RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC13A3Q8WWT9 602 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 ASB11Q8WXH4 323 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC138Q96M89 665 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 OR1F2PQ96R84 312 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC68Q9H2F9 335 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 USP27XA6NNY8 438 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC35G6P0C7Q6 338 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 TBPL1P62380 186 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC26A11Q86WA9 606 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 SPNS2Q8IVW8 549 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 POGLUT1Q8NBL1 392 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 OR5T3Q8NGG3 340 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 LANCL2Q9NS86 450 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 CTAGE9A4FU28 777 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 F7P08709 466 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 MPC1LP0DKB6 136 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 CD99P14209 185 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 PAMP19021 973 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 IL10P22301 178 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 CHRNB4P30926 498 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 GRK3P35626 688 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 CENPUQ71F23 418 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 GSTA5Q7RTV2 222 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 CILP2Q8IUL8 1156 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 MARVELD2Q8N4S9 558 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 GIMAP7Q8NHV1 300 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 ELP5Q8TE02 316 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 UCK2Q9BZX2 261 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNJ16Q9NPI9 418 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 SOX13Q9UN79 622 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF6Q9Y252 685 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 SCN2AQ99250 2005 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 FCHO1O14526 889 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 PRMT3O60678 531 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 FHP07954 510 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 TERF1P54274 439 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 MYBPHQ13203 477 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF470Q6ECI4 717 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 NEPROQ6NW34 567 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 CASC4Q6P4E1 433 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 C17orf64Q86WR6 236 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 RND1Q92730 232 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 CDK2AP1O14519 115 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 HS6ST1O60243 411 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 B4GALT2O60909 372 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 IGFBP2P18065 325 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 JAK1P23458 1154 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 HLCSP50747 726 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 MLF1P58340 268 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 HERC3Q15034 1050 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 TXLNBQ8N3L3 684 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D20Q96BZ9 403 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 TM4SF19Q96DZ7 209 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 TSGA10Q9BZW7 698 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 PCBD2Q9H0N5 130 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 SH2B3Q9UQQ2 575 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC22A7Q9Y694 548 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 GFYI3L273 518 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 OLR1P78380 273 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 MPP1Q00013 466 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 RPS6KA1Q15418 735 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 CES4AQ5XG92 561 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 C4orf22Q6V702 233 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF227Q86WZ6 799 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 SULF2Q8IWU5 870 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 LILRB4Q8NHJ6 448 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 PEX1O43933 1283 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 PDE9AO76083 593 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 SERPIND1P05546 499 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 CDH1P12830 882 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 TFEBP19484 476 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 CPNE9Q8IYJ1 553 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 NRGNQ92686 78 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNJ9Q92806 393 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 PTCHD1Q96NR3 888 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR21Q99679 349 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 DEFB126Q9BYW3 111 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM129AQ9BZQ8 928 aa25.62■■□□□ 1.69
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