RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, humanhuman

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4-208ENST00000597315 TMEM79Q9BSE2 394 aa25.53■■□□□ 1.68
BRD4-208ENST00000597315 FUT8Q9BYC5 575 aa25.53■■□□□ 1.68
BRD4-208ENST00000597315 SPNS1Q9H2V7 528 aa25.53■■□□□ 1.68
BRD4-208ENST00000597315 MLXIPLQ9NP71 852 aa25.53■■□□□ 1.68
BRD4-208ENST00000597315 HCN3Q9P1Z3 774 aa25.53■■□□□ 1.68
BRD4-208ENST00000597315 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa25.53■■□□□ 1.68
BRD4-208ENST00000597315 A0A096LPK6 155 aa25.52■■□□□ 1.68
BRD4-208ENST00000597315 TAPBPO15533 448 aa25.52■■□□□ 1.68
BRD4-208ENST00000597315 KERAO60938 352 aa25.52■■□□□ 1.68
BRD4-208ENST00000597315 KLHL18O94889 574 aa25.52■■□□□ 1.68
BRD4-208ENST00000597315 PDGFAP04085 211 aa25.52■■□□□ 1.68
BRD4-208ENST00000597315 PDK4Q16654 411 aa25.52■■□□□ 1.68
BRD4-208ENST00000597315 FBXO48Q5FWF7 155 aa25.52■■□□□ 1.68
BRD4-208ENST00000597315 ATG9BQ674R7 924 aa25.52■■□□□ 1.68
BRD4-208ENST00000597315 FAAH2Q6GMR7 532 aa25.52■■□□□ 1.68
BRD4-208ENST00000597315 PRSS41Q7RTY9 318 aa25.52■■□□□ 1.68
BRD4-208ENST00000597315 ISCA2Q86U28 154 aa25.52■■□□□ 1.68
BRD4-208ENST00000597315 LAPTM4BQ86VI4 370 aa25.52■■□□□ 1.68
BRD4-208ENST00000597315 OR11G2Q8NGC1 345 aa25.52■■□□□ 1.68
BRD4-208ENST00000597315 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
BRD4-208ENST00000597315 NT5CQ8TCD5 201 aa25.52■■□□□ 1.68
BRD4-208ENST00000597315 CCT6BQ92526 530 aa25.52■■□□□ 1.68
BRD4-208ENST00000597315 ESAMQ96AP7 390 aa25.52■■□□□ 1.68
BRD4-208ENST00000597315 PAFAH2Q99487 392 aa25.52■■□□□ 1.68
BRD4-208ENST00000597315 VPS11Q9H270 941 aa25.52■■□□□ 1.68
BRD4-208ENST00000597315 IGSF5Q9NSI5 407 aa25.52■■□□□ 1.68
BRD4-208ENST00000597315 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
BRD4-208ENST00000597315 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
BRD4-208ENST00000597315 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 MED13Q9UHV7 2174 aa25.51■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 CCDC189A1A4V9 331 aa25.51■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 RDH16O75452 317 aa25.51■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 ALOX12P18054 663 aa25.51■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 GMPRP36959 345 aa25.51■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 XCR1P46094 333 aa25.51■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 DLG1Q12959 904 aa25.51■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP25.51■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 MINDY4Q4G0A6 757 aa25.51■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa25.51■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa25.51■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 PARP9Q8IXQ6 854 aa25.51■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 TM9SF4Q92544 642 aa25.51■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 MOCOSQ96EN8 888 aa25.51■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 TRIM4Q9C037 500 aa25.51■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 C5AR2Q9P296 337 aa25.51■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa25.5■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 BMP10O95393 424 aa25.5■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 HPP00738 406 aa25.5■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 CNTFP26441 200 aa25.5■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 GSTM2P28161 218 aa25.5■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 HNF4AP41235 474 aa25.5■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 GLRBP48167 497 aa25.5■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 IRF9Q00978 393 aa25.5■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 TLE1Q04724 770 aa25.5■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 ACAP2Q15057 778 aa25.5■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 DEFB134Q4QY38 66 aa25.5■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 XKR6Q5GH73 641 aa25.5■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 LGSNQ5TDP6 509 aa25.5■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa25.5■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 ANKRD53Q8N9V6 530 aa25.5■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 RHEBL1Q8TAI7 183 aa25.5■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 C8orf44Q96CB5 159 aa25.5■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 CD244Q9BZW8 370 aa25.5■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 OPTCQ9UBM4 332 aa25.5■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa25.49■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 ANKDD1BA6NHY2 528 aa25.49■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 UBXN8O00124 270 aa25.49■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 MASP2O00187 686 aa25.49■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 ALOX12BO75342 701 aa25.49■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 KLHL2O95198 593 aa25.49■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 GFAPP14136 432 aa25.49■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 HPDP32754 393 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 SOX8P57073 446 aa25.49■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 PAGE2BQ5JRK9 111 aa25.49■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 COLEC12Q5KU26 742 aa25.49■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa25.49■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 NDUFAF7Q7L592 441 aa25.49■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 ATOH8Q96SQ7 321 aa25.49■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 EPN3Q9H201 632 aa25.49■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 EHD1Q9H4M9 534 aa25.49■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 ZNF160Q9HCG1 818 aa25.49■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa25.49■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 HMX2A2RU54 273 aa25.48■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 ZNF860A6NHJ4 632 aa25.48■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 UQCRHP07919 91 aa25.48■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 SERPINA6P08185 405 aa25.48■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 C8orf89P0DMQ9 161 aa25.48■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 IL10P22301 178 aa25.48■■□□□ 1.67
BRD4-208ENST00000597315 KCNC1P48547 511 aa25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms