■□□□ 1.87
HTATSF1-201ENST00000218364 NUTM1Q86Y26 1132 aa26.75■■□□□ 1.87
HTATSF1-201ENST00000218364 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.75■■□□□ 1.87
HTATSF1-201ENST00000218364 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
HTATSF1-201ENST00000218364 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
HTATSF1-201ENST00000218364 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.75■■□□□ 1.87
HTATSF1-201ENST00000218364 RHPN1Q8TCX5 695 aa26.75■■□□□ 1.87
HTATSF1-201ENST00000218364 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.75■■□□□ 1.87
HTATSF1-201ENST00000218364 TTC14Q96N46 770 aa26.74■■□□□ 1.87
HTATSF1-201ENST00000218364 SURF6O75683 361 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
HTATSF1-201ENST00000218364 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa26.73■■□□□ 1.87
HTATSF1-201ENST00000218364 SNX14Q9Y5W7 946 aa26.73■■□□□ 1.87
HTATSF1-201ENST00000218364 KIF1BPQ96EK5 621 aa26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1-201ENST00000218364 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1-201ENST00000218364 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1-201ENST00000218364 NLRP6P59044 892 aa26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1-201ENST00000218364 UVSSAQ2YD98 709 aa26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1-201ENST00000218364 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM184AQ8NB25 1140 aa26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1-201ENST00000218364 USP54Q70EL1 1684 aa26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1-201ENST00000218364 GDPD2Q9HCC8 539 aa26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1-201ENST00000218364 TBX22Q9Y458 520 aa26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1-201ENST00000218364 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
HTATSF1-201ENST00000218364 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
HTATSF1-201ENST00000218364 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa26.7■■□□□ 1.86
HTATSF1-201ENST00000218364 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
HTATSF1-201ENST00000218364 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.69■■□□□ 1.86
HTATSF1-201ENST00000218364 CNTROBQ8N137 903 aa26.69■■□□□ 1.86
HTATSF1-201ENST00000218364 EID1Q9Y6B2 187 aa26.69■■□□□ 1.86
HTATSF1-201ENST00000218364 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
HTATSF1-201ENST00000218364 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa26.68■■□□□ 1.86
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKARQ7Z5J8 1434 aa26.68■■□□□ 1.86
HTATSF1-201ENST00000218364 SRGAP3O43295 1099 aa26.67■■□□□ 1.86
HTATSF1-201ENST00000218364 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC183Q5T5S1 534 aa26.67■■□□□ 1.86
HTATSF1-201ENST00000218364 KLHL34Q8N239 644 aa26.67■■□□□ 1.86
HTATSF1-201ENST00000218364 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa26.67■■□□□ 1.86
HTATSF1-201ENST00000218364 AK2P54819 239 aa26.67■■□□□ 1.86
HTATSF1-201ENST00000218364 SLIT1O75093 1534 aa26.67■■□□□ 1.86
HTATSF1-201ENST00000218364 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
HTATSF1-201ENST00000218364 HOXB7P09629 217 aa26.66■■□□□ 1.86
HTATSF1-201ENST00000218364 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
HTATSF1-201ENST00000218364 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
HTATSF1-201ENST00000218364 RASEFQ8IZ41 740 aa26.66■■□□□ 1.86
HTATSF1-201ENST00000218364 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.66■■□□□ 1.86
HTATSF1-201ENST00000218364 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa26.66■■□□□ 1.86
HTATSF1-201ENST00000218364 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
HTATSF1-201ENST00000218364 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
HTATSF1-201ENST00000218364 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
HTATSF1-201ENST00000218364 BEND3Q5T5X7 828 aa26.65■■□□□ 1.86
HTATSF1-201ENST00000218364 RUFY3Q7L099 469 aa26.65■■□□□ 1.86
HTATSF1-201ENST00000218364 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
HTATSF1-201ENST00000218364 TTC41PQ6P2S7 1318 aa26.64■■□□□ 1.86
HTATSF1-201ENST00000218364 STX6O43752 255 aa26.64■■□□□ 1.86
HTATSF1-201ENST00000218364 UQCRHLA0A096LP55 91 aa26.63■■□□□ 1.85
HTATSF1-201ENST00000218364 UQCRHP07919 91 aa26.63■■□□□ 1.85
HTATSF1-201ENST00000218364 SYT1P21579 422 aa26.63■■□□□ 1.85
HTATSF1-201ENST00000218364 MAP7D2Q96T17 732 aa26.63■■□□□ 1.85
HTATSF1-201ENST00000218364 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.63■■□□□ 1.85
HTATSF1-201ENST00000218364 CNPY2Q9Y2B0 182 aa26.63■■□□□ 1.85
HTATSF1-201ENST00000218364 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
HTATSF1-201ENST00000218364 UBE2HP62256 183 aa26.63■■□□□ 1.85
HTATSF1-201ENST00000218364 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP26.63■■□□□ 1.85
HTATSF1-201ENST00000218364 PTMAP06454 111 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
HTATSF1-201ENST00000218364 SASS6Q6UVJ0 657 aa26.63■■□□□ 1.85
HTATSF1-201ENST00000218364 VSIG10Q8N0Z9 540 aa26.63■■□□□ 1.85
HTATSF1-201ENST00000218364 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.63■■□□□ 1.85
HTATSF1-201ENST00000218364 KIAA2012Q0VF49 1180 aa26.62■■□□□ 1.85
HTATSF1-201ENST00000218364 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
HTATSF1-201ENST00000218364 F13A1P00488 732 aa26.61■■□□□ 1.85
HTATSF1-201ENST00000218364 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa26.61■■□□□ 1.85
HTATSF1-201ENST00000218364 DYNC1I1O14576 645 aa26.61■■□□□ 1.85
HTATSF1-201ENST00000218364 MTX1Q13505 466 aa26.6■■□□□ 1.85
HTATSF1-201ENST00000218364 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNB2Q92953 911 aa26.6■■□□□ 1.85
HTATSF1-201ENST00000218364 SMC3Q9UQE7 1217 aa26.6■■□□□ 1.85
HTATSF1-201ENST00000218364 HYPKQ9NX55 129 aa26.59■■□□□ 1.85
HTATSF1-201ENST00000218364 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
HTATSF1-201ENST00000218364 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.58■■□□□ 1.85
HTATSF1-201ENST00000218364 RBM10P98175 930 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
HTATSF1-201ENST00000218364 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.58■■□□□ 1.85
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