RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640577.1

SPIN3-242, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,436 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-242ENST00000640577 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 FAM20CQ8IXL6 584 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 OFCC1Q8IZS5 231 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 METTL4Q8N3J2 472 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 C16orf78Q8WTQ4 265 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 CYGBQ8WWM9 190 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 MSLNLQ96KJ4 702 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 C12orf66Q96MD2 445 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 PRAP1Q96NZ9 151 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 BTBD1Q9H0C5 482 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 CAAP1Q9H8G2 361 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 SIRT5Q9NXA8 310 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 CA5BQ9Y2D0 317 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 KNL1Q8NG31 2342 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 POM121BA6NF01 834 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 PRR19A6NJB7 356 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 EVPLLA8MZ36 301 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 RTCAO00442 366 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 AXIN1O15169 862 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 DNTTP04053 509 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 HPCAL1P37235 193 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 TAS2R50P59544 299 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 HBA1P69905 142 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 TFF2Q03403 129 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 C17orf64Q86WR6 236 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 MAL2Q969L2 176 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 FERD3LQ96RJ6 166 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 TRIM4Q9C037 500 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 CHST8Q9H2A9 424 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 REEP4Q9H6H4 257 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 LTB4R2Q9NPC1 389 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 GPATCH2Q9NW75 528 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 BTNL2Q9UIR0 455 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 CST1P01037 141 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 NTRK1P04629 796 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 FURINP09958 794 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 TEAD1P28347 426 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 CRYBA2P53672 197 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 CLDN2P57739 230 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 DMPKQ09013 629 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 ARHGAP19Q14CB8 494 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 VMACQ2NL98 169 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 FAM71E1Q6IPT2 247 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 STK32CQ86UX6 486 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 PLD3Q8IV08 490 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 SNX19Q92543 992 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 PHF12Q96QT6 1004 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 HAUS8Q9BT25 410 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 FGF22Q9HCT0 170 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 ATP6V1HQ9UI12 483 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 MOSPD1Q9UJG1 213 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 H0Y8X5 98 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 H3BNH8 94 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 PLPP1O14494 284 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 ALPLP05186 524 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 MYF6P23409 242 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 RPL5P46777 297 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 ARSFP54793 590 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 TPRG1LQ5T0D9 272 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 KRT80Q6KB66 452 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 MTSS1LQ765P7 747 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 HORMAD1Q86X24 394 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 ZFP90Q8TF47 636 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 F2RL3Q96RI0 385 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 APOOQ9BUR5 198 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 GRIP2Q9C0E4 1043 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 SMURF2Q9HAU4 748 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 PRDM8Q9NQV8 689 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 VNN3Q9NY84 501 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 DNAJB9Q9UBS3 223 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 ACSL5Q9ULC5 683 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 GPR89AB7ZAQ6 455 aa14.71□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 H6PDO95479 791 aa14.71□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 ZNF682O95780 498 aa14.71□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 GPR89BP0CG08 455 aa14.71□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 MVDP53602 400 aa14.71□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 CDH15P55291 814 aa14.71□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 C2orf80Q0P641 193 aa14.71□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 PDE7AQ13946 482 aa14.71□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 SPIDRQ14159 915 aa14.71□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 COX20Q5RI15 118 aa14.71□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SPIN3-242ENST00000640577 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms