RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627393.1

PCNP-208, Transcript of PEST proteolytic signal containing nuclear protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PCNP, Length 136 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNP-208ENST00000627393 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
PCNP-208ENST00000627393 PACSIN3Q9UKS6 424 aa3.06□□□□□ -1.92
PCNP-208ENST00000627393 FBXW2Q9UKT8 454 aa3.06□□□□□ -1.92
PCNP-208ENST00000627393 AP4E1Q9UPM8 1137 aa3.06□□□□□ -1.92
PCNP-208ENST00000627393 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PCNP-208ENST00000627393 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PCNP-208ENST00000627393 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
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PCNP-208ENST00000627393 POM121CA8CG34 1229 aa3.05□□□□□ -1.92
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PCNP-208ENST00000627393 ZNF165P49910 485 aa3.05□□□□□ -1.92
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PCNP-208ENST00000627393 SLC14A2Q15849 920 aa3.05□□□□□ -1.92
PCNP-208ENST00000627393 FAM189A2Q15884 450 aa3.05□□□□□ -1.92
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PCNP-208ENST00000627393 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa3.05□□□□□ -1.92
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PCNP-208ENST00000627393 FBF1Q8TES7 1133 aa3.05□□□□□ -1.92
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PCNP-208ENST00000627393 TIMP4Q99727 224 aa3.05□□□□□ -1.92
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PCNP-208ENST00000627393 ZWILCHQ9H900 591 aa3.05□□□□□ -1.92
PCNP-208ENST00000627393 VPS37BQ9H9H4 285 aa3.05□□□□□ -1.92
PCNP-208ENST00000627393 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PCNP-208ENST00000627393 SACM1LQ9NTJ5 587 aa3.05□□□□□ -1.92
PCNP-208ENST00000627393 DNAJC11Q9NVH1 559 aa3.05□□□□□ -1.92
PCNP-208ENST00000627393 ELOVL5Q9NYP7 299 aa3.05□□□□□ -1.92
PCNP-208ENST00000627393 SAMD15Q9P1V8 674 aa3.05□□□□□ -1.92
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