RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGEB17A8MXT2 336 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJB6O75190 326 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 CDH1P12830 882 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 ABOP16442 354 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A25Q6KCM7 469 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 AGTRAPQ6RW13 159 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 C17orf64Q86WR6 236 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 LGI4Q8N135 537 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 KIF2BQ8N4N8 673 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 GPAMQ9HCL2 828 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 COMMD10Q9Y6G5 202 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 DCHS2Q6V1P9 2916 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 SCN2AQ99250 2005 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGEB16A2A368 324 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 SDR42E2A6NKP2 422 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA8MH3BSY2 632 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 HAUS5O94927 633 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC35G6P0C7Q6 338 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4D2P58180 307 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 TAS2R50P59544 299 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 NAE1Q13564 534 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 RNFT1Q5M7Z0 435 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 C3P1Q6ZMU1 363 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 FGD2Q7Z6J4 655 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 DOLPP1Q86YN1 238 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 GHDCQ8N2G8 530 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 HORMAD2Q8N7B1 307 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 MFSD9Q8NBP5 474 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 ELP5Q8TE02 316 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 SERPINB12Q96P63 405 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXO5Q9UKT4 447 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 NDC80O14777 642 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 CEP104O60308 925 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A12O75746 678 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 MLNP12872 115 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 IL10P22301 178 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 CXCR5P32302 372 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 MAPKAPK3Q16644 382 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 TTC27Q6P3X3 843 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF227Q86WZ6 799 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 CEP97Q8IW35 865 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF740Q8NDX6 193 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 C14orf79Q96F83 325 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 NDNQ99608 321 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 SGPP1Q9BX95 441 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM129AQ9BZQ8 928 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAM10O14672 748 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 NME2P1O60361 137 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 B3GALT4O96024 378 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT14P02533 472 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 FHP07954 510 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF24P17028 368 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 NME2P22392 152 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 GRK3P35626 688 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 OLR1P78380 273 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 HERC3Q15034 1050 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 LCTLQ6UWM7 567 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D20Q96BZ9 403 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 DMRTA2Q96SC8 542 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 HOMER3Q9NSC5 361 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 ASB1Q9Y576 335 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 NDUFS4O43181 175 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 C8GP07360 202 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 NPPBP16860 134 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 CDC25BP30305 580 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 TESK1Q15569 626 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 PHKG1Q16816 387 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 DEFB134Q4QY38 66 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 GAS2L3Q86XJ1 694 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 LMNTD2Q8IXW0 634 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 ACBD4Q8NC06 268 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 MCUQ8NE86 351 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 SPOCK3Q9BQ16 436 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 PARVBQ9HBI1 364 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 LZTFL1Q9NQ48 299 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 E9PLN8 166 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 CHST10O43529 356 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 CCND1P24385 295 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 PTGER1P34995 402 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGEA3P43357 314 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 SP140Q13342 867 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms