RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 MPC1LP0DKB6 136 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 CCR7P32248 378 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 FOXL2P58012 376 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 HERVK_113P63132 956 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 LCN9Q8WX39 176 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM136AQ96C01 138 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 ERVK-6Q9BXR3 956 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 NPHS2Q9NP85 383 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC5A6Q9Y289 635 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 APCP25054 2843 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 CROCCQ5TZA2 2017 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 GSAPA4D1B5 854 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 CCT8L1PA6NM43 557 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 CDC7O00311 574 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 CTSBP07858 339 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 ARRB2P32121 409 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 OTX2P32243 289 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 ARFIP2P53365 341 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 MYBPC3Q14896 1274 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 TSNQ15631 228 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 ZIC1Q15915 447 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 CFAP157Q5JU67 520 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 SPDYAQ5MJ70 313 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 DCAF10Q5QP82 559 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF678Q5SXM1 525 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 TTC23LQ6PF05 361 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 GPSM1Q86YR5 675 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB43Q86YS6 212 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 OR52E1Q8NGJ3 308 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 ASZ1Q8WWH4 475 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 SERTAD3Q9UJW9 196 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 PCM1Q15154 2024 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD12Q6UB98 2062 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 E7EQ34 232 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC16A5O15375 505 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 GPC4O75487 556 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 DCTN3O75935 186 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 SLCO2B1O94956 709 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 PDHA2P29803 388 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 ACSBG2Q5FVE4 666 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 C1QL3Q5VWW1 255 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 HOMEZQ8IX15 550 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 PHC3Q8NDX5 983 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 GBP5Q96PP8 586 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 FERD3LQ96RJ6 166 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 XKR8Q9H6D3 395 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 COG4Q9H9E3 785 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 NUDT4Q9NZJ9 180 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 VTI1BQ9UEU0 232 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 FBN2P35556 2912 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKUB1A6NFN9 424 aa23.03■■□□□ 1.28
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CAPNS1-216ENST00000628306 RPL14P50914 215 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 SOX8P57073 446 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 SSPNQ14714 243 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 Q6ZS92 163 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 CUZD1Q86UP6 607 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 GALNT16Q8N428 558 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 FAR2Q96K12 515 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM237Q96Q45 408 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 ACTR10Q9NZ32 417 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 IKZF3Q9UKT9 509 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 OARD1Q9Y530 152 aa23.03■■□□□ 1.28
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CAPNS1-216ENST00000628306 C9J4A7 227 aa23.02■■□□□ 1.28
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CAPNS1-216ENST00000628306 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT33BQ14525 404 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 TGFBIQ15582 683 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 SBSNQ6UWP8 590 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 FRMD7Q6ZUT3 714 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 RFWD2Q8NHY2 731 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 CCT6BQ92526 530 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 C5orf34Q96MH7 638 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 CSAG2Q9Y5P2 127 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
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