RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599560.5

NUP62-216, Transcript of nucleoporin 62, human

TSL 2

Gene NUP62, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUP62-216	ENST00000599560	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560		A8MUA0	341 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	B3GALT4	O96024	378 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	SERPING1	P05155	500 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	APOA4	P06727	396 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	MARCKSL1	P49006	195 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	BTG2	P78543	158 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	PLGLB1	Q02325	96 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	HYAL2	Q12891	473 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	TFDP2	Q14188	446 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	H2AFV	Q71UI9	128 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	KCT2	Q8NC54	265 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	PERP	Q96FX8	193 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF778	Q96MU6	729 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560		H7C0C1	242 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	SMPD2	O60906	423 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	WDR1	O75083	606 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	PHF2	O75151	1096 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	ITGA10	O75578	1167 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	PEX19	P40855	299 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	ATP5O	P48047	213 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	OLR1	P78380	273 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	NDUFA9	Q16795	377 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	XKR6	Q5GH73	641 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	LRRC38	Q5VT99	294 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	PAOX	Q6QHF9	649 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	CYP4X1	Q8N118	509 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	MED12	Q93074	2177 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	ROS1	P08922	2347 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	HACD1	B0YJ81	288 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560		H7BY64	318 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	CDK2AP1	O14519	115 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	AQP7	O14520	342 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	FCHO1	O14526	889 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	SIAH2	O43255	324 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	ATP6AP2	O75787	350 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	TUBB4A	P04350	444 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF136	P52737	540 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	MPP1	Q00013	466 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	TTC23L	Q6PF05	361 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	ADCK2	Q7Z695	626 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	TMEM156	Q8N614	296 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	SMPDL3A	Q92484	453 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	11.24	□□□□□ -0.61	6e-8	■□□□□ 10
NUP62-216	ENST00000599560		A0A1B0GTH6	734 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	TXNDC9	O14530	226 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61

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