RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602762.5

UBE2E3-210, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2E3, Length 340 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-210ENST00000602762 MFSD4BQ5TF39 518 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2E3-210ENST00000602762 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
UBE2E3-210ENST00000602762 ZDHHC24Q6UX98 284 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2E3-210ENST00000602762 CTAGE6Q86UF2 777 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2E3-210ENST00000602762 SPATA6LQ8N4H0 392 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2E3-210ENST00000602762 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2E3-210ENST00000602762 TBC1D19Q8N5T2 526 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2E3-210ENST00000602762 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
UBE2E3-210ENST00000602762 PPP4R1Q8TF05 950 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2E3-210ENST00000602762 METTL21AQ8WXB1 218 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2E3-210ENST00000602762 TSPAN17Q96FV3 270 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2E3-210ENST00000602762 TSNARE1Q96NA8 513 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2E3-210ENST00000602762 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
UBE2E3-210ENST00000602762 CPNE1Q99829 537 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2E3-210ENST00000602762 EGFL8Q99944 293 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2E3-210ENST00000602762 AIF1LQ9BQI0 150 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2E3-210ENST00000602762 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2E3-210ENST00000602762 SLC29A3Q9BZD2 475 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2E3-210ENST00000602762 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
UBE2E3-210ENST00000602762 DERL2Q9GZP9 239 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2E3-210ENST00000602762 SPNS1Q9H2V7 528 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2E3-210ENST00000602762 EPS8L2Q9H6S3 715 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2E3-210ENST00000602762 CAB39LQ9H9S4 337 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2E3-210ENST00000602762 POPDC3Q9HBV1 291 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2E3-210ENST00000602762 RIC8BQ9NVN3 520 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2E3-210ENST00000602762 PLA2G3Q9NZ20 509 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2E3-210ENST00000602762 TXNDC16Q9P2K2 825 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2E3-210ENST00000602762 ZFP69BQ9UJL9 534 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2E3-210ENST00000602762 NTNG1Q9Y2I2 539 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2E3-210ENST00000602762 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
UBE2E3-210ENST00000602762 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2E3-210ENST00000602762 OARD1Q9Y530 152 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2E3-210ENST00000602762 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 BLACEA4D250 179 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 TAPBPO15533 448 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 CHST10O43529 356 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 WDR47O94967 919 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 B3GALT4O96024 378 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 CYC1P08574 325 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 GSTA2P09210 222 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 SMIM10L1P0DMW3 83 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 ITGAMP11215 1152 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 ALOX12P18054 663 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 IL10P22301 178 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 SOX11P35716 441 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 AHRP35869 848 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 HNF4AP41235 474 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 GDF5P43026 501 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 HNMTP50135 292 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 OLR1P78380 273 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 REEP5Q00765 189 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 SLC7A5Q01650 507 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 CAV1Q03135 178 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 CDC16Q13042 620 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 HERC3Q15034 1050 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 TLR1Q15399 786 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 NR6A1Q15406 480 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 DEFB134Q4QY38 66 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 GRTP1Q5TC63 336 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 LANCL3Q6ZV70 420 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 FRA10AC1Q70Z53 315 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 ANKRD37Q7Z713 158 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 TMPRSS11BQ86T26 416 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 CCDC25Q86WR0 208 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 GPSM1Q86YR5 675 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 CTAGE3PQ8IX95 158 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 SIRT6Q8N6T7 355 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 PPM1NQ8N819 430 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 ANKRD53Q8N9V6 530 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 PLPP5Q8NEB5 264 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 OR5T3Q8NGG3 340 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 PRR7Q8TB68 274 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 NT5CQ8TCD5 201 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 FBXO25Q8TCJ0 367 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 TBC1D20Q96BZ9 403 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 RHBDF1Q96CC6 855 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 PEX11GQ96HA9 241 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 SMIM10Q96HG1 83 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 CNDP1Q96KN2 507 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 GPR22Q99680 433 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 RBBP8Q99708 897 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 TUBB6Q9BUF5 446 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 RAB17Q9H0T7 212 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 PELI2Q9HAT8 420 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 MED13Q9UHV7 2174 aa7.38□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 DYTNA2CJ06 578 aa7.38□□□□□ -1.23
UBE2E3-210ENST00000602762 ANKUB1A6NFN9 424 aa7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.8 ms