RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609454.5

ANKRD54-211, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ANKRD54, Length 825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-211ENST00000609454 AGTR2P50052 363 aa18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 CDKL1Q00532 357 aa18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 TSNQ15631 228 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 BTBD16Q32M84 506 aa18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 ABHD17BQ5VST6 288 aa18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 NXPE4Q6UWF7 544 aa18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 FAM180AQ6UWF9 173 aa18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 CEP97Q8IW35 865 aa18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 RBCK1Q9BYM8 510 aa18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 PLA2G3Q9NZ20 509 aa18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 ZFP69BQ9UJL9 534 aa18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 IKZF3Q9UKT9 509 aa18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 NBASA2RRP1 2371 aa18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 FANCGO15287 622 aa18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 CCDC166P0CW27 439 aa18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 GNAZP19086 355 aa18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 JAK1P23458 1154 aa18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 SPRP35270 261 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 AHRP35869 848 aa18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 GP5P40197 560 aa18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 TSFMP43897 325 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 PCOLCEQ15113 449 aa18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 NSDHLQ15738 373 aa18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 PPP1R3AQ16821 1122 aa18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 DEFB134Q4QY38 66 aa18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 RAPH1Q70E73 1250 aa18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 ZNF740Q8NDX6 193 aa18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 CATSPER1Q8NEC5 780 aa18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 ANKRD49Q8WVL7 239 aa18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 CCT6BQ92526 530 aa18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 SARGQ9BW04 601 aa18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 DERL2Q9GZP9 239 aa18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 CAB39LQ9H9S4 337 aa18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 WWOXQ9NZC7 414 aa18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 CLEC18AA5D8T8 446 aa18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 CELA2AP08217 269 aa18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 ITGAMP11215 1152 aa18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 SCTRP47872 440 aa18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 ZNF33BQ06732 778 aa18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 ABRAXAS2Q15018 415 aa18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 CLEC18BQ6UXF7 455 aa18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 LANCL3Q6ZV70 420 aa18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 PDSS2Q86YH6 399 aa18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 GPSM1Q86YR5 675 aa18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 KRT78Q8N1N4 520 aa18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 TCAIMQ8N3R3 496 aa18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 SPATA6LQ8N4H0 392 aa18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 PPM1NQ8N819 430 aa18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 CLEC18CQ8NCF0 446 aa18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 NT5CQ8TCD5 201 aa18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 SSC4DQ8WTU2 575 aa18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 MOCOSQ96EN8 888 aa18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 FAR2Q96K12 515 aa18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 OR1F2PQ96R84 312 aa18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 CAPS2Q9BXY5 557 aa18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 SMYD2Q9NRG4 433 aa18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 STMN3Q9NZ72 180 aa18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 ABI3Q9P2A4 366 aa18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 TRAV17A0A0B4J275 112 aa18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 A0A1W2PQ72 361 aa18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 CLGNO14967 610 aa18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 CBX6O95503 412 aa18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 F10P00742 488 aa18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 GP1BBP13224 206 aa18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 STX2P32856 288 aa18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 OR4D2P58180 307 aa18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 RAB8AP61006 207 aa18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 ATP6V0D1P61421 351 aa18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 REEP5Q00765 189 aa18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 CBLBQ13191 982 aa18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 SLMAPQ14BN4 828 aa18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 EXT1Q16394 746 aa18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 GRTP1Q5TC63 336 aa18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 ANKRD37Q7Z713 158 aa18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 SNX31Q8N9S9 440 aa18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 TTLQ8NG68 377 aa18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 OR5T3Q8NGG3 340 aa18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 GRHL3Q8TE85 626 aa18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 HAS2Q92819 552 aa18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 TBC1D20Q96BZ9 403 aa18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 LPAR4Q99677 370 aa18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54-211ENST00000609454 RBBP8Q99708 897 aa18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms